Pseudothymidine

Pseudothymidine 是胸苷的 C-核苷 (C-nucleosid) 类似物。

信号通路 >> 细胞周期/DNA损伤 >> 核苷抗代谢药/类似物

研究领域 >> 感染

假胸苷是胸苷的C-核苷类似物[1]。计算的ΔΔG°50/mod为-0.5kcal/mol,ΔTm/ mod为0.82℃。对于含有9个dA-T /ψT对的双链体,ΔTm/ mod为-0.9℃,ΔΔG°50/mod为+ 1.1kcal/mol。含有12个连续dA-T /ΨT碱基对的双链体的修饰产生ΔTm/ mod为-0.9℃,ΔΔG°50/mod为+ 2.1kcal/mol [2]。

用含有多达12个连续dA残基的模板进行热DNA双链变性研究，所述dA残基与其含有连续T或假胸苷（ψT）残基的补体模板配对。实验在含有模板及其互补物（每种1.5μM）的缓冲液（45mM NaCl，45mM柠檬酸钠，pH 8.1，最终体积1.5mL）中进行。在25.0至90.0℃的范围内监测吸光度（260nm），温度变化为0.5℃/ min，进行五个加热循环。丢弃初始加热循环，并通过平均剩余四个循环的温度来确定Tm。通过从含有C-糖苷（包括假胸腺嘧啶核苷）的双链体的Tm中减去含有标准碱基的双链体的Tm来计算相似双链体之间的ΔTm[2]。

[1]. S Lutz, et al. An in vitro screening technique for DNA polymerases that can incorporate modified nucleotides. Pseudo-thymidine as a substrate for thermostable polymerases. Nucleic Acids Res. 1999 Jul 1; 27(13): 2792-2798.

[2]. Havemann SA, et al. Incorporation of multiple sequential pseudothymidines by DNA polymerases and their impact on DNA duplex structure. Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2008 Mar;27(3):261-78.

阿扎胞苷 | 5-溴-2'-脱氧尿苷 | 盐酸呋咯地辛 | 5-氟-2'-脱氧脲核苷 | 雷替曲塞 | 曲氟尿苷 | 阿糖腺苷 | 盐酸Tipiracil | 克罗拉滨 | 去氧氟尿苷 | 奈拉滨 | 8-氮鸟嘌呤 | 氟环戊烯基胞嘧啶 | 替加氟 | LY2334737