N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺

• 常用名: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺
• 英文名: TMP269
• CAS号: 1314890-29-3
• 分子量: 514.519
• 密度: 1.3±0.1 g/cm3
• 沸点: N/A
• 分子式: C₂₅H₂₁F₃N₄O₃S
• 熔点: N/A
• 闪点: N/A

用途

TMP269 是一种有效的,选择性的脱乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂,能够抑制 HDAC 4/HDAC 5/HDAC 7/HDAC 9,IC50 值分别为 157 nM,97 nM,43 nM 和 23 nM。

作用

体外活性：TMP269对10μM的人CD4 + T细胞的线粒体活性和/或活力没有影响，可用作鉴定IIa类HDAC酶的内源底物的工具。 在IEC-18肠上皮细胞中，TMP269阻止细胞周期进程，DNA合成和响应G蛋白偶联受体/ PKD1激活诱导的增殖。 与HDAC4敲低一样，TMP269显着增强由CFZ诱导的MM细胞系中的细胞毒性，上调ATF4和CHOP并诱导细胞凋亡。 TMP269在MM细胞系中没有高度乙酰化组蛋白H3K9或α-微管蛋白，证实它对I类或IIb类HDAC没有抑制作用。 以剂量依赖的方式，TPM269诱导的细胞毒性与caspase-8，-9，-3和PARP的裂解相关，与细胞凋亡一致。

名称

本表展示该化学物质的中文名称、英文系统名、各类中文与英文别名信息。

• 中文名: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺
• 英文名: N-{[4-(4-Phenyl-1,3-thiazol-2-yl)tetrahydro-2H-pyran-4-yl]methyl} -3-[5-(trifluoromethyl)-1,2,4-oxadiazol-3-yl]benzamide

生物活性

本表记录该化合物相关生物活性、作用靶点、活性说明与生物实验相关数据。

• 描述: TMP269 是一种有效的,选择性的脱乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂,能够抑制 HDAC 4/HDAC 5/HDAC 7/HDAC 9,IC50 值分别为 157 nM,97 nM,43 nM 和 23 nM。
• 相关类别:
  研究领域 >> 癌症
• 靶点实验:

  HDAC9:23 nM (IC50)

  HDAC7:43 nM (IC50)

  HDAC5:97 nM (IC50)

  HDAC4:157 nM (IC50)

  HDAC8:42000 nM (IC50)

  HDAC6:82000 nM (IC50)

• 体外研究: TMP269对10μM的人CD4 + T细胞的线粒体活性和/或活力没有影响,可用作鉴定IIa类HDAC酶的内源底物的工具[1]。在IEC-18肠上皮细胞中,TMP269阻止细胞周期进程,DNA合成和响应G蛋白偶联受体/ PKD1激活诱导的增殖[2]。与HDAC4敲低一样,TMP269显着增强由CFZ诱导的MM细胞系中的细胞毒性,上调ATF4和CHOP并诱导细胞凋亡。 TMP269在MM细胞系中没有高度乙酰化组蛋白H3K9或α-微管蛋白,证实它对I类或IIb类HDAC没有抑制作用。以剂量依赖的方式,TPM269诱导的细胞毒性与caspase-8,-9,-3和PARP的切割相关,与细胞凋亡一致[3]。
• 激酶实验: 剂量 - 反应研究在三倍稀释系列中进行，反应混合物中最大最终化合物浓度为100μM。所有测定均基于与上述HDAC9测定相同的原理：HDAC对荧光肽底物上的乙酰化或三氟乙酰化赖氨酸残基的脱乙酰化。 HDAC1，HDAC2，HDAC3，HDAC6，HDAC10和HDAC11使用基于p53的残基379-382（Arg-His-Lys-Lys（Ac））的底物。对于HDAC8，使用基于p53（Arg-His-Lys（Ac）-Lys（Ac））的残基379-382的二乙酰化肽底物。 HDAC4，HDAC5，HDAC7和HDAC9测定使用IIa类HDAC特异性荧光底物（Boc-Lys（三氟乙酰基）-AMC）。用含有1％DMSO终浓度的测定缓冲液（50mM Tris-HCl，pH 8.0,137mM NaCl，2.7mM KCl，1mM MgCl 2,1mg / mL BSA）中的50μMHDAC底物进行所有反应;在30℃下孵育2小时;并用曲古抑菌素A和胰蛋白酶开发。
• 细胞实验: 根据制造商的说明书（RosetteSep Human CD4 + T细胞富集试剂盒）通过阴性选择从全血中分离人CD4 + T细胞，重悬于T细胞培养基（10％FBS，2mM L-谷氨酰胺，1mM丙酮酸盐， 10mM HEPES，10U / 10mg青霉素/链霉素，0.5％DMSO的RPMI溶液）并以50,000个细胞/孔接种IL-2（10BRMP单位/ mL）和100,000个人T-扩增剂Dynabeads 72小时。根据制造商的说明书（细胞增殖测定试剂盒I（MTT））进行线粒体功能或细胞活力的测定，并表示为对照（无抑制剂）孔的百分比。
• 参考文献:

  [1]. Lobera M, et al. Selective class IIa histone deacetylase inhibition via a nonchelating zinc-binding group. Nat Chem Biol. 2013 May;9(5):319-25.

  [2]. Sinnett-Smith J, et al. Protein kinase D1 mediates class IIa histone deacetylase phosphorylation and nuclear extrusion in intestinal epithelial cells: role in mitogenic signaling. Am J Physiol Cell Physiol. 2014 May 15;306(10):C961-71.

  [3]. Kikuchi S, et al. Class IIa HDAC inhibition enhances ER stress-mediated cell death in multiple myeloma. Leukemia. 2015 Sep;29(9):1918-1927.

物理化学性质

本表包含该物质理化参数，如熔点、沸点、密度、溶解度、旋光性等理化指标，无数据项标记为N/A。

• 密度: 1.3±0.1 g/cm3
• 分子式: C₂₅H₂₁F₃N₄O₃S
• 分子量: 514.519
• 精确质量: 514.128662
• PSA: 121.87000
• LogP: 5.81
• InChIKey: HORXBWNTEDOVKN-UHFFFAOYSA-N
• SMILES: O=C(NCC1(c2nc(-c3ccccc3)cs2)CCOCC1)c1cccc(-c2noc(C(F)(F)F)n2)c1
• 外观性状: white solid
• 折射率: 1.574
• 储存条件: -20℃

靶点实验

查看更多实验

本表记录该化合物靶点、体外体内实验、生物测定实验相关实验数据。

实验名称：Drug screen in LFS_MB_P medulloblastoma cells to determine synergistic drug combinati... 来源：25008 靶标：N/A External Id：DKFZ_drug_screen_chromothripsis_LFS_MB_P

实验名称：Inhibition of HDAC4 (unknown origin) using fluorogenic substrate as substrate assesse... 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 4 External Id：CHEMBL4252630

实验名称：NCATS Kinetic Aqueous Solubility Profiling 来源：NCGC 靶标：N/A External Id：ADME-solubility1

实验名称：Inhibition of HDAC4 (unknown origin) using fluorogenic substrate as substrate assesse... 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 4 External Id：CHEMBL4252629

实验名称：Primary qHTS assay for small molecule inhibitors of Inositol hexaphosphate kinase 1 (... 来源：NCGC External Id：IP6K1-p1

实验名称：Drug screen in ICB984 medulloblastoma cells to determine synergistic drug combination... 来源：25008 靶标：N/A External Id：DKFZ_drug_screen_chromothripsis_ICB984_MB

实验名称：Drug screen in HDN33 neuroblastoma cells to determine synergistic drug combinations t... 来源：25008 靶标：N/A External Id：DKFZ_drug_screen_chromothripsis_HDN33

实验名称：Inhibition of HDAC4 (unknown origin) using fluorogenic substrate as substrate assesse... 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 4 External Id：CHEMBL4252626

实验名称：Inhibition of HDAC4 (unknown origin) using fluorogenic substrate as substrate assesse... 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 4 External Id：CHEMBL4252625

实验名称：Human histone deacetylase 5 (3.5.1.- Histone deacetylases (HDACs)) 来源：IUPHAR-DB 靶标：histone deacetylase 5 (3.5.1.- Histone deacetylases (HDACs)) [Homo sapiens] External Id：2660_Human

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英文别名

本表罗列该化合物全部英文别名、系统命名、CAS别名等英文名称集合。

• N-{[4-(4-Phenyl-1,3-thiazol-2-yl)tetrahydro-2H-pyran-4-yl]methyl}-3-[5-(trifluoromethyl)-1,2,4-oxadiazol-3-yl]benzamide
• TMP269

常见问题

本部分为该化合物相关常见问答，包含基础参数、性状、储存条件等高频咨询问题与对应答案。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺的LogP（油水分配系数）是多少？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺LogP（油水分配系数）为5.81。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺的SMILES表达式是什么？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺SMILES表达式为O=C(NCC1(c2nc(-c3ccccc3)cs2)CCOCC1)c1cccc(-c2noc(C(F)(F)F)n2)c1。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺的分子量是多少？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺分子量为514.519。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺有哪些英文别名？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺英文别名有：N-{[4-(4-Phenyl-1,3-thiazol-2-yl)tetrahydro-2H-pyran-4-yl]methyl}-3-[5-(trifluoromethyl)-1,2,4-oxadiazol-3-yl]benzamide、TMP269。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺的极性表面积PSA是多少？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺极性表面积PSA为121.87000。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺的InChIKey是什么？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺InChIKey为HORXBWNTEDOVKN-UHFFFAOYSA-N。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺的英文名称是什么？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺英文名称为N-{[4-(4-Phenyl-1,3-thiazol-2-yl)tetrahydro-2H-pyran-4-yl]methyl} -3-[5-(trifluoromethyl)-1,2,4-oxadiazol-3-yl]benzamide。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺的CAS号是多少？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺CAS号为1314890-29-3。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺的储存条件是什么？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺储存条件：-20℃。

Q: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺的分子式是什么？

A: N-[[四氢-4-(4-苯基-2-噻唑基)-2H-吡喃-4-基]甲基]-3-[5-(三氟甲基)-1,2,4-恶二唑-3-基]苯甲酰胺分子式为C25H21F3N4O3S。

生产厂家

本表列出该化合物相关生产厂商、供应商信息，包含厂家名称、产品供应相关参考信息。

上海阿拉丁生化科技股份有限公司

长沙福臻生物科技有限公司

陕西萃康医药科技有限公司

上海化源世纪贸易有限公司