蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

14-羟基-3,6,9,12-四氧杂癸酸

Hydroxy-PEG4-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：70678-95-4
• 分子式：C₁₀H₂₀O₇
• 分子量：252.26200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Methylamino-PEG3-azide

Methylamino-PEG3-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1355197-57-7
• 分子式：C₉H₂₀N₄O₃
• 分子量：232.280
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-amido-C7-acid

(S,R,S)-AHPC-氨基-C7酸包含E3泛素连接酶的VHL配体和PROTAC接头。(S,R,S)-AHPC-氨基-C5酸可用于设计PROTAC[1]。

• CAS号：2172819-76-8
• 分子式：C₃₁H₄₄N₄O₆S
• 分子量：600.77
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-(2,6-Dioxopiperidin-3-yl)phthalimidine-C5-Br

2-(2,6-二氧哌啶-3-基)邻苯二甲亚胺-C5-Br是一种用于PROTAC的E3连接酶配体连接物共轭物。

• CAS号：2411022-24-5
• 分子式：C₁₈H₂₁BrN₂O₃
• 分子量：393.27
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azide-PEG12-alcohol

Azide-PEG12-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1821464-55-4
• 分子式：C₂₄H₄₉N₃O₁₂
• 分子量：571.66
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

三聚乙二醇-乙酸

PROTAC Linker 8 (Compound 15b) 是一种 PROTAC 连接桥,可用于合成一系列 SNIPER(ER)。SNIPER(ER) 含有两个通过连接桥连接的不同配体,一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。 SNIPER(ER) 诱导细胞中靶蛋白多泛素化和蛋白酶体降解。

• CAS号：51951-05-4
• 分子式：C₈H₁₆O₆
• 分子量：208.21
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Chloro-PEG5-chloride

Chloro-PEG5-chloride 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：5197-65-9
• 分子式：C₁₀H₂₀Cl₂O₄
• 分子量：275.16900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-N-PEG5-C2-NHS ester

Boc-N-PEG5-C2-NHS ester 是一种基于 PEG 合成的 PROTAC linker,用于合成 PROTAC。

• CAS号：2055040-78-1
• 分子式：C₂₂H₃₈N₂O₁₁
• 分子量：506.54
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-(N,N'-PEG4-NHS ester)-Cy5

Bis-(N,N'-PEG4-NHS ester)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-48-1
• 分子式：C₅₅H₇₃ClN₄O₁₆
• 分子量：1081.64
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HaloPROTAC3

新型卤标记融合蛋白降解剂

• CAS号：1799506-07-2
• 分子式：C₄₁H₅₅ClN₄O₈S
• 分子量：799.42
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JQAD1

JQAD1是一种依赖于CRBN的PROTAC,选择性地靶向EP300进行降解。JQAD1抑制EP300表达和H3K27ac修饰。JQAD1诱导细胞凋亡。JQAD1可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2417097-18-6
• 分子式：C₄₈H₅₂F₄N₆O₉
• 分子量：932.95
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG8-hydrazide

Azido-PEG8-hydrazide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353410-11-2
• 分子式：C₁₉H₃₉N₅O₉
• 分子量：481.54
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DSPE-PEG2-mal

DSPE-PEG2-mal 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1915739-87-5
• 分子式：C₅₅H₁₀₀N₃O₁₄P
• 分子量：1058.37
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Pomalidomide-amido-PEG3-C2-NH2

Pomalidomide-amido-PEG3-C2-NH2 (Cereblon Ligand-Linker Conjugates 22) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Pomalidomide 的 cereblon 配体和 3 个单元 PEG 的 linker。

• CAS号：2328070-52-4
• 分子式：C₂₂H₂₈N₄O₈
• 分子量：476.48
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Biotin-PEG2-CH2CH2N3

Biotin-PEG2-CH2CH2N3 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：945633-30-7
• 分子式：C₁₆H₂₈N₆O₄S
• 分子量：400.49600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BSJ-04-132

BSJ-04-132 是一种有效的,选择性的基于 Ribociclib (HY-15777) 的 CDK4 降解剂 (PROTAC),对 CDK4/D1 和 CDK6/D1 的 IC50 分别为 50.6 nM 和 30 nM。BSJ-04-132 不诱导 CDK6 和 IKZF1/3 降解,具有抗癌活性。

• CAS号：2349356-39-2
• 分子式：C₄₂H₄₉N₁₁O₇
• 分子量：819.91
• 类别：CDK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG4-Boc

N-(Azido-PEG3)-N-Boc-PEG4-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112731-94-7
• 分子式：C₂₈H₅₄N₄O₁₁
• 分子量：622.75
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

羧酸-三聚乙二醇-羧酸

Bis-PEG4-acid是PEG的连接桥,应用于PROTAC中。

• CAS号：31127-85-2
• 分子式：C₁₂H₂₂O₈
• 分子量：294.30
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HO-PEG13-OH

HO-PEG13-OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：17598-96-8
• 分子式：C₂₆H₅₄O₁₄
• 分子量：590.69900
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.116g/cm3
• 沸点：631.6ºC at 760mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Fmoc-NH-PEG8-NHS ester

Fmoc-NH-PEG8-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1334170-03-4
• 分子式：C₃₈H₅₂N₂O₁₄
• 分子量：760.825
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VHL Ligand 3

PROTAC的VHL配体。

• CAS号：1448189-98-7
• 分子式：C₂₇H₃₈N₄O₅S
• 分子量：530.679
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：755.7±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：410.9±32.9 °C

Boc-NH-PEG3-sulfonic acid

Boc-NH-PEG3-sulfonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1817735-32-2
• 分子式：C₁₃H₂₇NO₈S
• 分子量：357.42
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

马来酰亚胺-四聚乙二醇-羧酸

Mal-PEG4-acid 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：518044-41-2
• 分子式：C₁₅H₂₃NO₈
• 分子量：345.34500
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PAC

PAC 是由抗体通过 linker 与 PROTAC 偶联而组成的。PAC 的详细信息请参考专利文献 WO2017201449A1 中的化合物 PAC1。与 PROTAC (无 Ab) 相比,PAC 更加显著降低雌激素受体-α (ERα) 水平。

• CAS号：2158322-33-7
• 分子式：C₉₄H₁₀₇N₁₃O₁₆
• 分子量：1674.93
• 类别：用于PAC的PROTAC-连接子共轭物

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Cl-C6-PEG4-C3-COOH

Cl-C6-PEG4-C3-COOH是一种 PROTAC 连接桥,可用于合成含氯烷烃的 PROTACs (HaloPROTACs)。

• CAS号：2127391-58-4
• 分子式：C₁₈H₃₅ClO₆
• 分子量：382.92
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(PEG2-C2-acid)-N-bis(PEG2-propargyl)

N-(PEG2-C2-acid)-N-bis(PEG2-propargyl) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2100306-49-6
• 分子式：C₂₁H₃₅NO₈
• 分子量：429.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tetraethyl octane-1,8-diylbis(phosphonate)

Tetraethyl octane-1,8-diylbis(phosphonate) 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：5943-61-3
• 分子式：C₁₆H₃₆O₆P₂
• 分子量：386.40100
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bis-(m-PEG4)-amidohexanoic acid

Bis-(m-PEG4)-amidohexanoic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2353409-74-0
• 分子式：C₂₆H₅₀N₂O₁₂
• 分子量：582.68
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

endo-BCN-PEG4-Boc

endo-BCN-PEG4-Boc 是一种基于 PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTACs 的合成。

• CAS号：1807501-83-2
• 分子式：C₂₆H₄₃NO₈
• 分子量：497.621
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：594.3±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：313.2±28.7 °C

17-十八炔酸

Alkynyl Stearic Acid 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：34450-18-5
• 分子式：C₁₈H₃₂O₂
• 分子量：280.445
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：0.9±0.1 g/cm3
• 沸点：400.8±18.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：142-148 °C(lit.)
• 闪点：194.7±15.9 °C