蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

羧酸-五聚乙二醇-羧酸

Bis-PEG6-acid 是一种 PROTAC 连接桥,属于 PEG 类。Bis-PEG5-propionic acid 可用于合成一系列 PROTAC 分子。

• CAS号：119189-70-7
• 分子式：C₁₆H₃₀O₁₀
• 分子量：382.403
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：543.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：187.7±23.6 °C

Propargyl-PEG4-sulfonic acid

Propargyl-PEG4-sulfonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-29-7
• 分子式：C₁₁H₂₀O₇S
• 分子量：296.34
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

dBET1

dBET1 是基于 PROTAC 技术的有效的 BRD4 蛋白质降解物,其 EC50 值为 430 nM。

• CAS号：1799711-21-9
• 分子式：C₃₈H₃₇ClN₈O₇S
• 分子量：785.268
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-Phthalimidehydroxy-acetic acid

2-Phthalimidehydroxy-acetic acid 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：134724-87-1
• 分子式：C₁₀H₇NO₅
• 分子量：221.16600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-PEG4-methyl propionate

Boc-PEG4-methyl propionate 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-74-7
• 分子式：C₁₇H₃₂O₈
• 分子量：364.43
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG3-S-PEG4-t-butyl ester

Azido-PEG3-S-PEG4-t-butyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055041-19-3
• 分子式：C₂₃H₄₅N₃O₉S
• 分子量：539.68
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG2-ethoxyethane-PEG2

Benzyl-PEG2-ethoxyethane-PEG2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2115897-18-0
• 分子式：C₁₉H₃₂O₅
• 分子量：340.45
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HS-PEG3-CH2CH2NH2

HS-PEG3-CH2CH2NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1189760-69-7
• 分子式：C₈H₁₉NO₃S
• 分子量：209.31
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromo-PEG6-azide

Bromo-PEG6-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2062663-64-1
• 分子式：C₁₄H₂₈BrN₃O₆
• 分子量：414.29
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(+)-生物素-PFP-酯

Biotin-PFP ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：120550-35-8
• 分子式：C₁₆H₁₅F₅N₂O₃S
• 分子量：410.359
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：555.3±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：190.0 to 194.0 °C
• 闪点：289.6±30.1 °C

N-Boc-N-bis-PEG5

N-Boc-N-bis-PEG5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093154-02-8
• 分子式：C₂₅H₅₁NO₁₂
• 分子量：557.67
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

O-(2-氨基乙基)-O′-(2-叠氮乙基)九聚乙二醇

Azido-PEG10-amine 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：912849-73-1
• 分子式：C₂₂H₄₆N₄O₁₀
• 分子量：526.62100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

t-Boc-aminooxy-PEG6-propargyl

t-Boc-aminooxy-PEG6-propargyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2093152-83-9
• 分子式：C₂₀H₃₇NO₉
• 分子量：435.51
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Diethyl 7-bromoheptylphosphonate

Diethyl 7-bromoheptylphosphonate 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：100462-73-5
• 分子式：C₁₁H₂₄BrO₃P
• 分子量：315.18
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS4077

MS4077 是间变性淋巴瘤激酶 (ALK) PROTAC (降解物),结合 ALK, Kd 为 37 nM。

• CAS号：2230077-10-6
• 分子式：C₅₅H₇₂ClN₉O₁₃S
• 分子量：1134.73
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fluorescein-thiourea-PEG6-acid

Fluorescein-thiourea-PEG6-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055014-69-0
• 分子式：C₃₆H₄₂N₂O₁₃S
• 分子量：742.79
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC EGFR degrader 5

PROTAC EGFR降解剂5(化合物10)是一种PROTAC EGFR降解剂,在DC50为34.8nm的HCC827细胞中有效降解EGFRDel19。PROTAC EGFR降解物5显著诱导HCC827细胞凋亡,并将细胞阻滞在G1期[1]。

• CAS号：2409793-36-6
• 分子式：C₅₇H₇₂FN₁₃O₅S
• 分子量：1070.33
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG8-Ms

Benzyl-PEG8-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1330059-91-0
• 分子式：C₂₄H₄₂O₁₁S
• 分子量：538.65
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aminoethyl-SS-ethylalcohol

Aminoethyl-SS-ethylalcohol (Compound 3) 是一种 PROTAC linker,属于 Alkyl-Chain 类,可用于合成 PROTAC。Aminoethyl-SS-ethylalcohol 也是一种谷胱甘肽可降解 (cleavable) 的 ADC linker,可用于合成抗体偶联药物 (ADC)。

• CAS号：15579-01-8
• 分子式：C₄H₁₁NOS₂
• 分子量：153.27
• 类别：ADC连接器

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Boc-4-pentyne-1-amine

N-Boc-4-pentyne-1-amine 是一种 PROTAC 连接子,属于烷基链类。N-Boc-4-pentyne-1-amine 可用于 PROTAC MG-277 (HY-130122) 的合成。

• CAS号：151978-50-6
• 分子式：C₁₀H₁₇NO₂
• 分子量：183.24700
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

生物素-乙二胺

Biotin-EDA 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：111790-37-5
• 分子式：C₁₂H₂₂N₄O₂S
• 分子量：354.425
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：844.9±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：172-174ºC
• 闪点：464.8±34.3 °C

CH2COOH-PEG9-CH2COOH

CH2COOH-PEG9-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2250056-46-1
• 分子式：C₂₂H₄₂O₁₄
• 分子量：530.56
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS98

MS98是一种高效、选择性的PROTAC AKT降解剂。MS98消耗细胞总AKT(T-AKT),DC50值为78 nM。MS98分别以4nm、140nm和8.1nm的Kds与AKT1、AKT2和AKT3结合[1]。

• CAS号：2376137-31-2
• 分子式：C₅₈H₈₁ClN₁₀O₇S
• 分子量：1097.84
• 类别：AKT

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Boc-PEG3)-N-bis(PEG3-acid)

N-(Boc-PEG3)-N-bis(PEG3-acid) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2055042-61-8
• 分子式：C₃₁H₆₀N₂O₁₅
• 分子量：700.81
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VZ185

VZ185 是高效,快速,选择性的 BRD7/9 PROTAC 降解剂,DC50 分别为4.5 和 1.8 nM。

• CAS号：2306193-61-1
• 分子式：C₅₃H₆₇FN₈O₈S
• 分子量：995.21
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VH032-PEG1-NH2 dihydrochloride

VH032-PEG1-NH2 hydrochloride 包含一个用于 E3 泛素连接酶的 VHL 配体和一个 PROTAC 连接物。VH032-PEG1-NH2 hydrochloride 可用于 PROTACs 的设计。

• CAS号：2341796-83-4
• 分子式：C₂₆H₃₉Cl₂N₅O₅S
• 分子量：604.59
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG3-S-Acetyl

m-PEG3-S-Acetyl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：857284-78-7
• 分子式：C₉H₁₈O₄S
• 分子量：222.30200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG2-phosphonic acid

m-PEG2-phosphonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：96962-41-3
• 分子式：C₅H₁₃O₅P
• 分子量：184.128
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：337.7±48.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：158.0±29.6 °C

叠氮基-PEG4-羧基罗丹明 110 结合物

Carboxyrhodamine 110-PEG3-Azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1536327-95-3
• 分子式：C₅₈H₆₀N₁₂O₁₄
• 分子量：574.6
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 49

E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 49 包含用于 E3 泛素连接酶 cereblon (CRBN) 配体和 linker。E3 ligase Ligand-Linker Conjugates 49 可通过 PROTAC 技术合成 降解剂。

• CAS号：2351103-63-2
• 分子式：C₃₁H₄₄N₄O₁₁
• 分子量：648.70
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A