蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

m-PEG2-O-Ph-3-NH2

m-PEG2-O-Ph-3-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：126415-02-9
• 分子式：C₁₁H₁₇NO₃
• 分子量：211.258
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：346.2±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：173.9±17.4 °C

Boc-Aminooxy-PEG4-azide

Boc-Aminooxy-PEG4-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-64-5
• 分子式：C₁₅H₃₀N₄O₇
• 分子量：378.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methyltetrazine-PEG8-PFP ester

Methyltetrazine-PEG8-PFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-49-9
• 分子式：C₃₄H₄₃F₅N₄O₁₁
• 分子量：778.72
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC SMARCA2 degrader-2

PROTAC SMARCA2降解剂-2是一种高效、选择性的SMARCA2/4 PROTAC降解剂,在HeLa HiBiT测定中IC50＜0.1μΜ。PROTAC SMARCA2降解剂-2从专利WO2023287787A1中提取,具有进行SMARCA4相关或缺乏型癌症研究的潜力[1]。

• CAS号：2892523-74-7
• 分子式：C₄₉H₆₂N₁₀O₆S
• 分子量：919.14
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Acid-PEG5-C2-Boc

Acid-PEG5-C2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1309460-29-4
• 分子式：C₁₈H₃₄O₉
• 分子量：394.457
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：495.2±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：163.1±22.2 °C

LCL 161, phenol

E3 ligase Ligand 12 是一种 E3 泛素连接酶配体。E3 ligase Ligand 12 可以通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 或 SNIPER。PROTAC 可诱导促癌蛋白发生泛素化降解。

• CAS号：2095244-42-9
• 分子式：C₃₁H₄₂N₄O₆S
• 分子量：598.75
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG2-Ms

Propargyl-PEG2-Ms 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Propargyl-PEG2-Ms 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：943726-01-0
• 分子式：C₈H₁₄O₅S
• 分子量：222.259
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：358.0±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：170.3±23.7 °C

3,6,9,12,15-五氧杂十六烷-1-硫醇

m-PEG5-SH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：524030-00-0
• 分子式：C₁₁H₂₄O₅S
• 分子量：268.37000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.048
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Hydroxy-PEG4-CH2-Boc

Hydroxy-PEG4-CH2-Boc 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTACs 的合成。

• CAS号：169751-72-8
• 分子式：C₁₄H₂₈O₇
• 分子量：308.368
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：393.1±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：132.9±18.6 °C

1-氨基-3,6,9-三噁-11-十一醇

Amino-PEG4-alcohol 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,可以用于合成 PROTAC。Amino-PEG4-alcohol 也是一个不可降解的 ADC linker,用于抗体药物结合物 (ADC) 的合成。

• CAS号：86770-74-3
• 分子式：C₈H₁₉NO₄
• 分子量：193.241
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：301.6±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：136.2±23.7 °C

N-(Amino-PEG3)-N-bis(PEG3-Boc)

N-(Amino-PEG3)-N-bis(PEG3-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055042-62-9
• 分子式：C₃₄H₆₈N₂O₁₃
• 分子量：712.91
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-(2-氯乙氧基)丙烷-1-醇

PEG2-Cl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：78925-46-9
• 分子式：C₅H₁₁ClO₂
• 分子量：138.593
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：236.9±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：97.1±20.4 °C

Thiol-C9-PEG5

Thiol-C9-PEG5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：130727-42-3
• 分子式：C₁₉H₄₀O₅S
• 分子量：380.58300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

17-氨基-10-氧代-3,6,12,15-四氧杂-9-氮杂十七烷酸

AEEA-AEEA是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。AEEA-AEEA也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：1143516-05-5
• 分子式：C₁₂H₂₄N₂O₇
• 分子量：308.32800
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.202±0.06 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-propargyl-PEG7

Bis-propargyl-PEG7是一种用于合成 PORTAC 的 PROTAC linker,属于 PEG 类。Bis-propargyl-PEG7 可用于合成鸟苷-3', 5'-环单磷酸盐的多聚体。

• CAS号：1351373-46-0
• 分子式：C₂₀H₃₄O₈
• 分子量：402.48
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BnO-PEG4-Boc

BnO-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807503-89-4
• 分子式：C₂₁H₃₄O₇
• 分子量：398.491
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：472.2±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：201.2±27.4 °C

Azido-PEG1-methyl ester

Azido-PEG1-methyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1835759-80-2
• 分子式：C₆H₁₁N₃O₃
• 分子量：173.17
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-溴-6-氯己烷

1-溴-6-氯己烷是一种PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC。

• CAS号：6294-17-3
• 分子式：C₆H₁₂BrCl
• 分子量：199.52
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：217.4±8.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：101.1±0.0 °C

N-(Azido-PEG3)-N-(PEG2-NH-Boc)-PEG3-acid

N-(Azido-PEG3)-N-(PEG2-NH-Boc)-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2183440-74-4
• 分子式：C₂₉H₅₅N₅O₁₃
• 分子量：681.77
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

O-(2-叠氮基乙基)-O-[2-(二甘氨酰基-氨基)乙基]庚乙二醇

2-((Azido-PEG8-carbamoyl)methoxy)acetic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：846549-37-9
• 分子式：C₂₂H₄₂N₄O₁₂
• 分子量：554.58800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-PEG2-azide

Pomalidomide-PEG2-azide 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物 (E3 ligase ligand-linker conjugate),包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 2 个单元 PEG 的 linker。

• CAS号：2267306-14-7
• 分子式：C₁₉H₂₀N₆O₇
• 分子量：444.40
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG13-alcohol

Propargyl-PEG13-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2867-46-1
• 分子式：C₂₉H₅₆O₁₄
• 分子量：628.75
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BETd-260

BETd-260 是基于 PROTAC 技术的一种有效的 BET 降解剂,在白血病细胞 RS4;11 中,降低 BRD4 蛋白活性,IC50 值为 30 pM。

• CAS号：2093388-62-4
• 分子式：C₄₃H₄₆N₁₀O₆
• 分子量：798.89
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Amino-PEG5)-N-bis(PEG4-acid)

N-(Amino-PEG5)-N-bis(PEG4-acid) 是一种 PEG 类 PROTAC linker,可用于合成 PROTAC。N-(Amino-PEG5)-N-bis(PEG4-acid) 含有一个带有两个末端羧酸的氨基。

• CAS号：2093152-86-2
• 分子式：C₃₄H₆₈N₂O₁₇
• 分子量：776.91
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG1-CH2COO-Cl

Azido-PEG1-CH2COO-Cl (compound 43a) 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC BRD4 Degrader-1 (HY-133131)。

• CAS号：79598-49-5
• 分子式：C₄H₆ClN₃O₂
• 分子量：163.56
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮-二乙二醇单甲醚

m-PEG2-azide 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：215181-61-6
• 分子式：C₅H₁₁N₃O₂
• 分子量：145.160
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 19

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 19 由降解决定子和 PROTAC 连接物组成。

• CAS号：1799711-24-2
• 分子式：C₁₉H₂₂N₄O₆
• 分子量：402.4
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

苄基-八聚乙二醇-四氢吡喃醚

Benzyl-PEG8-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1611489-00-9
• 分子式：C₂₈H₄₈O₁₀
• 分子量：544.675
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：602.0±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：224.1±31.4 °C

HS-PEG5-CH2CH2N3

HS-PEG5-CH2CH2N3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1449390-11-7
• 分子式：C₁₂H₂₅N₃O₅S
• 分子量：323.41
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG1-CH2CO2H

Azido-PEG1-CH2CO2H 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。Azido-PEG1-CH2CO2H 可用于合成 PROTAC BRD4 Degrader-1.

• CAS号：79598-48-4
• 分子式：C₄H₇N₃O₃
• 分子量：145.117
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A