蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

苄基(S)-11-苄基-1-(9H-芴-9-基)-3,6,9,12,15-五氧-2,18-二氧-4,7,10,13,16-五氮杂-20-酸脂

Fmoc-Gly-Gly-Phe-Gly-CH2-O-CH2-Cbz 是 PROTAC 连接子和马来酰亚胺-GGFG 肽连接子。Fmoc-Gly-Gly-Phe-Gly-CH2-O-CH2-Cbz 可用于合成 Deruxtecan。

• CAS号：2264011-97-2
• 分子式：C₄₀H₄₁N₅O₉
• 分子量：735.78
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG4-NH-DBCO

m-PEG4-NH-DBCO 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2228857-36-9
• 分子式：C₂₈H₃₄N₂O₆
• 分子量：494.58
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氨基十三甘醇单甲醚

m-PEG12-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。m-PEG12-amine 也是一种不可降解 (non-cleavable) 的含 12 个单元 PEG 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。

• CAS号：1977493-48-3
• 分子式：C₂₅H₅₃NO₁₂
• 分子量：559.688
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：583.6±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：291.3±22.4 °C

BnO-PEG5-Boc

BnO-PEG5-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1807537-31-0
• 分子式：C₂₃H₃₈O₈
• 分子量：442.543
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：507.3±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：214.4±28.8 °C

Thalidomide 4'-ether-alkylC2-amine

沙利度胺4'-醚-烷基C2-胺是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了沙利度胺基塞伦配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：390367-50-7
• 分子式：C₁₅H₁₅N₃O₅
• 分子量：317.297
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：612.1±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：324.0±31.5 °C

TCO-PEG3-NHS ester

TCO-PEG3-NHS ester 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。TCO-PEG3-NHS ester 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：2141981-88-4
• 分子式：C₂₂H₃₄N₂O₉
• 分子量：470.51
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methyltetrazine-Ph-NHS ester

Methyltetrazine-Ph-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1644644-96-1
• 分子式：C₁₅H₁₃N₅O₄
• 分子量：327.29
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-17

PROTAC BRD4降解剂-17(化合物13i)是一种强效的PROTAC BR D4降解剂,其IC50值为29.54 nM(BRD4(BD1))和3.82 nM(BR D4(BD2))。PROTAC BRD4降解物-17显著减弱G2/M进展相关细胞周期蛋白B1的表达。PROTAC BRD4降解物-17显著诱导MV-4-11细胞凋亡[1]。

• CAS号：2585561-49-3
• 分子式：C₄₉H₄₇N₇O₉
• 分子量：877.94
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-NH-PEG15-CH2CH2COOH

Fmoc-NH-PEG15-CH2CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2378590-46-4
• 分子式：C₄₈H₇₇NO₁₉
• 分子量：972.12
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-C2-NH2(E3 ligase Ligand 17)

E3 ligase Ligand 17 是一种 E3 泛素连接酶配体。E3 ligase Ligand 17 可以通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 或 SNIPER。PROTAC 可诱导促癌蛋白发生泛素化降解。

• CAS号：1957235-66-3
• 分子式：C₁₅H₁₆N₄O₄
• 分子量：316.31
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aminooxy-PEG3-C2-NH-Boc

Aminooxy-PEG3-C2-NH-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 和 Alkyl/ether 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2062663-65-2
• 分子式：C₁₃H₂₈N₂O₆
• 分子量：308.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 30

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 30 包含用于 E3 泛素连接酶 cereblon (CRBN) 配体和 linker。E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 30 可通过 PROTAC 技术合成 MDM2 降解剂。

• CAS号：2093416-31-8
• 分子式：C₂₁H₂₈N₄O₇
• 分子量：448.47
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

dFKBP-1

dFKBP-1 是一种基于 PROTAC 的有效的 FKBP12 降解剂。dFKBP-1 包含 FKBP12 配体 SLF,基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和一个 linker。

• CAS号：1799711-22-0
• 分子式：C₅₃H₆₄N₆O₁₄
• 分子量：1009.11
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二十二烷二酸单叔丁酯

22-(叔丁氧基)-22-氧代二十二烷酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。22-(叔丁氧基)-22-氧代二十二烷酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于t

• CAS号：1642333-05-8
• 分子式：C₂₆H₅₀O₄
• 分子量：426.673
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DBCO-PEG4-acid

DBCO-PEG4-酸是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2110448-99-0
• 分子式：C₃₀H₃₆N₂O₈
• 分子量：552.62
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC ER Degrader-3

PROTAC ER Degrader-3 是合成 PAC 的中间体。PAC 是由抗体通过 linker 与 PROTAC 偶联而组成的。PAC 的详细信息请参考专利文献 WO2017201449A1 中的化合物 LP2。与 PROTAC (无 Ab) 相比,PAC 更加显著降低雌激素受体-α (ERα) 水平。

• CAS号：2158322-29-1
• 分子式：C₇₁H₇₇N₇O₁₂
• 分子量：1220.41
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Butoxycarbonyl-PEG5-sulfonic acid

Butoxycarbonyl-PEG5-sulfonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-28-6
• 分子式：C₁₇H₃₄O₁₀S
• 分子量：430.51
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Biotin)-N-bis(PEG1-alcohol)

N-(Biotin)-N-bis(PEG1-alcohol) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-75-8
• 分子式：C₁₈H₃₃N₃O₆S
• 分子量：419.54
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG3-phosphonic acid

m-PEG3-phosphonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：96962-42-4
• 分子式：C₇H₁₇O₆P
• 分子量：228.18000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.251±0.06 g/cm3(20 °C , 760mmHg)
• 沸点：382.9±50.0 °C (760 mmHg)
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

十六烷基二酸单叔丁酯

Boc-C14-COOH是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。Boc-C14-COOH也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：843666-27-3
• 分子式：C₂₀H₃₈O₄
• 分子量：341.50500
• 类别：ADC连接器

• 密度：0.959±0.06 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：58.0-62.0°C
• 闪点：N/A

dTAGV-1 TFA

dTAGV-1 TFA是突变FKBP12F36V融合蛋白的有效和选择性降解剂。dTAGV-1 TFA可在体内诱导FKBP12F36V Nluc的降解[1]。

• CAS号：2624313-15-9
• 分子式：C₇₀H₉₁F₃N₆O₁₆S
• 分子量：1361.56
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

五乙二醇单甲醚

Pentaethylene glycol monomethyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：23778-52-1
• 分子式：C₁₁H₂₄O₆
• 分子量：252.305
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：332.3±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：154.7±25.1 °C

Thalidomide-NH-PEG2-COOH

沙利度胺-NH-PEG2-COOH是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2412056-45-0
• 分子式：C₂₀H₂₃N₃O₈
• 分子量：433.41
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

六乙二醇二甲醚

Hexaethylene glycol dimethyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1072-40-8
• 分子式：C₁₄H₃₀O₇
• 分子量：310.38400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.02g/cm3
• 沸点：359ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：136.5ºC

N-Boc-N-bis(PEG3-acid)

N-Boc-N-bis(PEG3-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055023-35-1
• 分子式：C₂₃H₄₃NO₁₂
• 分子量：525.59
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SZUH280

SZUH280是一种有效和选择性的PROTAC HDAC8降解剂,在A549细胞中的DC50为0.58μ。SZUH280诱导癌症细胞凋亡。SZUH280阻碍癌症细胞的DNA损伤修复,促进细胞放射增敏[1]。

• CAS号：2770263-77-7
• 分子式：C₃₆H₃₄N₈O₈
• 分子量：706.70
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Propargyl-PEG4-carbonyl)-N-bis(PEG1-methyl ester)

N-(Propargyl-PEG4-carbonyl)-N-bis(PEG1-methyl ester) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112732-01-9
• 分子式：C₂₄H₄₁NO₁₁
• 分子量：519.58
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG9-S-methyl ethanethioate

Azido-PEG9-S-methyl ethanethioate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2148986-33-6
• 分子式：C₂₂H₄₃N₃O₁₀S
• 分子量：541.66
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

靶蛋白结合部分13

Target Protein-binding moiety 13 是一种 FKBP 的合成配体 (SLF),可用于 PROTAC 合成。

• CAS号：1092369-24-8
• 分子式：C₃₄H₄₄N₂O₉
• 分子量：624.72
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Benzyl-N-bis-PEG2

N-Benzyl-N-bis-PEG2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：119580-47-1
• 分子式：C₁₅H₂₅NO₄
• 分子量：283.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A