蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Lenalidomide-4-OH

来那度胺-4-OH是以来那度胺为基础的cereblon(CRBN)配体,用于补充CRBN蛋白。来那度胺-4-OH可以通过连接物连接到蛋白质的配体以形成PROTAC。

• CAS号：1061604-41-8
• 分子式：C₁₃H₁₂N₂O₄
• 分子量：260.245
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：602.9±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：318.4±31.5 °C

五乙二醇单甲醚

Pentaethylene glycol monomethyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：23778-52-1
• 分子式：C₁₁H₂₄O₆
• 分子量：252.305
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：332.3±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：154.7±25.1 °C

Thalidomide-NH-PEG2-COOH

沙利度胺-NH-PEG2-COOH是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2412056-45-0
• 分子式：C₂₀H₂₃N₃O₈
• 分子量：433.41
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

硫辛酰氨基-PEG12-羧酸

Lipoamido-PEG12-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2407442-47-9
• 分子式：C₃₅H₆₇NO₁₅S₂
• 分子量：806.03
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

六乙二醇二甲醚

Hexaethylene glycol dimethyl ether 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1072-40-8
• 分子式：C₁₄H₃₀O₇
• 分子量：310.38400
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.02g/cm3
• 沸点：359ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：136.5ºC

N-Boc-N-bis(PEG3-acid)

N-Boc-N-bis(PEG3-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055023-35-1
• 分子式：C₂₃H₄₃NO₁₂
• 分子量：525.59
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG6-N3

Propargyl-PEG6-N3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1198080-03-3
• 分子式：C₁₅H₂₇N₃O₆
• 分子量：345.391
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SZUH280

SZUH280是一种有效和选择性的PROTAC HDAC8降解剂,在A549细胞中的DC50为0.58μ。SZUH280诱导癌症细胞凋亡。SZUH280阻碍癌症细胞的DNA损伤修复,促进细胞放射增敏[1]。

• CAS号：2770263-77-7
• 分子式：C₃₆H₃₄N₈O₈
• 分子量：706.70
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Propargyl-PEG4-carbonyl)-N-bis(PEG1-methyl ester)

N-(Propargyl-PEG4-carbonyl)-N-bis(PEG1-methyl ester) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112732-01-9
• 分子式：C₂₄H₄₁NO₁₁
• 分子量：519.58
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG3-Sulfone-PEG3-acid

m-PEG3-Sulfone-PEG3-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1919045-04-7
• 分子式：C₁₆H₃₂O₁₀S
• 分子量：416.48
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG9-S-methyl ethanethioate

Azido-PEG9-S-methyl ethanethioate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2148986-33-6
• 分子式：C₂₂H₄₃N₃O₁₀S
• 分子量：541.66
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

靶蛋白结合部分13

Target Protein-binding moiety 13 是一种 FKBP 的合成配体 (SLF),可用于 PROTAC 合成。

• CAS号：1092369-24-8
• 分子式：C₃₄H₄₄N₂O₉
• 分子量：624.72
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 1

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate 1 包含 E3 泛素连接酶的配体,以及 PROTAC 连接物,可将靶蛋白和泛素化机制结合起来。

• CAS号：2097938-44-6
• 分子式：C₂₃H₂₉N₃O₁₀
• 分子量：507.49
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG3-CH2-Boc

Benzyl-PEG3-CH2-Boc 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：1443467-88-6
• 分子式：C₁₉H₃₀O₆
• 分子量：354.438
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：435.2±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：186.7±26.0 °C

N-Benzyl-N-bis-PEG2

N-Benzyl-N-bis-PEG2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：119580-47-1
• 分子式：C₁₅H₂₅NO₄
• 分子量：283.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

5-[Boc(methyl)amino]pentanal

5-[Boc(methyl)amino]pentanal 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1620280-47-8
• 分子式：C₁₁H₂₁NO₃
• 分子量：215.29
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-NH-CBP/p300 ligand 2

沙利度胺NH CBP/p300配体2(P-007)是一种基于PROTAC的CBP和p300降解剂(从专利WO2020173440中提取)[1]。

• CAS号：2484739-21-9
• 分子式：C₄₈H₅₇F₂N₁₁O₆
• 分子量：922.03
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-propargyl-PEG10

Bis-propargyl-PEG10 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1351373-48-2
• 分子式：C₂₆H₄₆O₁₁
• 分子量：534.64
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PEG4-苄醚

Benzyl-PEG4-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：86770-76-5
• 分子式：C₁₅H₂₅NO₄
• 分子量：283.36300
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：390.4±32.0°C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

苄基-五聚乙二醇-氨基

Benzyl-PEG5-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：86770-77-6
• 分子式：C₁₇H₂₉NO₅
• 分子量：327.416
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：429.7±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：210.7±21.0 °C

八乙二醇

Octaethylene glycol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：5117-19-1
• 分子式：C₁₆H₃₄O₉
• 分子量：370.436
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：471.5±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：22 °C
• 闪点：239.0±27.3 °C

PROTAC CDK9 degrader-4

PROTAC CDK9降解剂-4是一种高效的CDK9降解剂,用于靶向转录调控。

• CAS号：2411021-01-5
• 分子式：C₄₃H₅₆N₁₀O₅
• 分子量：792.97
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG9-azide

Azido-PEG9-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1171122-72-7
• 分子式：C₂₀H₄₀N₆O₉
• 分子量：508.57
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Mal-amido-PEG9-acid

Mal-amido-PEG9-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112731-43-6
• 分子式：C₂₈H₄₈N₂O₁₄
• 分子量：636.69
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

L-Azidohomoalanine-1,2,3,4-13C4 hydrochloride

L-叠氮高丙氨酸-1,2,3,4-13C4盐酸盐是13C-和15N-标记的L-叠氮高丙氨酸盐酸盐。L-叠氮高丙氨酸盐酸盐是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：2483829-89-4
• 分子式：₁₃C₄H₉ClN₂₁₅N₂O₂
• 分子量：186.55
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromo-PEG1-acid

Bromo-PEG1-acid 是一种基于 PEG 的PROTAC linker,可以用来合成 PROTAC。

• CAS号：1393330-33-0
• 分子式：C₅H₉BrO₃
• 分子量：197.027
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：301.7±22.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：136.2±22.3 °C

PROTAC BRD4 Degrader-5

PROTAC BRD4 Degrader-5 是一种基于 PROTAC 的 BRD4 降解剂,可有效降解 HER2 阳性和阴性乳腺癌细胞系中的 BRD4。

• CAS号：2409538-70-9
• 分子式：C₅₀H₆₂ClN₉O₈S₂
• 分子量：1016.67
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

庚二酸氢乙酯

Monoethyl pimelate 是一种 PROTAC 连接桥 (PROTAC linker),属于 alkyl/ether 类。Monoethyl pimelate 能用于合成特异性的 BCL-XL PROTAC 降解剂 (S,R,S)-AHPC-Me-C7 ester。

• CAS号：33018-91-6
• 分子式：C₉H₁₆O₄
• 分子量：188.22100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.074 g/cm3
• 沸点：135-138ºC 1mm
• 熔点：10ºC
• 闪点：108ºC

Amino-PEG5-CH2COOH

Amino-PEG5-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。NH2-PEG5-CH2COOH 可用于合成PROTAC分子。

• CAS号：141282-35-1
• 分子式：C₁₂H₂₅NO₇
• 分子量：295.32900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-乙酰氧基-2,5-二氧代吡咯烷-3-磺酸

Sulfo-NHS-Acetate 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：152305-87-8
• 分子式：C₆H₇NO₇S
• 分子量：237.18700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.8g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A