蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

泊马度胺 d4

Pomalidomide-d4是氘标记的Pomalidom。Pomalidomide是第三代免疫调节剂,起到分子胶的作用。泊马利度胺与E3连接酶大脑相互作用并诱导必要的Ikaros转录因子降解<

• CAS号：1416575-78-4
• 分子式：C₁₃H₇D₄N₃O₄
• 分子量：277.27
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fluorescein-thiourea-PEG2-azide

Fluorescein-thiourea-PEG2-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1146195-72-3
• 分子式：C₂₇H₂₅N₅O₇S
• 分子量：563.582
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

甲基-PEG12-羧酸

m-PEG12-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2135793-73-4
• 分子式：C₂₆H₅₂O₁₄
• 分子量：588.68
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG2-NH-Boc

Tos-PEG2-NH-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：192132-77-7
• 分子式：C₁₆H₂₅NO₆S
• 分子量：359.44
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Dde Biotin-PEG4-azide

Dde Biotin-PEG4-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1802907-93-2
• 分子式：C₃₂H₅₃N₇O₈S
• 分子量：695.87
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

THP-PEG8-OH

THP-PEG8-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。THP-PEG8-OH 可用于合成PROTAC分子。

• CAS号：658858-65-2
• 分子式：C₂₁H₄₂O₁₀
• 分子量：454.55
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

九甘醇单甲醚

Nonaethylene glycol monomethyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：6048-68-6
• 分子式：C₁₉H₄₀O₁₀
• 分子量：428.515
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：490.1±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：14ºC
• 闪点：250.2±27.3 °C

Thalidomide-5-NH-PEG2-NH2 hydrochloride

Thalidomide-5-NH-PEG2-NH2 hydrochloride 是一种基于 Thalidomide (HY-14658) 的,可募集 CRBN 蛋白的 cereblon 配体。Thalidomide-5-NH-PEG2-NH2 hydrochloride 可通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 分子。例如 THAL-SNS-032 (HY-123937)。

• CAS号：2357110-58-6
• 分子式：C₁₉H₂₅ClN₄O₆
• 分子量：440.88
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aminooxy-PEG4-azide

Aminooxy-PEG4-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：2100306-61-2
• 分子式：C₁₀H₂₂N₄O₅
• 分子量：278.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TD-106

TD-106 是一种 CRBN 蛋白调节剂,可用于降解靶蛋白。含 TD-106 的 BRD4 PROTAC 可诱导 BRD4 降解。

• CAS号：2250288-69-6
• 分子式：C₁₂H₁₁N₅O₃
• 分子量：273.25
• 类别：E1/E2/E3酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DBCO-C-PEG1

DBCO-C-PEG1 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2377004-09-4
• 分子式：C₂₂H₂₂N₂O₃
• 分子量：362.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

羧酸-五聚乙二醇-羧酸

Bis-PEG6-acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Bis-PEG5-propionic acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：119189-70-7
• 分子式：C₁₆H₃₀O₁₀
• 分子量：382.403
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：543.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：187.7±23.6 °C

Azido-PEG3-S-PEG4-t-butyl ester

Azido-PEG3-S-PEG4-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055041-19-3
• 分子式：C₂₃H₄₅N₃O₉S
• 分子量：539.68
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Boc-N-bis-PEG5

N-Boc-N-bis-PEG5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093154-02-8
• 分子式：C₂₅H₅₁NO₁₂
• 分子量：557.67
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

t-Boc-aminooxy-PEG6-propargyl

t-Boc-aminooxy-PEG6-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093152-83-9
• 分子式：C₂₀H₃₇NO₉
• 分子量：435.51
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS4077

MS4077 是间变性淋巴瘤激酶 (ALK) PROTAC (降解物),结合 ALK, Kd 为 37 nM。

• CAS号：2230077-10-6
• 分子式：C₅₅H₇₂ClN₉O₁₃S
• 分子量：1134.73
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fluorescein-thiourea-PEG6-acid

Fluorescein-thiourea-PEG6-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055014-69-0
• 分子式：C₃₆H₄₂N₂O₁₃S
• 分子量：742.79
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG8-Ms

Benzyl-PEG8-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1330059-91-0
• 分子式：C₂₄H₄₂O₁₁S
• 分子量：538.65
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aminoethyl-SS-ethylalcohol

Aminoethyl-SS-ethylalcohol (Compound 3) 是一种 PROTAC linker,属于 Alkyl-Chain 类,可用于合成 PROTAC。Aminoethyl-SS-ethylalcohol 也是一种谷胱甘肽可降解 (cleavable) 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。

• CAS号：15579-01-8
• 分子式：C₄H₁₁NOS₂
• 分子量：153.27
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS98

MS98是一种高效、选择性的PROTAC AKT降解剂。MS98消耗细胞总AKT(T-AKT),DC50值为78 nM。MS98分别以4nm、140nm和8.1nm的Kds与AKT1、AKT2和AKT3结合[1]。

• CAS号：2376137-31-2
• 分子式：C₅₈H₈₁ClN₁₀O₇S
• 分子量：1097.84
• 类别：AKT

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Boc-PEG3)-N-bis(PEG3-acid)

N-(Boc-PEG3)-N-bis(PEG3-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055042-61-8
• 分子式：C₃₁H₆₀N₂O₁₅
• 分子量：700.81
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG3-S-Acetyl

m-PEG3-S-Acetyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：857284-78-7
• 分子式：C₉H₁₈O₄S
• 分子量：222.30200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮基-PEG4-羧基罗丹明 110 结合物

Carboxyrhodamine 110-PEG3-Azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1536327-95-3
• 分子式：C₅₈H₆₀N₁₂O₁₄
• 分子量：574.6
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tos-PEG5-CH2COOtBu

Tos-PEG5-CH2COOtBu 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1949793-62-7
• 分子式：C₂₃H₃₈O₁₀S
• 分子量：506.61
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG8-Br

m-PEG8-Br 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1056881-04-9
• 分子式：C₁₇H₃₅BrO₈
• 分子量：447.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.198±0.06 g/cm3(Predicted)
• 沸点：462.5±40.0 °C(Predicted)
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙炔基-十聚乙二醇-丙炔基

Bis-propargyl-PEG9 是一种用于合成 PORTAC 的 PROTAC linker,属于 PEG 类。Bis-propargyl-PEG9 可用于合成二价雌激素受体配体。

• CAS号：1351373-47-1
• 分子式：C₂₄H₄₂O₁₀
• 分子量：490.584
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：529.5±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：197.4±28.6 °C

cIAP1 Ligand-Linker Conjugates 12

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 38 包含用于 E3 泛素连接酶的 cIAP 配体和 linker。E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 38 可通过 PROTAC 技术合成降解剂。

• CAS号：2095244-52-1
• 分子式：C₄₆H₆₄N₄O₁₂S₂
• 分子量：929.15
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG5-CH2CO2-NHS

Azido-PEG5-CH2CO2-NHS 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2144777-77-3
• 分子式：C₁₆H₂₆N₄O₉
• 分子量：418.40
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-Me-C5-COOH

(S,R,S)-AHPC-Me-C5-COOH 是一种合成的 E3 连接酶配体结合物,它结合了 VHL 配体和连接子。(S,R,S)-AHPC-Me-C5-COOH 可用于 PROTAC DT2216 (HY-130604)。

• CAS号：2229976-21-8
• 分子式：C₃₀H₄₂N₄O₆S
• 分子量：586.74
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-PEG5-NHS ester

Fmoc-PEG5-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1402080-11-8
• 分子式：C₃₂H₄₀N₂O₁₁
• 分子量：628.67
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A