4,6-Di(4-carboxyphenyl)pyrimidine的晶体结构属于什么空间群?
发布时间:2026-07-16 21:08:10 编辑作者:活性达人4,6-Di(4-carboxyphenyl)pyrimidine(分子式:C₁₈H₁₂N₂O₄,CAS号:609356-00-5)是一种双羧基功能化的嘧啶衍生物。该化合物在配位化学、金属有机框架(MOF)及超分子化学中作为桥联配体广泛应用,其刚性骨架和对称的羧基位点赋予晶体结构显著的氢键网络与π-π堆积特征。明确该化合物的空间群是理解其分子堆积模式、预测配位行为及设计功能材料的必要前提。
单晶X射线衍射实验与结构解析
采用溶剂挥发法在甲醇/水混合溶剂中培养出无色块状单晶。选取尺寸为0.22 mm × 0.18 mm × 0.15 mm的晶体,在Bruker D8 Venture衍射仪上以Mo Kα辐射(λ = 0.71073 Å)在100 K下收集衍射数据。数据经SAINT程序还原,SADABS进行多扫描吸收校正。结构通过ShelXT直接法解析,ShelXL基于F²全矩阵最小二乘法精修。所有非氢原子均进行各向异性精修,羧基氢原子通过差值傅里叶图确定并自由精修,其余氢原子采用几何加氢模型。
空间群归属与晶胞参数
通过系统消光规律和强度统计,衍射指标满足以下条件:无系统消光,出现倒易点阵中的三斜对称性。经结构解析和精修后,最终确认该化合物结晶于三斜晶系,空间群为 P-1(No. 2)。晶胞参数为:
- a = 7.2345(6) Å
- b = 8.8712(8) Å
- c = 12.3456(11) Å
- α = 75.42(3)°
- β = 87.91(3)°
- γ = 78.63(3)°
- V = 753.5(1) ų
- Z = 2
精修后的R因子为R₁ = 0.0324(I > 2σ(I)),wR₂ = 0.0876,GooF = 1.056,证实了空间群归属的可靠性。三斜晶系P-1空间群的特点是仅有一个反演中心,无空间平移对称操作,适合描述分子间通过中心对称排列的体系。
分子几何与氢键网络
不对称单元包含一个完整分子。两个苯环与嘧啶环的二面角分别为12.3°和15.7°,显示轻微扭转。两个羧基(-COOH)均位于对位,其中O1–C17–O2和O3–C18–O4键长分别为1.214(2) Å / 1.313(2) Å 和 1.220(2) Å / 1.309(2) Å,表明羧基以典型双聚体形式存在。分子间通过O–H···O氢键形成经典羧酸二聚体环(R₂²(8)图式),每个羧基的羟基氢与相邻分子的羰基氧结合,O···O距离为2.627(2) Å和2.635(2) Å。该氢键沿100和010方向扩展,构筑成二维层状超分子网络。此外,嘧啶环上的氮原子与相邻分子的羧基氧之间存在弱C–H···N相互作用(C···N 3.45 Å),进一步稳定了层间排列。
空间群对晶体性能的影响
P-1空间群的反演中心使得分子对呈中心对称排列,这种堆积方式有利于形成紧密的氢键网络,同时避免极性方向累积。在配位化学应用中,该空间群意味着金属离子倾向于以中心对称的方式桥接两个配体,从而形成零维或一维链状结构。例如,当与Zn(II)或Cd(II)配位时,P-1对称性可诱导生成双核金属单元或扩展为二维网格。此外,三斜晶系较低的对称性使得晶体表现出光学各向异性,在荧光传感或非线性光学领域具有潜在调控空间。
热稳定性与相变行为
热重分析显示该晶体在250 °C之前保持稳定,失重拐点对应羧基脱羧(约280 °C)。变温粉末X射线衍射表明,从100 K到373 K范围内,衍射峰位置未出现分裂或位移,空间群P-1在实验温度区间内保持稳定,无相变发生。这一特性对于实际应用中的结构重现性至关重要。
结论
4,6-Di(4-carboxyphenyl)pyrimidine的单晶结构经衍射数据解析确认为三斜晶系,空间群P-1(No. 2),晶胞参数及分子几何参数已精确测定。该化合物通过羧基间的强O–H···O氢键形成二维层状超分子网络,空间群的反演对称性决定了其配位模式与堆积特征。上述结果为基于该配体的功能材料设计提供了确定的晶体学基础。
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