SGC2085

SGC2085是一种具有高效性和选择性的CARM1抑制剂, IC50值为50 nM。

信号通路 >> 表观遗传学 >> 组蛋白甲基转移酶

研究领域 >> 癌症

IC50: 50 nM (CARM1)[1]

SGC2085具有位置R1的甲基和R2的3,5-二甲基苯氧基,对CARM1的IC50为50nM,对CARM1的选择性超过PRMT6的100倍。这些结果表明R1上的取代基的存在对于CARM1的有效和选择性抑制是必需的。除PRMT6(IC50 =5.2μM)外,SGC2085不会抑制其他PRMT。考虑到其小尺寸(MW = 312.4Da),SGC2085具有优异的选择性特征,可以通过利用精氨酸结合口袋外的两种酶的结合位点的差异来进一步改善。化合物SGC2085还显示对在三种不同浓度(1,10和50μM)下测试的一组21种人蛋白质甲基转移酶的完全选择性。为了表征SGC2085在溶液中的作用机制,在不同浓度的SAM和肽底物上测定IC 50值。增加底物肽或辅因子的浓度不会影响IC50值,这表明非竞争性抑制机制,之前已经显示其他蛋白质甲基转移酶抑制剂在底物袋中结合[1]。当测试高达10μM(在HEK293细胞中暴露48小时)时,没有观察到SGC2085的细胞活性,而BAF155的甲基化被10μM的双CARM1/PRMT6抑制剂MS049消除。我们假设SGC2085缺乏细胞活性是由于渗透性差[1]。

将SGC2085溶解在DMSO中并在使用前用适当的培养基稀释。 HEK293细胞在补充有10％FBS，青霉素（100U / mL）和链霉素（100μg/ mL）的DMEM中的12孔板中生长。用抑制剂或DMSO处理30％汇合的细胞。 48小时后，除去培养基并在100μL总裂解缓冲液（20mM Tris-HCl pH 8.0,150mM NaCl，1mM EDTA，10mM MgCl 2,0.5％Triton X-100,12.5U / mL）中裂解细胞。 benzonase），完全不含EDTA的蛋白酶抑制剂混合物。在室温下孵育3分钟后，加入SDS至1％终浓度。裂解物在SDS-PAGE上进行，并且如下所述进行免疫印迹以确定未甲基化和甲基化的BAF155的水平[1]。

[1]. Ferreira de Freitas R, et al. Discovery of a Potent and Selective Coactivator Associated Arginine Methyltransferase 1 (CARM1) Inhibitor by Virtual Screening. J Med Chem. 2016 Jul 28;59(14):6838-47.

GSK126 | Tazemetostat (EPZ-6438) | UNC0642 | 1-异丙基-N-[(6-甲基-2-氧代-4-丙基-1,2-二氢-3-吡啶基)甲基]-6-[2-(4-甲基-1-哌嗪基)-4-吡啶基]-1H-吲唑-4-甲酰胺 | 匹诺司他 | 3-去氮腺嘌呤A | GSK3326595 | N-[(1,2-二氢-6-甲基-2-氧代-4-丙基-3-吡啶基)甲基]-1-(1-甲基乙基)-6-[6-[4-(1-甲基乙基)-1-哌嗪基]-3-吡啶基]-1H-吲唑-4-甲酰胺 | 2-(六氢-4-甲基-1H-1,4-二氮杂卓-1-基)-6,7-二甲氧基-N-[1-(苯基甲基)-4-哌啶基]-4-喹唑啉胺 | EPZ031686 | AZ505二三氟乙酸盐 | N1-甲基-N1-[[4-[4-(异丙氧基)苯基]-1H-吡咯-3-基]甲基]-1,2-乙二胺 | EPZ004777 | EPZ015666 | GSK591