Tubastatin A

• 常用名: Tubastatin A
• 英文名: Tubastatin A
• CAS号: 1252003-15-8
• 分子量: 371.861
• 密度: N/A
• 沸点: N/A
• 分子式: C₂₀H₂₁N₃O₂
• 熔点: N/A
• 闪点: N/A

Tubastatin A用途

Tubastatin A 是一种有效的,选择性的 HDAC6 抑制剂,IC50 值为 15 nM, 对其选择性是对 HDAC8 的 57 倍多,是其他同工酶的 1000 多倍。

Tubastatin A名称

本表展示该化学物质的中文名称、英文系统名、各类中文与英文别名信息。

• 中文名: Tubastatin A
• 英文名: N-Hydroxy-4-[(2-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-5H-pyrido[4,3-b]indol-5 -yl)methyl]benzamide

Tubastatin A生物活性

本表记录该化合物相关生物活性、作用靶点、活性说明与生物实验相关数据。

• 描述: Tubastatin A 是一种有效的,选择性的 HDAC6 抑制剂,IC50 值为 15 nM, 对其选择性是对 HDAC8 的 57 倍多,是其他同工酶的 1000 多倍。
• 相关类别:
  信号通路 >> 自噬 >> 自噬
  研究领域 >> 癌症
• 靶点实验:

  HDAC6:15 nM (IC50)

  HDAC8:854 nM (IC50)

  HDAC1:16400 nM (IC50)

• 体外研究: Tubastatin A对所有11种HDAC同种型基本上具有选择性,并且对除HDAC8之外的所有同种型保持超过1000倍的选择性,其中它具有约57倍的选择性。在同型半胱氨酸(HCA)诱导的神经变性分析中,Tubastatin A在5μM开始时显示出针对HCA诱导的神经细胞死亡的剂量依赖性保护,在10μM时接近完全保护[1]。在100 ng/mL时,Tubastatin A可增加Foxp3 + T调节细胞(Tregs)对体外T细胞增殖的抑制作用[2]。当肌原性过程早期α-微管蛋白高度乙酰化时,CC12细胞中的Tubastatin A治疗会导致肌管形成受损;然而,当α-微管蛋白在肌管中进行三乙酰化时会发生肌管伸长[3]。最近的一项研究表明,Tubastatin A治疗增加了细胞弹性,正如原子力显微镜(AFM)试验所揭示的那样,而不会对小鼠卵巢癌细胞系MOSE-E和MOSE-L中的肌动蛋白微丝或微管网络发生剧烈变化[4]。
• 体内研究: 每日治疗0.5mg/kg的Tubastatin A抑制HDAC6在炎症和自身免疫小鼠模型中促进Tregs抑制活性,包括多种形式的实验性结肠炎和完全主要组织相容性复合物(MHC)不相容的心脏同种异体移植物排斥[2]。
• 激酶实验: 使用Reaction Biology HDAC Spectrum平台进行酶抑制测定。 HDAC1,2,4,5,6,7,8,9,10和11测定使用分离的重组人蛋白质; HDAC3 / NcoR2复合物用于HDAC3测定。用于HDAC1,2,3,6,10和11测定的底物是来自p53残基379-382（RHKKAc）的荧光肽; HDAC8的底物是基于p53的残基379-382（RHKAcKAc）的荧光二酰基肽。乙酰基-Lys（三氟乙酰基）-AMC底物用于HDAC4,5,7和9测定。将Tubastatin A溶解于DMSO中，并以10剂量IC50模式进行测试，以30μM开始进行3倍连续稀释。对照化合物曲古抑菌素A（TSA）在10个剂量的IC50中进行测试，其中3倍连续稀释从5μM开始。通过曲线拟合剂量/响应斜率来提取IC 50值。
• 细胞实验: 如前所述，从胎儿Sprague-Dawley大鼠（胚胎第17天）的大脑皮层获得原代皮质神经元培养物。所有实验均在接种后24小时开始。在这些条件下，细胞不易受谷氨酸介导的兴奋毒性的影响。对于细胞毒性研究，用温PBS冲洗细胞，然后置于含有5.5g / L葡萄糖，10％胎牛血清，2mM L-谷氨酰胺和100μM胱氨酸的最低必需培养基中。通过向培养基中加入谷氨酸类似物高半胱氨酸（HCA; 5mM）诱导氧化应激。将HCA从100倍浓缩的溶液中稀释，将其调节至pH 7.5。与HCA组合，用指定浓度的Tubastatin A处理神经元。通过MTT测定（溴化3-（4,5-二甲基噻唑-2-基）-2,5-二苯基四唑）方法在24小时后评估生存力。
• 动物实验: 评估HDAC6靶向葡聚糖硫酸钠（DSS）和结肠炎的过继转移模型的效果，每组使用10只小鼠。每天将新鲜制备的4％（wt / vol）DSS（MP Biomedicals）加入WT B6小鼠的pH平衡自来水中5天。用tubacin或niltubacin（0.5mg / kg体重/天，ip）每天治疗小鼠7天，并通过每日监测体重，粪便稠度和粪便血液来评估结肠炎。将粪便稠度评分为0（硬），2（软）或4（腹泻），并将粪便血液（Hemoccult）评分为0（不存在），2（隐匿）或4（粗）。为了评估T细胞依赖性模型中结肠炎的预防，将使用磁珠（> 95％细胞纯度，流式细胞术）从WT小鼠分离的CD4 + CD45RBhi T细胞（1×106）腹膜内注射到B6 / Rag1 - / - 小鼠中加上使用来自HDAC6 - / - 或WT小鼠的磁珠（> 90％Treg纯度，流式细胞术）分离的CD4 + CD25 + Tregs（1.25×105），并且每两周监测小鼠的结肠炎的临床证据。为了评估已建立的T细胞依赖性结肠炎的治疗，用CD4 + CD45RBhi细胞（1×106）腹膜内注射B6 / Rag1 - / - 小鼠。一旦结肠炎发展，小鼠还接受如上所述从HDAC6 - / - 或WT小鼠分离的CD4 + CD25 + Tregs（5×10 5个细胞）或用HDAC6i（tubastatin A）或HSP90i（17-AAG）处理。监测小鼠的持续体重减轻和粪便稠度。在研究停止时，用Alcian Blue或苏木精和曙红染色的结肠的石蜡切片在组织学上分级或通过免疫过氧化物酶染色评估Foxp3 + Treg浸润。
• 参考文献:

  [1]. Kyle V. Butler et al. Rational Design and Simple Chemistry Yield a Superior, Neuroprotective HDAC6 Inhibitor, Tubastatin A J. Am. Chem. Soc., 2010, 132 (31), pp 10842-10846

  [2]. de Zoeten EF, et al. Histone deacetylase 6 and heat shock protein 90 control the functions of Foxp3(+) T-regulatory cells. Mol Cell Biol. 2011 May;31(10):2066-78.

  [3]. Di Fulvio S, et al. Dysferlin interacts with histone deacetylase 6 and increases alpha-tubulin acetylation. PLoS One. 2011;6(12):e28563

  [4]. Ketene AN, et al. Actin filaments play a primary role for structural integrity and viscoelastic response in cells. Integr Biol (Camb). 2012 May;4(5):540-9.

  [5]. Kozyreva VK, et al. NEDD9 regulates actin dynamics through cortactin deacetylation in an AURKA/HDAC6-dependent manner. Mol Cancer Res. 2014 May;12(5):681-93.

  [6]. Brijmohan, Angela, et al. Role of HDAC6 in Transcription Factor EB Mediated Clearance of Misfolded Proteins in Chronic Kidney Disease. University of Toronto.Nov-2017.

Tubastatin A物理化学性质

本表包含该物质理化参数，如熔点、沸点、密度、溶解度、旋光性等理化指标，无数据项标记为N/A。

• 分子式: C₂₀H₂₁N₃O₂
• 分子量: 371.861
• 精确质量: 371.140045
• PSA: 57.50000
• LogP: 3.12530
• InChIKey: GOVYBPLHWIEHEJ-UHFFFAOYSA-N
• SMILES: CN1CCc2c(c3ccccc3n2Cc2ccc(C(=O)NO)cc2)C1
• 储存条件: 2~8°C

Tubastatin A安全信息

本表记录该化合物安全警示、防护措施、禁配物、处置方式等安全相关参考信息。

• 危害码 (欧洲): Xi

Tubastatin A靶点实验

查看更多实验

本表记录该化合物靶点、体外体内实验、生物测定实验相关实验数据。

实验名称：Primary qHTS assay for inhibitors of alpha-synuclein gene (SNCA) expression 来源：NCGC External Id：SNCA-p-activity-luciferase

实验名称：Inhibition of HDAC6 in human SH-SY5Y cells assessed as levels of alpha-tubulin acetyl... 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 6 External Id：CHEMBL4274094

实验名称：Inhibition of HDAC6 in human SH-SY5Y cells assessed as levels of alpha-tubulin acetyl... 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 6 External Id：CHEMBL4274093

实验名称：Inhibition of human HDAC6 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 6 External Id：CHEMBL5232427

实验名称：Inhibition of HADC1 (unknown origin) 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 1 External Id：CHEMBL4322380

实验名称：Inhibition of HADC6 (unknown origin) 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 6 External Id：CHEMBL4322379

实验名称：Thermal Shift Assay. Domain: start/stop: N44-E168 来源：ChEMBL 靶标：Bromodomain-containing protein 4 External Id：CHEMBL5061253

实验名称：Inhibition of human recombinant N-terminal GST-tagged full length HDAC6 expressed in ... 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 6 External Id：CHEMBL4274082

实验名称：Inhibition of full length C-terminal 6x-His tagged human HDAC8 using Arg-His-Lys(Ac)-... 来源：ChEMBL 靶标：Histone deacetylase 8 External Id：CHEMBL3388106

实验名称：Quantitative High-Throughput drug screen in 47 multiple myeloma cell lines against th... 来源：NCGC 靶标：N/A External Id：s-my-keats_OPM1-m4-1

共794条，当前第1页，共80页

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Tubastatin A英文别名

本表罗列该化合物全部英文别名、系统命名、CAS别名等英文名称集合。

• N-Hydroxy-4-[(2-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-5H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]benzamide hydrochloride (1:1)
• Tubastatin-A
• Tubastatin A
• Benzamide, N-hydroxy-4-[(1,2,3,4-tetrahydro-2-methyl-5H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]-, hydrochloride (1:1)
• TSLDASIIWAMMQN
• N-hydroxy-4-(2-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-pyrido[4,3-b]indol-5-ylmethyl)benzamide

Tubastatin A常见问题

本部分为该化合物相关常见问答，包含基础参数、性状、储存条件等高频咨询问题与对应答案。

Q: Tubastatin A的极性表面积PSA是多少？

A: Tubastatin A极性表面积PSA为57.50000。

Q: 1252003-15-8的中文名称是什么？

A: 1252003-15-8的中文名称为Tubastatin A。

Q: Tubastatin A的英文名称是什么？

A: Tubastatin A英文名称为N-Hydroxy-4-[(2-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-5H-pyrido[4,3-b]indol-5 -yl)methyl]benzamide。

Q: Tubastatin A的分子式是什么？

A: Tubastatin A分子式为C20H21N3O2。

Q: Tubastatin A的SMILES表达式是什么？

A: Tubastatin ASMILES表达式为CN1CCc2c(c3ccccc3n2Cc2ccc(C(=O)NO)cc2)C1。

Q: Tubastatin A的CAS号是多少？

A: Tubastatin ACAS号为1252003-15-8。

Q: Tubastatin A的LogP（油水分配系数）是多少？

A: Tubastatin ALogP（油水分配系数）为3.12530。

Q: Tubastatin A有什么用途？

A: Tubastatin A主要用途：Tubastatin A 是一种有效的,选择性的 HDAC6 抑制剂,IC50 值为 15 nM, 对其选择性是对 HDAC8 的 57 倍多,是其他同工酶的 1000 多倍。

Q: Tubastatin A的储存条件是什么？

A: Tubastatin A储存条件：2~8°C。

Q: Tubastatin A有哪些英文别名？

A: Tubastatin A英文别名有：N-Hydroxy-4-[(2-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-5H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]benzamide hydrochloride (1:1)、Tubastatin-A、Tubastatin A、Benzamide, N-hydroxy-4-[(1,2,3,4-tetrahydro-2-methyl-5H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)methyl]-, hydrochloride (1:1)、TSLDASIIWAMMQN、N-hydroxy-4-(2-methyl-1,2,3,4-tetrahydro-pyrido[4,3-b]indol-5-ylmethyl)benzamide。

Tubastatin A生产厂家

本表列出该化合物相关生产厂商、供应商信息，包含厂家名称、产品供应相关参考信息。

上海阿拉丁生化科技股份有限公司

长沙福臻生物科技有限公司

武汉敬康恩生物医药科技有限公司

上海化源世纪贸易有限公司