表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

JAK1-IN-4

JAK1-IN-4 是一种有效、选择性的 JAK1 抑制剂,对 JAK1,JAK2 和 JAK3 的 IC50 值分别为 85 nM,12.8 μM 和 >30 μM。在 NCI-H 1975 细胞中,JAK1-IN-4 抑制 STAT3 的磷酸化,IC50 值为 227 nM。

• CAS号：2091134-35-7
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromodomain inhibitor-12

溴代胺抑制剂-12(实施例303)是一种溴结构域抑制剂,可用于自身免疫性和炎症性疾病的研究[1]。

• CAS号：2010124-06-6
• 分子式：C₂₈H₃₈N₄O₅
• 分子量：510.63
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CM-675

CM-675 是磷酸二酯酶 5 (PDE5)和I类组蛋白去乙酰化酶 (HDAC1) 的选择性抑制剂,其对 PDE5 和 HDAC1 的IC50 值分别为114 nM 和673 nM。CM-675 可用于治疗阿尔兹海默症。

• CAS号：1872466-47-1
• 分子式：C₃₁H₃₂N₆O₃
• 分子量：536.62
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

对乙酰氨基苯酚

Acetaminophen (paracetamol) 是选择性环氧合酶-2 (COX-2) 的抑制剂,IC50 值为 25.8 μM。它是广泛使用的解热和止痛药。

• CAS号：103-90-2
• 分子式：C₈H₉NO₂
• 分子量：151.163
• 类别：细菌

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：387.8±25.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：168-172 °C(lit.)
• 闪点：188.4±23.2 °C

CBB1003

CBB1003是组蛋白去甲基化酶LSD1抑制剂,IC50值为10.54uM。

• CAS号：1379573-88-2
• 分子式：C₂₅H₃₁N₉O₄
• 分子量：521.57200
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DY-46-2

DY-46-2是一种高效、选择性的新型非核苷DNA甲基转移酶3A(DNMT3A)抑制剂,IC50值为0.39μM[1]。

• CAS号：1105110-83-5
• 分子式：C₁₉H₂₂N₆O₅S
• 分子量：446.48
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

YM-08

YM-08 (Compounds 7a) 是能透过血脑屏障的 SIRT2 的抑制剂,IC50 值为19.9 μM。YM-08 也是 Hsp70 的抑制剂。

• CAS号：812647-88-4
• 分子式：C₁₉H₁₇N₃OS₂
• 分子量：367.49
• 类别：HSP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TH34

TH34 是一种 HDAC6/8/10 抑制剂,IC50 值分别为 4.6 μM、1.9 μM、7.7 μM,与 HDAC1/2/3 相比,显示出高选择性。

• CAS号：2196203-96-8
• 分子式：C₁₅H₁₆N₂O₂
• 分子量：256.30
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

橙桑黄酮

Pomiferin 是从 Maclura pomifera 的果实中得到的黄酮类化合物,为 HDAC 和 mTOR 的抑制剂,IC50 值分别为 1.05 μM 和 6.2 µM。

• CAS号：572-03-2
• 分子式：C₂₅H₂₄O₆
• 分子量：420.45400
• 类别：HDAC

• 密度：1.314g/cm3
• 沸点：673.5ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：233.3ºC

(R,R)-VVD-118313

(R,R)-VVD-18313是VVD-118313(HY-151385)的异构体。VVD-118313是一种选择性JAK1抑制剂,阻断JAK1依赖性反式磷酸化和细胞因子信号传导。VVD-118313可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2875046-31-2
• 分子式：C₁₉H₂₂Cl₂N₂O₃S
• 分子量：429.36
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD4 Inhibitor-23

BRD4抑制剂-23是一种有效的口服活性BRD4抑制剂,对于BRD4 BD-1和BRD4 BD-2,IC50s分别为6.21 nM和1.44 nM(WO2022033542A1；示例1)[1]。

• CAS号：2760307-53-5
• 分子式：C₂₂H₁₉F₂N₃O₄S
• 分子量：459.47
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

白屈菜红碱

Chelerythrine 是一种天然生物碱,为有效、选择性的 Ca2+/磷脂依赖性 PKC 拮抗剂,IC50 值为 0.7 μM。Chelerythrine 具有抗肿瘤、抗糖尿病、抗炎的活性。

• CAS号：34316-15-9
• 分子式：C₂₁H₁₈ClNO₄
• 分子量：348.371
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：195-205ºC
• 闪点：N/A

Momelotinib-d2

Momelotinib-d2(CYT387-d2)是氘标记的Momelotnib(HY-10961)。莫美洛替尼(CYT387)是JAK1/JAK2的口服活性和ATP竞争性抑制剂,IC50a分别为11nM和18nM,对JAK3的活性要低得多[1][2]。

• CAS号：1619927-63-7
• 分子式：C₂₃H₂₀D₂N₆O₂
• 分子量：416.47
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC6-IN-26

HDAC6-IN-26 (compound 23) 是 HDAC6 的有效抑制剂。

• CAS号：2991427-19-9
• 分子式：C₁₃H₁₂N₈O
• 分子量：296.29
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CeMMEC1

CeMMEC1 是 BRD4 的抑制剂,同时对 TAF1 有很高的亲和性,对 TAF1 的 IC50 值为 0.9 μM,对 TAF1 (2) 的 Kd 值为 1.8 μM。

• CAS号：440662-09-9
• 分子式：C₁₉H₁₆N₂O₄
• 分子量：336.341
• 类别：DNA/RNA合成

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：590.1±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：310.7±30.1 °C

JAK-IN-1

JAK-IN-1是 JAK1/2/3 抑制剂, IC50 分别为0.26,0.8 和3.2 nM。JAK-IN-1对JAK3的选择性比JAK1高。

• CAS号：1334673-53-8
• 分子式：C₂₀H₂₄N₆O₂
• 分子量：380.44
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丁酸钠

Sodium Butyrate是一种短链脂肪酸,可以抑制组蛋白去乙酰化酶。

• CAS号：156-54-7
• 分子式：C₄H₇NaO₂
• 分子量：110.087
• 类别：自噬

• 密度：0.987g/cm3
• 沸点：164.3ºC at 760 mmHg
• 熔点：250-253 °C(lit.)
• 闪点：69.7ºC

PU-139

PU-139是一种有效的非选择性HAT(组蛋白乙酰转移酶)抑制剂,可阻断HATs Gcn5,p300/CBP相关因子(PCAF),CREB蛋白(CBP)和p300；触发细胞培养中不依赖caspase的细胞死亡,阻断SK-N-SH神经母细胞瘤异种移植物在小鼠体内的生长,并协同阿霉素在体内的作用。

• CAS号：158093-65-3
• 分子式：C₁₂H₇FN₂OS
• 分子量：246.260
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：434.3±51.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：216.5±30.4 °C

ZL0590

ZL0590是一种有效的口服活性BRD4 BD1选择性抑制剂,对人BRD4 BD1的IC50为90 nM。ZL0590具有显著的抗炎活性[1]。

• CAS号：2230496-99-6
• 分子式：C₂₃H₂₇F₃N₄O₄S
• 分子量：512.55
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Rucaparib Camsylate

Rucaparib是 PARP 的抑制剂,对PARP1的 Ki 值为1.4 nM。也可结合PARP其他八个结构域。

• CAS号：1859053-21-6
• 分子式：C₂₉H₃₄FN₃O₅S
• 分子量：555.661
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC6-IN-21

HDAC6-IN-21 (compound 13) 是一种不可逆的组蛋白去乙酰化酶 6 (histonedeacetylase 6(HDAC6)) 抑制剂。

• CAS号：2920929-76-4
• 分子式：C₁₄H₁₃F₂N₅O₂
• 分子量：321.28
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

西瑞香素

Daphnoretin (Dephnoretin) 是从Wikstroemia indica 中提取得到的,拥有抗病毒活性。Daphnoretin 和PMA作用类似,可以直接激活蛋白激酶C,从而激活NADPH氧化酶。

• CAS号：2034-69-7
• 分子式：C₁₉H₁₂O₇
• 分子量：352.294
• 类别：PKC

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：639.6±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：245-246℃
• 闪点：237.8±25.0 °C

(R)-BAY1238097

(R)-BAY1238097 是BAY1238097 的低活性 R 型异构体。BAY1238097 是一种有效的、BET与组蛋白 结合的选择性抑制剂,通过下调c-Myc水平及下游转录组,在AML (急性髓性白血病) 和MM (多发性骨髓瘤) 模型中表现出较强的抗增殖活性。

• CAS号：1564269-85-7
• 分子式：C₂₅H₃₃N₅O₃
• 分子量：451.56
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AMPK activator 11

AMPK活化剂11是一种AMP活化蛋白激酶(AMPK)活化剂,具有针对几种CRC的纳米分子水平抗增殖活性。AMPK激活剂11通过激活AMPK和上调氧化磷酸化(OXPHOS)(线粒体代谢)选择性抑制RKO异种移植物生长,可用于抗肿瘤和代谢性疾病研究[1]。

• CAS号：2948304-00-3
• 分子式：C₂₅H₂₀N₄O₂
• 分子量：408.45
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(+)-抗生素 K 252A

K-252a 可从土壤真菌Nocardiopsis sp.中分离得到的一种十字孢碱的类似物,是蛋白激酶的抑制剂,对 PKC、PKA、II型钙调素依赖性激酶和磷酸化酶激酶的 IC50 值分别为470 nM、140 nM、270 nM和1.7 nM。

• CAS号：99533-80-9
• 分子式：C₂₇H₂₁N₃O₅
• 分子量：467.473
• 类别：PKC

• 密度：1.7±0.1 g/cm3
• 沸点：685.3±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：368.2±31.5 °C

SRT 1720 dihydrochloride

SRT 1720二盐酸盐是SIRT1的选择性口服活性激活剂,EC50为0.10μM,对SIRT2和SIRT3的活性较弱[1]。

• CAS号：2468639-77-0
• 分子式：C₂₅H₂₅Cl₂N₇OS
• 分子量：542.48
• 类别：自噬

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BBDDL2059

BBDDL2059是组蛋白甲基转移酶EZH2的选择性共价抑制剂,EZH2-Y641F的IC50为1.5 nM。BBDDL2059在纳摩尔浓度下抑制淋巴瘤细胞生长,可用于抗癌研究[1]。

• CAS号：2691174-27-1
• 分子式：C₂₇H₃₆N₄O₄S
• 分子量：512.66
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HA-1077 hydrochloride

Fasudil(HA-1077；AT877)二盐酸盐是一种非特异性RhoA/ROCK抑制剂,对蛋白激酶也有抑制作用,其中ROCK1的Ki为0.33μM,ROCK2的IC50s为0.158μM和4.58μM、12.30μM和1.650μM,PKA、PKC、PKG的Ki分别为0.33和0.158μM。盐酸法舒地尔也是一种有效的钙离子通道拮抗剂和血管扩张剂[1][2][3]。

• CAS号：203911-27-7
• 分子式：C₁₄H₂₁Cl₂N₃O₃S
• 分子量：382.306
• 类别：HIV

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

OXF BD 02

OXF BD 02是BRD4(1)(BRD4的第一个溴代烷)的选择性抑制剂,IC50值为382 nM【1】。

• CAS号：1429129-68-9
• 分子式：C₁₈H₁₇NO₃
• 分子量：295.33
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：515.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：265.5±30.1 °C

CpG 甲基转移酶

CpG Methyltransferase 是一种 DNA 甲基转移酶。CpG Methyltransferase 可将 5'-CpG-3' 环境中未甲基化或半甲基化双链 DNA 中所含所有胞嘧啶核苷酸的碱基部分的 C5 位置甲基化。

• CAS号：1809633-78-0
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A