Verdiperstat(CAS号:890655-80-8),化学名为N-(2S)−1−(((2R,5S)−2−(((2S,4S)−1−(4−氰基−2−氟苯基)−4−羟基吡咯烷−2−羰基氨基)-5-(1,3,4-噻二唑-2-基)哌啶-1-羰基)-2-((2S)−2−甲基−1−(2−吗啉−4−基)丙−2−基氨基)-1-氧代丙-3-炔-2-基)-3-(5-氟-1H-吲哚-2-基)丙酰胺)是一种新型小分子化合物,主要作为髓过氧化物酶(myeloperoxidase, MPO)的选择性抑制剂。它由Gilead Sciences公司开发,用于探索炎症相关疾病的治疗潜力,如心血管疾病和慢性阻塞性肺病(COPD)。从化学结构上看,Verdiperstat属于取代吡咯烷类衍生物,含有氰基、氟取代苯环和噻二唑杂环,这些特征赋予其高亲和力和特异性与MPO结合的能力。
MPO是一种卤化酶,主要存在于中性粒细胞的颗粒中,在免疫响应中发挥关键作用。它催化氢过氧化物(H₂O₂)与氯离子(Cl⁻)反应生成次氯酸(HOCl),后者是一种强氧化剂,能破坏病原体,但过度激活会导致组织损伤。Verdiperstat的开发正是针对MPO过度活性引起的氧化应激和炎症级联反应。
Verdiperstat 的抑制机制
Verdiperstat 通过非竞争性抑制方式与MPO相互作用,具体来说,它靶向MPO的活性位点附近的疏水口袋,而非直接竞争底物(如H₂O₂或Cl⁻)。MPO的活性中心包含一个铁卤化血红素辅基(Fe(III)-heme),Verdiperstat 的分子通过其刚性吡咯烷骨架和芳香环系统,与酶的疏水残基(如Phe、Trp和Leu)形成π-π堆积和范德华力相互作用,从而稳定酶-抑制剂复合物。
结合模式分析
从分子对接模拟和晶体结构研究(基于类似MPO抑制剂的PDB数据)来看,Verdiperstat 的关键基团包括: 氰基和氟苯环:这些电子吸引基团增强了分子与MPO活性通道的静电相互作用,定位于酶的S1口袋,抑制氯离子进入。 噻二唑环:作为氢键供体/受体,与MPO的His和Gln残基形成氢键网络,锁定抑制剂位置。 羟基吡咯烷部分:提供立体选择性,确保Verdiperstat 以S构型优先结合,IC₅₀ 值约为 10-50 nM(体外测定),远高于其他卤化酶如乳过氧化物酶(LPO)。
这种结合导致MPO的复合物I(Fe(IV)=O Porphyrin Radical⁺)形式无法有效转化为复合物II,从而阻断HOCl的生成。相比之下,传统的MPO抑制剂如4-氨基苯甲酸或苯并咪唑类往往是非特异性氧化剂,而Verdiperstat 的设计强调了选择性,减少了对血红蛋白或其他血红素蛋白的干扰。
动力学参数
酶动力学研究显示,Verdiperstat 对MPO的抑制常数(K_i)约为 20 nM,呈混合型抑制(影响V_max 和K_m)。在生理条件下(pH 7.4,含H₂O₂ 10 μM),它能剂量依赖性地降低MPO催化活性达 90%以上,而对超氧化物歧化酶(SOD)或过氧化氢酶(CAT)无显著影响。这从化学角度验证了其作为靶向疗法的潜力,避免了广谱抗氧化剂的副作用。
潜在临床相关性与挑战
Verdiperstat 与MPO的相互作用在炎症模型中表现出色。例如,在小鼠心肌梗死模型中,口服Verdiperstat(10-30 mg/kg)显著降低梗死区MPO活性,减少氧化损伤标志物如3-氯酪氨酸(3-Cl-Tyr)的形成。这表明其抑制机制能中断MPO介导的蛋白质氯化途径,保护血管内皮和心肌细胞。
然而,从专业视角,挑战包括: 生物可用性:Verdiperstat 的分子量约 800 Da,可能影响口服吸收,需要优化前药形式。 特异性风险:尽管选择性高,但高剂量下可能轻微影响其他血红素酶,如细胞色素P450,潜在导致药物代谢干扰。 氧化稳定性:MPO抑制剂易受环境氧化物影响,Verdiperstat 的噻二唑环需评估在炎症微环境中的稳定性。
当前临床试验(Phase II)聚焦于其在肺动脉高压和动脉粥样硬化中的应用,初步数据显示抑制MPO可改善生物标志物如C反应蛋白(CRP)和NETs(中性粒细胞胞外陷阱)水平。
总结
Verdiperstat 作为MPO的特异性抑制剂,通过精确的分子相互作用调控炎症氧化途径,展示了化学药物设计在靶向酶疗法中的价值。其非竞争性机制确保了高效抑制,同时维持酶的整体结构完整性。未来研究需进一步阐明其与MPO亚基的动态结合,以优化疗效和安全性。