| 描述 |
FMK 9a是autophagin-1的抑制剂,在FRET和LRA试验中测定的IC50值分别为80 和73 nM。
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| 相关类别 |
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| 靶点 |
IC50: 80 nM (autophagin-1, FRET assay); 73 nM (autophagin-1, LRA assay)[1]
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| 体外研究 |
ATG4B或autophagin-1是切割ATG8家族蛋白的半胱氨酸蛋白酶。 ATG4B在自噬体形成和自噬途径中起重要作用。 FMK 9a显示出对ATG4B的强烈抑制,在TR-FRET和基于细胞的LRA测定中IC 50值分别为80和73nM。 LC-MS/MS研究表明,FMK 9a与位于ATG4B催化位点的Cys74反应性较高的巯基形成不可逆的共价键,从而使ATG4B蛋白水解活性失活[1]。
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| 体内研究 |
FMK 9a显示中等溶解度(LYSA：41μg/ mL)和高人和小鼠肝微粒体清除率为13.9和70 mL/kg /分钟[1]。
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| 激酶实验 |
将FMK 9a溶解在DMSO中。将5μL在测定缓冲液中的系列稀释的FMK 9a（1％DMSO）加入到384孔板中的5μL纯化的ATG4B（最终0.1nM）中，并将溶液在室温（rt）下孵育30分钟。然后，将5μL的His-GATE-16-GST（最终20nM）加入孔中，并将溶液再孵育30分钟。加入5μL检测溶液（最终2nM的Eu-抗-His和20nM的Ulight-抗-GST），并将所得混合物在室温下孵育40分钟[1]。
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| 参考文献 |
[1]. Qiu Z, et al. Discovery of Fluoromethylketone-Based Peptidomimetics as Covalent ATG4B (Autophagin-1) Inhibitors. ACS Med Chem Lett. 2016 Jun 25;7(8):802-6.
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