蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

Propanol-PEG3-CH2OH

Propanol-PEG3-CH2OH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：112935-57-6
• 分子式：C₁₀H₂₂O₅
• 分子量：222.28
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-benzo

苯甲酸沙利度胺盐酸盐是用于补充CRBN蛋白的沙利度胺基脑啡肽配体。苯并沙利度胺可以通过连接物连接到蛋白质的配体上,形成PROTACs[1]。

• CAS号：458151-34-3
• 分子式：C₁₇H₁₂N₂O₄
• 分子量：308.29
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

t-Butyl acetate-PEG2-CH2COOH

t-Butyl acetate-PEG2-CH2COOH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：883564-93-0
• 分子式：C₁₂H₂₂O₇
• 分子量：278.30
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC FLT-3降解剂1

PROTAC FLT-3 degrader 1 是 FLT-3内部串联重复 (ITD) 降解剂,IC50为0.6 nM。抗增殖,诱导凋亡活性。

• CAS号：2230826-81-8
• 分子式：C₅₂H₆₁N₉O₉S₂
• 分子量：1020.23
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮-五聚乙二醇-丙酸叔丁酯

Azide-PEG5-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1415800-41-7
• 分子式：C₁₇H₃₃N₃O₇
• 分子量：391.460
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ERK-CLIPTAC

ERK-CLIPTAC是一种触发ERK降解的PROTAC分子[1]。

• CAS号：2087490-46-6
• 分子式：C₆₀H₆₁ClN₁₂O₉
• 分子量：1129.65
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC EED degrader-1

PROTAC EED降解剂-1是一种pKD为9.02的PROTAC靶向EED。PROTAC EED degrader-1是一种针对EED亚单位的多梳抑制复合物2(PRC2)抑制剂(pIC50=8.17)[1]。

• CAS号：2639882-72-5
• 分子式：C₅₅H₆₀FN₁₁O₈S
• 分子量：1054.20
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC CDK9 Degrader-1

PROTAC CDK9 Degrader-1 是一种有选择性的 CDK9 降解剂。

• CAS号：2118356-96-8
• 分子式：C₃₃H₃₅N₅O₇
• 分子量：613.66
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-O-C8-NH2 hydrochloride

沙利度胺-O-C8-NH2盐酸盐是一种合成的E3连接酶-配体-连接物共轭物,它结合了基于沙利度胺的cereblon配体和PROTAC技术中使用的连接物[1]。

• CAS号：2636798-38-2
• 分子式：C₂₁H₂₈ClN₃O₅
• 分子量：437.92
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Boc-Aminooxy-PEG1-C2-NH2

Boc-Aminooxy-PEG1-C2-NH2 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1844894-82-1
• 分子式：C₉H₂₀N₂O₄
• 分子量：220.27
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

m-PEG2-Ms

m-PEG2-Ms 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：60696-83-5
• 分子式：C₆H₁₄O₅S
• 分子量：198.24
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-(Biotin-PEG4)-N-bis(PEG4-Boc)

N-(Biotin-PEG4)-N-bis(PEG4-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2112730-79-5
• 分子式：C₅₀H₉₄N₄O₁₈S
• 分子量：1071.36
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromo-PEG3-C2-phosphonic acid

Bromo-PEG3-C2-phosphonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1148026-99-6
• 分子式：C₈H₁₈BrO₆P
• 分子量：321.103
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：458.1±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：230.9±31.5 °C

Thalidomide-5-O-C2-NH2 hydrochloride

Thalidomide-5-O-C2-NH2 hydrochloride 是一种基于 Thalidomide (HY-14658) 的,可募集 CRBN 蛋白的 cereblon 配体。Thalidomide-5-O-C2-NH2 hydrochloride 可通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 分子。例如 THAL-SNS-032 (HY-123937)。

• CAS号：2694727-89-2
• 分子式：C₁₅H₁₆ClN₃O₅
• 分子量：353.76
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-BOC-反式-4-羟基-D-脯氨酸

N-叔丁氧羰基-反式-4-羟基-D-脯氨酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体-药物结合物(ADC)。N-叔丁氧羰基-反式-4-羟基-D-脯氨酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：147266-92-0
• 分子式：C₁₀H₁₇NO₅
• 分子量：231.246
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：390.9±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：123ºC
• 闪点：190.2±27.9 °C

Benzyl-PEG3-methyl ester

Benzyl-PEG3-methyl ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：127457-61-8
• 分子式：C₁₅H₂₂O₅
• 分子量：282.33
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

生物素化-epsilon-氨基己酸-N-羟基丁二酰亚胺活化酯

Biotin-C5-NHS Ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：72040-63-2
• 分子式：C₂₀H₃₀N₄O₆S
• 分子量：454.540
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：169-171 °C
• 闪点：N/A

PROTAC Linker 9

PROTAC Linker 9 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl/ether 类。PROTAC Linker 9 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：206265-94-3
• 分子式：C₁₈H₂₉NO₇S
• 分子量：403.49000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ERD-3111

ERD-3111 (Compound 44) 是一种具有口服活性的 PROTAC ERα 降解剂 (DC50: 0.5 nM)。ERD-3111 可抑制具有野生型 ER 的亲本 MCF-7 异种移植模型和两种临床相关的 ESR1 突变小鼠模型中的肿瘤生长。ERD-3111 可用于 ER+乳腺癌的研究。

• CAS号：2832865-25-3
• 分子式：C₄₅H₄₆F₄N₈O₅
• 分子量：854.89
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-C7-amine

(S,R,S)-AHPC-C7-amine (VH032-C7-amine) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker (E3 ligase ligand-linker conjugate) 偶联物,包含基于 VH032 的 VHL 配体和 1 个 linker。(S,R,S)-AHPC-C7-amine 可用于合成靶向 ERRα 的 PROTAC 降解剂。

• CAS号：2306389-04-6
• 分子式：C₃₀H₄₅N₅O₄S
• 分子量：571.77
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azidoethyl-SS-PEG2-Boc

Azidoethyl-SS-PEG2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2144777-83-1
• 分子式：C₁₃H₂₅N₃O₄S₂
• 分子量：351.49
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Propargyl-PEG8-SH

Propargyl-PEG8-SH 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1422540-92-8
• 分子式：C₁₉H₃₆O₈S
• 分子量：424.55
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-methyl-N'-methyl-O-(m-PEG4)-O'-(propargyl-PEG4)-Cy5

N-methyl-N'-methyl-O-(m-PEG4)-O'-(propargyl-PEG4)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-50-5
• 分子式：C₄₇H₆₇ClN₂O₁₀
• 分子量：855.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Benzyl-PEG6-bromide

Benzyl-PEG6-bromide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1449202-44-1
• 分子式：C₁₉H₃₁BrO₆
• 分子量：435.35
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.225±0.06 g/cm3(Predicted)
• 沸点：481.4±40.0 °C(Predicted)
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

L-Azidohomoalanine

L-Azidohomoalanine 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：120042-14-0
• 分子式：C₄H₈N₄O₂
• 分子量：144.13200
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：220-223ºC
• 闪点：N/A

TNF-α-IN-1

TNF-α-IN-1是 TNF-α 抑制剂,来自专利 US20030096841A1,化合物实例 I-7.

• CAS号：444287-49-4
• 分子式：C₁₆H₁₄ClN₃O₅
• 分子量：363.753
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：718.6±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：388.4±32.9 °C

m-PEG6-(CH2)6-Phosphonic acid

m-PEG6-(CH2)6-Phosphonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2028284-71-9
• 分子式：C₁₉H₄₁O₉P
• 分子量：444.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮乙酸 NHS 酯

Aeide-C1-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：824426-32-6
• 分子式：C₆H₆N₄O₄
• 分子量：198.13600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CC-885-CH2-PEG1-NH-CH3

CC-885-CH2-PEG1-NH-CH3是一种新降解物,可用于合成抗体新降解物结合物(AnDC)[1][2]。

• CAS号：2722698-03-3
• 分子式：C₂₆H₃₀ClN₅O₅
• 分子量：528.00
• 类别：ADC细胞毒素

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tetrazine-Ph-acid

Tetrazine-Ph-acid 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl chain 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1380500-92-4
• 分子式：C₁₀H₈N₄O₂
• 分子量：216.20
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A