蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

反式-4-羟基-L-脯氨酸甲酯盐酸盐

tans-4-羟基-D-脯氨酸甲酯盐酸盐是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。tans-4-羟基-D-脯氨酸甲酯盐酸盐也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：481704-21-6
• 分子式：C₆H₁₂ClNO₃
• 分子量：181.617
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

四乙基乙二醇单甲酯

Tetraethylene glycol monomethyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：23783-42-8
• 分子式：C₉H₂₀O₅
• 分子量：208.252
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：285.4±25.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：126.4±23.2 °C

3,6,9-三噁十一烷二酸

369-Trioxaundecanedioic Acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：13887-98-4
• 分子式：C₈H₁₄O₇
• 分子量：222.193
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：443.7±30.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：178.3±18.1 °C

CRBN-6-5-5-VHL

CRBN-6-5-5-VHL 是一种有效的选择性 cereblon (CRBN) 降解剂,DC50 值为 1.5 nM,而对底物 IKZF1 和 IKZF3 的降解几乎没有影响。

• CAS号：2362575-45-7
• 分子式：C₅₁H₆₉N₇O₁₀S
• 分子量：972.20
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methylamino-PEG2-Boc

Methylamino-PEG2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807521-04-5
• 分子式：C₁₂H₂₅NO₄
• 分子量：247.331
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：315.5±22.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：144.6±22.3 °C

三乙二醇单甲醚

m-PEG3-alcohol 是一种 PROTAC 连接桥 (PROTAC linker),属于 PEG 类,可用于合成 PROTACs。

• CAS号：112-35-6
• 分子式：C₇H₁₆O₄
• 分子量：164.199
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：233.9±20.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：-44ºC
• 闪点：95.3±21.8 °C

BocNH-PEG5-CH2CH2Br

BocNH-PEG5-CH2CH2Br 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1392499-33-0
• 分子式：C₁₇H₃₄BrNO₇
• 分子量：444.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-Boc-trans-3-aminocyclobutanol-Pip-CH2COOH

(S,R,S)-AHPC-Boc-trans-3-氨基环丁醇-Pip-CH2COOH(VH032-Boc-trans-3-氨基环丁醇-Pip-CH2COOH)是一端含有VHL配体的E3连接酶-配体-连接物共轭物。(S,R,S)-AHPC-Boc-trans-3-氨基环丁醇-Pip-CH2COOH用于PROTAC技术[1]。

• CAS号：2086301-47-3
• 分子式：C₃₉H₅₈N₆O₇S
• 分子量：754.98
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Amino-Tri-(m-PEG4-ethoxymethyl)-methane

Amino-Tri-(m-PEG4-ethoxymethyl)-methane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1428661-67-9
• 分子式：C₄₀H₈₀N₄O₁₈
• 分子量：905.08
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG5-S-methyl ethanethioate

Azido-PEG5-S-methyl ethanethioate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1352221-64-7
• 分子式：C₁₄H₂₇N₃O₆S
• 分子量：365.45
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SIAIS178

SIAIS178 是一种 PROTAC 类的有效的,选择性的 BCR-ABL 降解剂,IC50 为 24 nM。SIAIS178 通过募集 Von Hippel-Lindau (VHL) E3 泛素连接酶来降解 BCR-ABL 蛋白。SIAIS178 具有抗肿瘤活性。

• CAS号：2376047-73-1
• 分子式：C₅₀H₆₂ClN₁₁O₆S₂
• 分子量：1012.68
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG8-alcohol

Biotin-PEG8-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2182601-20-1
• 分子式：C₂₆H₄₉N₃O₁₀S
• 分子量：595.75
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NH2-C2-amido-C2-Boc

NH2-C2-amido-C2-Boc 是一种 PROTAC 连接桥,属于alkyl/ether 类。NH2-C5-NH-Boc 可用于合成一系列 PROTAC,如 PROTAC CDK2/9 Degrader-1 (HY-130709) 降解剂。

• CAS号：1692613-62-9
• 分子式：C₁₀H₂₀N₂O₃
• 分子量：216.28
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

THP-PEG4-OH

THP-PEG4-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。THP-PEG4-OH 可用于合成PROTAC分子。

• CAS号：128660-97-9
• 分子式：C₁₃H₂₆O₆
• 分子量：278.342
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：394.0±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：192.1±27.9 °C

Hydroxy-PEG5-C2-methyl ester

Hydroxy-PEG5-C2-methyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-80-5
• 分子式：C₁₄H₂₈O₈
• 分子量：440.53
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aminooxy-PEG8-acid

Aminooxy-PEG8-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055013-68-6
• 分子式：C₁₉H₃₉NO₁₁
• 分子量：457.51
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propanol-PEG3-CH2OH

Propanol-PEG3-CH2OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：112935-57-6
• 分子式：C₁₀H₂₂O₅
• 分子量：222.28
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-benzo

苯甲酸沙利度胺盐酸盐是用于补充CRBN蛋白的沙利度胺基脑啡肽配体。苯并沙利度胺可以通过连接物连接到蛋白质的配体上,形成PROTACs[1]。

• CAS号：458151-34-3
• 分子式：C₁₇H₁₂N₂O₄
• 分子量：308.29
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

t-Butyl acetate-PEG2-CH2COOH

t-Butyl acetate-PEG2-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：883564-93-0
• 分子式：C₁₂H₂₂O₇
• 分子量：278.30
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ERK-CLIPTAC

ERK-CLIPTAC是一种触发ERK降解的PROTAC分子[1]。

• CAS号：2087490-46-6
• 分子式：C₆₀H₆₁ClN₁₂O₉
• 分子量：1129.65
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC EED degrader-1

PROTAC EED降解剂-1是一种pKD为9.02的PROTAC靶向EED。PROTAC EED degrader-1是一种针对EED亚单位的多梳抑制复合物2(PRC2)抑制剂(pIC50=8.17)[1]。

• CAS号：2639882-72-5
• 分子式：C₅₅H₆₀FN₁₁O₈S
• 分子量：1054.20
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC CDK9 Degrader-1

PROTAC CDK9 Degrader-1 是一种有选择性的 CDK9 降解剂。

• CAS号：2118356-96-8
• 分子式：C₃₃H₃₅N₅O₇
• 分子量：613.66
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-C8-NH2 hydrochloride

沙利度胺-O-C8-NH2盐酸盐是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2636798-38-2
• 分子式：C₂₁H₂₈ClN₃O₅
• 分子量：437.92
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-Aminooxy-PEG1-C2-NH2

Boc-Aminooxy-PEG1-C2-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1844894-82-1
• 分子式：C₉H₂₀N₂O₄
• 分子量：220.27
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG2-Ms

m-PEG2-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：60696-83-5
• 分子式：C₆H₁₄O₅S
• 分子量：198.24
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Biotin-PEG4)-N-bis(PEG4-Boc)

N-(Biotin-PEG4)-N-bis(PEG4-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112730-79-5
• 分子式：C₅₀H₉₄N₄O₁₈S
• 分子量：1071.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-BOC-反式-4-羟基-D-脯氨酸

N-叔丁氧羰基-反式-4-羟基-D-脯氨酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。N-叔丁氧羰基-反式-4-羟基-D-脯氨酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：147266-92-0
• 分子式：C₁₀H₁₇NO₅
• 分子量：231.246
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：390.9±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：123ºC
• 闪点：190.2±27.9 °C

Benzyl-PEG3-methyl ester

Benzyl-PEG3-methyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：127457-61-8
• 分子式：C₁₅H₂₂O₅
• 分子量：282.33
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG6-(CH2)6-Phosphonic acid

m-PEG6-(CH2)6-Phosphonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2028284-71-9
• 分子式：C₁₉H₄₁O₉P
• 分子量：444.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮乙酸 NHS 酯

Aeide-C1-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：824426-32-6
• 分子式：C₆H₆N₄O₄
• 分子量：198.13600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A