蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

O-(2-叠氮基乙基)-O-[2-(二甘氨酰基-氨基)乙基]庚乙二醇

2-((Azido-PEG8-carbamoyl)methoxy)acetic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：846549-37-9
• 分子式：C₂₂H₄₂N₄O₁₂
• 分子量：554.58800
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-PEG2-azide

Pomalidomide-PEG2-azide 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物 (E3 ligase ligand-linker conjugate),包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 2 个单元 PEG 的 linker。

• CAS号：2267306-14-7
• 分子式：C₁₉H₂₀N₆O₇
• 分子量：444.40
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG13-alcohol

Propargyl-PEG13-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2867-46-1
• 分子式：C₂₉H₅₆O₁₄
• 分子量：628.75
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BETd-260

BETd-260 是基于 PROTAC 技术的一种有效的 BET 降解剂,在白血病细胞 RS4;11 中,降低 BRD4 蛋白活性,IC50 值为 30 pM。

• CAS号：2093388-62-4
• 分子式：C₄₃H₄₆N₁₀O₆
• 分子量：798.89
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Amino-PEG5)-N-bis(PEG4-acid)

N-(Amino-PEG5)-N-bis(PEG4-acid) 是一种 PEG 类 PROTAC linker,可用于合成 PROTAC。N-(Amino-PEG5)-N-bis(PEG4-acid) 含有一个带有两个末端羧酸的氨基。

• CAS号：2093152-86-2
• 分子式：C₃₄H₆₈N₂O₁₇
• 分子量：776.91
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

苄基-八聚乙二醇-四氢吡喃醚

Benzyl-PEG8-THP 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1611489-00-9
• 分子式：C₂₈H₄₈O₁₀
• 分子量：544.675
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：602.0±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：224.1±31.4 °C

Thalidomide-4-NH-PEG1-COOH TFA

Thalidomide-4-NH-PEG1-COOH TFA 是一种 E3 连接酶配体与连接子的缀合物,由 Thalidomide (HY-14658) 和 NH-PEG3-NH-Boc 构成。Thalidomide-4-NH-PEG1-COOH TFA 可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-4-NH-PEG1-COOH TFA 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体。

• CAS号：2140807-20-9
• 分子式：C₂₀H₂₀F₃N₃O₉
• 分子量：503.38
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

endo-BCN-PEG2-NH2

endo-BCN-PEG2-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1263166-93-3
• 分子式：C₁₇H₂₈N₂O₄
• 分子量：324.41500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

泊马度胺4'-PEG4-酸

Pomalidomide-PEG4-COOH是一种E3连接酶配体连接物共轭物。Pomalidomide-PEG4-COOH包含PROTAC技术中使用的基于Pomalidomide的cereblon配体和4单元PEG连接物(摘自专利WO2017184995A1)[1]。

• CAS号：2138440-81-8
• 分子式：C₂₄H₃₁N₃O₁₀
• 分子量：521.517
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：773.6±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：421.6±32.9 °C

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-aminooxy

1,1,1-Trifluoroethyl-PEG4-aminooxy 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1895922-78-7
• 分子式：C₁₀H₂₀F₃NO₅
• 分子量：291.26
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG4-acid)

N-(Azido-PEG3)-N-bis(PEG4-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112731-54-9
• 分子式：C₃₀H₅₈N₄O₁₅
• 分子量：714.80
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG4-CH2-Boc

Azido-PEG4-CH2-Boc 是一种可降解 (cleavable) 的含 4 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。Azido-PEG4-CH2-Boc 也是一种 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：864681-04-9
• 分子式：C₁₄H₂₇N₃O₆
• 分子量：333.38100
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

十七甘醇

HO-PEG17-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：351342-04-6
• 分子式：C₃₄H₇₀O₁₈
• 分子量：766.91
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG3-bromide

Propargyl-PEG3-bromide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：203740-63-0
• 分子式：C₉H₁₅BrO₃
• 分子量：251.118
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：287.8±25.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：115.0±21.7 °C

Thalidomide-O-amido-C6-NH2

沙利度胺-O-酰胺基-C6-NH2(Cereblon配体连接物共轭物11),一种合成的E3连接酶配体连接物共轭物,包含基于沙利度胺的Cereblon配体和连接物,可用于PROTACs的合成[1]。

• CAS号：1950635-13-8
• 分子式：C₂₁H₂₆N₄O₆
• 分子量：430.45
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-NH-PEG3-amide-CH2OCH2COOH

Fmoc-NH-PEG3-amide-CH2OCH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：489427-26-1
• 分子式：C₂₇H₃₄N₂O₉
• 分子量：530.56700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.256g/cm3
• 沸点：794.8ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：434.5ºC

Methyltetrazine-PEG4-acid

Methyltetrazine-PEG4-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1802907-91-0
• 分子式：C₂₀H₂₈N₄O₇
• 分子量：436.459
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：647.6±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：345.5±34.3 °C

Ac4GalNAl

Ac4GalNAl 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1673590-09-4
• 分子式：C₁₉H₂₅NO₁₀
• 分子量：427.40
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

沙利度胺-NH-C3-NH-BOC

Thalidomide-NH-(CH2)3-NH-Boc 是 Boc 修饰的 Thalidomide (HY-14658),可作为 Cereblon?配体,募集 CRBN?蛋白。Thalidomide-NH-(CH2)3-NH-Boc 末端的 Boc 保护基团,可在酸性条件下脱除,进而参与 PROTAC 分子的合成。Thalidomide-NH-(CH2)3-NH-Boc 是基于 CRBN 设计的 PROTAC 分子合成过程中的关键中间体,合成靶向 11β-substituted estradiol 的 PROTAC。

• CAS号：2093386-36-6
• 分子式：C₂₁H₂₆N₄O₆
• 分子量：430.45
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG4-Amido-tri-(t-butoxycarbonylethoxymethyl)-methane

Azido-PEG4-Amido-tri-(t-butoxycarbonylethoxymethyl)-methane 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1421933-29-0
• 分子式：C₃₆H₆₆N₄O₁₄
• 分子量：778.93
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG2-bromide

Propargyl-PEG2-bromide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1287660-82-5
• 分子式：C₇H₁₁BrO₂
• 分子量：207.07
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

FC-11

FC-11是PROTAC FAK降解剂(DC90:1 nM)。FC-11含有CRBN配体泊马度胺(HY-10984)、接头和FAK配体PF562271(HY-10459)。FC-11在各种细胞中降解FAK,TM3中的DC50为310 pM,PA1中的DC50s为80 pM,MDA-MB-436中为330 pM,LNCaP中为370 pM,Ramos细胞中为40 pM[1]。

• CAS号：2271035-37-9
• 分子式：C₄₁H₄₂F₃N₁₃O₉S
• 分子量：949.91
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG2-NHS ester

炔丙基-PEG2-NHS酯是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2512228-06-5
• 分子式：C₁₂H₁₅NO₆
• 分子量：269.25
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Azido-PEG4-N-Boc-N-PEG3-Boc

N-Azido-PEG4-N-Boc-N-PEG3-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093152-85-1
• 分子式：C₂₈H₅₄N₄O₁₁
• 分子量：622.75
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BnO-PEG1-CH2COOH

BnO-PEG1-CH2COOH 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：93206-09-8
• 分子式：C₁₁H₁₄O₄
• 分子量：210.22600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG1-C1-Boc

Azido-PEG1-C1-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1820717-35-8
• 分子式：C₈H₁₅N₃O₃
• 分子量：201.22
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO-PEG2-Sulfo-NHS ester

TCO-PEG2-Sulfo-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-48-8
• 分子式：C₂₈H₄₉N₅O₁₂S
• 分子量：679.78
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Amino-PEG12-acid

Amino-PEG12-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1415408-69-3
• 分子式：C₂₇H₅₅NO₁₄
• 分子量：617.72
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

三甘醇单十二烷基醚

三甘醇单十二烷基醚是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：3055-94-5
• 分子式：C₁₈H₃₈O₄
• 分子量：318.492
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：0.9±0.1 g/cm3
• 沸点：412.0±25.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：202.9±23.2 °C

N-(Boc-PEG1)-N-bis(PEG2-propargyl)

N-(Boc-PEG1)-N-bis(PEG2-propargyl) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-63-4
• 分子式：C₂₃H₄₀N₂O₇
• 分子量：456.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A