缩合剂是指缩合反应中所加的反应辅助剂。一般有起催化作用的缩合剂和缩合时与所生成的分离原子或原子团结合的缩合剂。前者如酯化反应中的酸催化剂、Friedl-Crafts反应中的三氯化铝等;后者如Wurtz-Fittig反应中金属钠等。 两个或多个有机化合物分子放出水、氨、氯化氢等简单分子而生成一个较大分子的反应，称为缩合反应。有时两个有机化合物分子互相作用，形成一个较大的分子而并不放出简单分子，也称缩合(反应)，如醇醛缩合。 缩合剂的选择取决于缩合反应的类型、反应物的结构、反应条件与反应过程中脱去的物质。化学合成中的保护基和缩合剂：在核酸化学合成中，作为原料单体的核苷和单核苷酸都是多官能团的化合物。它们在进行化学连接时，除去所需要反应的基团会发生反应以外，其他的基团也会参加反应，以致产生自聚、错接和降解等多种副产物。这不仅会降低所需要合成产物的产率，而且也给产物的分离纯化带来困难。为了保证合成产物能够具有与天然核酸完全相同的3′-5′磷酸二酯键结构和核苷酸排列顺序，这就要求合成反应具有高度的定向性和专一性。解决的办法是将在连接反应中不需要反应的基团(如糖上的羟基、碱基上的氨基和磷酸上的羟基等)尽量用适当的保护基暂时保护起来。因此，保护基选择的好坏对于合成的成功与否有着很大的关系。缩合剂的选择也很重要。在核酸合成中主要的反应是磷酸同核糖或脱氧核糖的羟基反应生成磷酸酯键。目前多是采用一种高活性和低副反应的缩合剂先与磷酸组份反应形成活化磷酸，然后再与羟基组份缩合的步骤。