蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

ALPHA-[3-[(2,5-二氧代-1-吡咯烷基)氧基]-3-氧代丙基]-OMEGA-甲氧基聚氧乙烯

m-PEGn-NHS酯是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：174569-25-6
• 分子式：(C₂H₄O)nC₈H₁₁NO₅
• 分子量：1787.0688
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG11-methane

Propargyl-PEG11-methane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2250411-18-6
• 分子式：C₂₆H₅₀O₁₂
• 分子量：554.67
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

t-Boc-Aminooxy-PEG2-azide

t-Boc-Aminooxy-PEG2-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：252378-68-0
• 分子式：C₁₁H₂₂N₄O₅
• 分子量：290.32
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VH032-OH

VH032-OH 是基于 VH032 的 VHL 配体。VH032-OH 可通过 linker 与蛋白质配体连接形成 PROTACs。

• CAS号：2244684-42-0
• 分子式：C₂₄H₃₂N₄O₅S
• 分子量：488.60
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS4322

MS4322是一流的PRMT5降解剂,也是探索PRMT5在健康和疾病中功能的有价值的化学工具(PROTAC)。

• CAS号：2601727-80-2
• 分子式：C₅₅H₇₆N₁₀O₁₂S
• 分子量：1101.32
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DNP-PEG4-DBCO

DNP-PEG4-DBCO 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2149585-17-9
• 分子式：C₃₅H₃₉N₅O₁₀
• 分子量：689.71
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG3-C6-Cl

Azido-PEG3-C6-Cl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1625717-44-3
• 分子式：C₁₂H₂₄ClN₃O₃
• 分子量：293.79
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG6-Ots

苄基-PEG6-Ots是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC。

• CAS号：129086-11-9
• 分子式：C₂₆H₃₈O₉S
• 分子量：526.64000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG10-azide

Azido-PEG10-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421783-42-7
• 分子式：C₂₂H₄₄N₆O₁₀
• 分子量：552.62
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-C5-acid

沙利度胺-O-C5-酸是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2087490-48-8
• 分子式：C₁₉H₂₀N₂O₇
• 分子量：388.37
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 ligase Ligand 9

E3 ligase Ligand 9 是一种 E3 泛素连接酶配体。E3 ligase Ligand 9 可以通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 或 SNIPER。PROTAC 可诱导促癌蛋白发生泛素化降解。

• CAS号：87304-15-2
• 分子式：C₂₁H₃₂N₂O₆
• 分子量：408.48900
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-N-PEG24-acid

Fmoc-N-PEG24-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2170484-59-8
• 分子式：C₆₆H₁₁₃NO₂₈
• 分子量：1368.59
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-amine

TCO-amine 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1609736-43-7
• 分子式：C₁₂H₂₂N₂O₂
• 分子量：226.32
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ph-PEG3

Ph-PEG3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：7204-16-2
• 分子式：C₁₂H₁₈O₄
• 分子量：226.26900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.097g/cm3
• 沸点：351.9ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：166.6ºC

Methyltetrazine-PEG8-NHS ester

Methyltetrazine-PEG8-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2183440-34-6
• 分子式：C₃₂H₄₇N₅O₁₃
• 分子量：709.74
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC HDAC6 degrader 1

PROTAC HDAC6降解剂(化合物A6)是一种有效且选择性的PROTAC HD AC6降解器,其DC50为3.5nM。PROTAC HDAC6降解剂通过诱导髓系白血病细胞系的凋亡显示出有前途的抗增殖活性[1]。

• CAS号：2785404-76-2
• 分子式：C₃₇H₄₆N₆O₁₀
• 分子量：734.80
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Mal-N-bis(PEG2-amine)

N-Mal-N-bis(PEG2-amine) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2128735-20-4
• 分子式：C₁₉H₃₄N₄O₇
• 分子量：430.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 ligase Ligand 17 hydrochloride

E3 ligase Ligand 17 hydrochloride 是一种 E3 泛素连接酶配体。E3 ligase Ligand 17 hydrochloride 可以通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC。PROTAC 可诱导促癌蛋白发生泛素化降解。

• CAS号：2305369-00-8
• 分子式：C₁₅H₁₇ClN₄O₄
• 分子量：352.77
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

十甘醇单甲醚

m-PEG10-alcohol (Decaethylene glycol monomethyl ether) 是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 10 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。m-PEG10-alcohol 还是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：27425-92-9
• 分子式：C₂₁H₄₄O₁₁
• 分子量：472.568
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：524.3±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：19ºC
• 闪点：270.9±28.7 °C

二乙二醇双(对甲苯磺酸酯)

Diethylene glycol bis(p-toluenesulfonate) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：7460-82-4
• 分子式：C₁₈H₂₂O₇S₂
• 分子量：414.493
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：581.2±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：87-89 °C(lit.)
• 闪点：305.3±28.7 °C

丙炔基-九聚乙二醇-羧酸

Propargyl-PEG10-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055022-18-7
• 分子式：C₂₄H₄₄O₁₂
• 分子量：524.599
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：593.9±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：184.2±23.6 °C

Cereblon inhibitor 2

Cereblon抑制剂2(化合物8)是一种可用于实体瘤研究,尤其是癌症的Cereblon抑制物[1]。

• CAS号：2639380-62-2
• 分子式：C₂₂H₂₁ClN₄O₄
• 分子量：440.88
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-5-COOH

沙利度胺-5-COOH是用于补充CRBN蛋白的沙利度胺基脑啡肽配体。沙利度胺-5-COOH可以通过连接物连接到蛋白质的配体上,从而形成PROTACs[1]。

• CAS号：1216805-11-6
• 分子式：C₁₄H₁₀N₂O₆
• 分子量：302.24
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：648.3±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：345.9±30.1 °C

Tos-PEG4-CH2COOH

Tos-PEG4-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2028284-73-1
• 分子式：C₁₇H₂₆O₉S
• 分子量：406.45
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cereblon modulator 1

Cereblon modulator 1 (compound F) 是一种 cereblon (CRBN) E3 连接酶调节剂。Cereblon modulator 1 与 CRBN 特异性结合,从而影响泛素 E3 连接酶复合物的活性。 这导致某些底物蛋白的泛素化并诱导蛋白酶体介导的某些转录因子的降解,包括 Ikaros (IKZF1) 和 Aiolos (IKZF3)。

• CAS号：1860875-51-9
• 分子式：C₂₂H₁₈ClF₂N₃O₄
• 分子量：461.85
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

dBET23

dBET23是BRD4异双功能小分子配体(PROTAC),在细胞降解测定中表现出BRD4 BD1(DC50/5h=50nM)的显着和选择性降解。

• CAS号：1957234-83-1
• 分子式：C₄₃H₄₅ClN₈O₉S
• 分子量：885.39
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(叔丁氧羰基)乙醇胺

Boc-NH-PEG1-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：26690-80-2
• 分子式：C₇H₁₅NO₃
• 分子量：161.199
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：267.2±23.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：115.4±22.6 °C

AZ'6421

AZ’6421作为靶向蛋白溶解嵌合体(PROTAC)选择性降解雌激素受体α。AZ’6421具有强大的抗肿瘤作用,可以抑制恶性疾病引起的不受控制的细胞增殖。AZ’6421可用于癌症研究,如乳腺癌[1]。

• CAS号：2361115-35-5
• 分子式：C₅₂H₆₅F₃N₆O₇S
• 分子量：975.17
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

OPSS-PEG8-COOH

OPSS-PEG8-COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1334177-96-6
• 分子式：C₂₇H₄₆N₂O₁₁S₂
• 分子量：638.791
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：768.5±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：418.6±32.9 °C

Thalidomide-NH-PEG4-Ms

Thalidomide-NH-PEG4-Ms 是一种 E3 连接酶配体-linker 偶联物 (E3 ligase ligand-linker conjugate),包含基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 1 个 linker。用于合成 PROTAC BCL-XL 降解剂 XZ739。

• CAS号：2140807-24-3
• 分子式：C₂₂H₂₉N₃O₁₀S
• 分子量：527.54
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A