蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Bromo-PEG2-CH2-Boc

Bromo-PEG2-CH2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807518-63-3
• 分子式：C₁₀H₁₉BrO₄
• 分子量：283.159
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：316.4±22.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：145.2±22.3 °C

N-(Azido-PEG2)-N-Boc-PEG4-NHS ester

N-(Azido-PEG2)-N-Boc-PEG4-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093153-95-6
• 分子式：C₂₆H₄₅N₅O₁₂
• 分子量：619.66
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基-单乙二醇-羧酸

Amino-PEG1-C2-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：144942-89-2
• 分子式：C₅H₁₁NO₃
• 分子量：133.146
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：284.7±20.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：126.0±21.8 °C

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG4-acid

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG4-acid 是一种 PEG 类 PROTAC linker, 含有一个叠氮基团,可以用来合成 PROTAC。

• CAS号：2112731-95-8
• 分子式：C₂₄H₄₆N₄O₁₁
• 分子量：566.64
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-PEG3-alcohol

Mal-PEG3-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：146551-23-7
• 分子式：C₁₀H₁₅NO₅
• 分子量：229.230
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：393.8±27.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：192.0±23.7 °C

15-叠氮基-4,7,10,13-四氧杂十五烷酸叔丁酯

Azido-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：581066-04-8
• 分子式：C₁₅H₂₉N₃O₆
• 分子量：347.407
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-C6-O-C5-O-C4-COOH

波马度胺-C6-O-C5-O-C4-COH是E3连接酶配体-接头缀合物,其包含波马度酰胺(HY-10984)基脑胶质配体和接头。泊马度胺-C6-O-C5-O-C4-COH可用于PROTAC的合成[1]。

• CAS号：2375774-54-0
• 分子式：C₂₉H₄₁N₃O₈
• 分子量：559.65
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Trt-PEG4-C2-acid hydrate

Trt-PEG4-C2-acid (hydrate) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1189873-11-7
• 分子式：C₃₀H₃₈O₇S
• 分子量：542.68
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG6-2-methylacrylate

m-PEG6-2-methylacrylate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。m-PEG6-2-methylacrylate 可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：90784-86-4
• 分子式：C₁₇H₃₂O₈
• 分子量：364.43
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DB1113

DB1113(实施例24)是激酶的双功能化合物靶向蛋白质降解。DB1113降解ABL1、ABL2、BLK、CDK11B、CDK4、CSK、EPHA3、FER、GAK、LIMK1、MAP3K20、MAP4K1、MAP4K2、MAP4K3、MAP4K5、MAPK14、MAPK7、MAPK8、MAPK9、MAPKAPK2、MAPKAPK3、NLK、PDIK1L、PTK2B、RIPK1、RPS6KA1、RPS6KA3、SIK2、SIK3、STK35、TNK2和ULK1。DB1113可用于疾病或疾病的研究由异常激酶活性介导[1]。

• CAS号：2769753-53-7
• 分子式：C₅₉H₆₈F₃N₁₃O₆S
• 分子量：1144.31
• 类别：Ferroptosis

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromo-PEG4-azide

Bromo-PEG5-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1951439-37-4
• 分子式：C₁₀H₂₀BrN₃O₄
• 分子量：326.19
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Mal-N-bis(PEG2-NHS ester)

N-Mal-N-bis(PEG2-NHS ester) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2182601-73-4
• 分子式：C₂₉H₃₈N₄O₁₅
• 分子量：682.63
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC PTPN2 degrader-2

PROTAC PTPN2降解剂-2(实施例187B)是一种有效的PTPN2分解剂,具有研究癌症或代谢性疾病的潜力[1]。

• CAS号：2912307-38-9
• 分子式：C₄₉H₄₉ClN₆O₁₁S₂
• 分子量：997.53
• 类别：磷酸酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC IRAK4 degrader-6

PROTAC IRAK4降解物-6是从专利US20190192668A1化合物I-172[1]中提取的PROTAC白细胞介素-1受体相关激酶4(IRAK4)降解物。

• CAS号：2360530-72-7
• 分子式：C₄₂H₄₁F₃N₁₂O₈
• 分子量：898.85
• 类别：IRAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG4-Val-Cit-PAB-OH

Azido-PEG4-Val-Cit-PAB-OH 是一种可降解 (cleavable) 的含 4 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。Azido-PEG4-Val-Cit-PAB-OH 还是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055024-64-9
• 分子式：C₂₉H₄₈N₈O₉
• 分子量：652.74
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(5-氨基戊基)氨基甲酸叔丁酯

PROTAC Linker 23 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl chain类。PROTAC Linker 23 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：51644-96-3
• 分子式：C₁₀H₂₂N₂O₂
• 分子量：202.294
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：309.2±25.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：140.8±23.2 °C

Propargyl-PEG3-phosphonic acid diethyl ester

Propargyl-PEG3-phosphonic acid diethyl ester 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Propargyl-PEG3-phosphonic acid diethyl ester 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：1052678-30-4
• 分子式：C₁₃H₂₅O₆P
• 分子量：308.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG4-propargyl

Azido-PEG4-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1192590-91-2
• 分子式：C₁₁H₁₉N₃O₄
• 分子量：257.29
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG6-azide

Biotin-PEG6-azide 是一种生物素标记的 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1085938-09-5
• 分子式：C₂₄H₄₄N₆O₈S
• 分子量：576.71
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

11-溴代十一烷酸甲酯

Br-C10-methyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。Br-C10-methyl ester 可用于合成一系列 PROTAC 分子 (包括 MS432)。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 VHL 配体部分,另一种是靶蛋白配体。

• CAS号：6287-90-7
• 分子式：C₁₂H₂₃BrO₂
• 分子量：279.21400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.157 g/mL at 25ºC(lit.)
• 沸点：115ºC0.04 mm Hg(lit.)
• 熔点：13°C(lit.)
• 闪点：>230 °F

E3连接酶Ligand-Linker共轭6个游离碱

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 6 Free Base 是一种合成化合物,包含 E3 泛素连接酶配体与 PROTAC 连接物,可以将靶蛋白与泛素化机制结合起来。

• CAS号：2010159-60-9
• 分子式：C₂₈H₄₁N₅O₆S
• 分子量：575.72
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

溴基七聚乙二醇溴基

Br-PEG7-Br 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：177987-04-1
• 分子式：C₁₆H₃₂Br₂O₇
• 分子量：496.229
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：486.9±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：203.4±25.8 °C

Azido-PEG3-aminoacetic acid-NHS ester

Azido-PEG3-aminoacetic acid-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2170240-91-0
• 分子式：C₁₄H₂₃N₅O₇
• 分子量：373.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

对甲苯磺酸酯-三聚乙二醇

Tos-PEG3 是基于 PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。Tos-PEG3 (结构 1) 可用于合成 3'-氨基氧基寡核苷酸固体载体。

• CAS号：77544-68-4
• 分子式：C₁₃H₂₀O₆S
• 分子量：304.35900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.234±0.06 g/cm3
• 沸点：460.0±35.0 °C
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-PEG6-acid

Mal-PEG6-acid 是一种基于 PEG 结构的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：518044-42-3
• 分子式：C₁₉H₃₁NO₁₀
• 分子量：433.450
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：578.2±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：303.5±30.1 °C

(S,R,S)-AHPC-CO-C9-acid

(S,R,S)-AHPC-CO-C9-酸是一种E3连接酶-配体-连接物共轭物,可连接到蛋白质的配体以形成PROTAC。

• CAS号：2172819-78-0
• 分子式：C₃₃H₄₈N₄O₆S
• 分子量：628.82
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG3-C2-methyl ester

Tos-PEG3-C2-methyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1239588-09-0
• 分子式：C₁₇H₂₆O₈S
• 分子量：390.45
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VH032 analogue-1

VH032 analogue-1 是 VH032 (HY-120217) 类似物,可作为 VHL 的配体,募集 von Hippel-Lindau (VHL) 蛋白。VH032 analogue-1 在酸性条件下会脱除保护基团,直接用于 PROTAC 分子合成。VH032 analogue-1 是合成基于 VHL 配体的 PROTAC关键中间体。

• CAS号：2111829-84-4
• 分子式：C₂₃H₃₀N₄O₅S
• 分子量：474.57
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-2

PROTAC BRD4 Degrader-2 是一种有效的 PROTAC BRD4 降解剂,对 BRD4 BD1 的 IC50 为 14.2 nM。

• CAS号：2185795-53-1
• 分子式：C₄₀H₃₉N₉O₇
• 分子量：757.79
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基-五聚乙二醇-丙酸叔丁酯

Amino-PEG5-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1446282-18-3
• 分子式：C₁₇H₃₅NO₇
• 分子量：365.462
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：439.1±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：114.1±23.7 °C