表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

TYA-018

TYA-018是一种口服活性、强效和高选择性的HDAC6抑制剂。TYA-018具有保护小鼠心功能的作用。TYA-018还通过增加与脂肪酸代谢、蛋白质代谢和氧化磷酸化相关的靶点的表达来增强小鼠的能量学[1]。

• CAS号：2653254-31-8
• 分子式：C₁₅H₁₃ClF₂N₄O₃S₂
• 分子量：434.87
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

奥拉替尼

Oclacitinib 是一种新型 JAK 抑制剂。Oclacitinib 抑制 JAK1 最有效,IC50 为 10 nM。

• CAS号：1208319-26-9
• 分子式：C₁₅H₂₃N₅O₂S
• 分子量：337.440
• 类别：JAK

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK121 (trifluoroacetate salt)

GSK-121三氟乙酸酯是一种选择性PAD4抑制剂[1]。

• CAS号：1652591-80-4
• 分子式：C₂₅H₂₆F₃N₅O₃
• 分子量：501.501
• 类别：癌症

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK3368715

GSK3368715 (EPZ019997) 是具有口服活性的,可逆的,SAM 非竞争性 I 型蛋白精氨酸甲基转移酶 (PRMTs) 抑制剂 (IC50=3.1 nM (PRMT1), 48 nM (PRMT3), 1148 nM (PRMT4), 5.7 nM (PRMT6), 1.7 nM (PRMT8))。GSK3368715 (EPZ019997) 导致精氨酸甲基化状态的转变,改变了外显子的使用,具有很强的抗癌活性。

• CAS号：1629013-22-4
• 分子式：C₂₀H₃₈N₄O₂
• 分子量：366.54
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CCT241736

CCT241736 是一种有效的,可口服的 FLT3 和 Aurora kinase 双重抑制剂,能够有效抑制 Aurora-A (Kd,7.5 nM；IC50,38 nM),Aurora-B (Kd,48 nM),FLT3 (Kd,6.2 nM),以及 FLT3 突变体 FLT3-ITD (Kd,38 nM) 和 FLT3(D835Y) (Kd,14 nM) 的活性。

• CAS号：1402709-93-6
• 分子式：C₂₂H₂₃Cl₂N₇
• 分子量：456.371
• 类别：极光激酶

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC-IN-63

HDAC-IN-63 (Compound 63) 是一种双重 FLT3/HDAC 抑制剂 (IC50: 对 FLT3 和 HDAC1 分别为 0.844 和 30.0 nM)。HDAC-IN-63 抑制 MV4-11 细胞增殖 (IC50: 92 nM。HDAC-IN-63在 MV4-11 细胞中诱导细胞凋亡 (apoptosis) 并阻滞细胞周期。HDAC-IN-63 可用于急性髓系白血病 (AML) 的研究。

• CAS号：2920046-95-1
• 分子式：C₂₅H₂₆Cl₂N₆O₃
• 分子量：529.42
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

白藜芦醇

Resveratrol (SRT 501) 是一种天然多酚,具有抗氧化,抗炎,保护心脏和抗癌的特性。 它的靶点广泛,如 mTOR,JAK,β-amyloid。

• CAS号：501-36-0
• 分子式：C₁₄H₁₂O₃
• 分子量：228.243
• 类别：细菌

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：449.1±14.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：253-255°C
• 闪点：222.3±14.7 °C

Derrone

Derrone是一种异黄酮异丙酚,是一种极光激酶抑制剂,对极光B和极光a的IC50值分别为6和22.3μM。德龙具有抗肿瘤活性[1][2]。

• CAS号：76166-59-1
• 分子式：C₂₀H₁₆O₅
• 分子量：336.34
• 类别：极光激酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：584.1±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：214.6±23.6 °C

DC-05

DC-05 是一种 DNMT1 抑制剂,IC50 和 Kd 值分别为 10.3 μM 和 1.09 μM。

• CAS号：890643-16-0
• 分子式：C₂₅H₂₅N₃O
• 分子量：383.486
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：667.5±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：357.5±31.5 °C

Benzyl selenocyanate

Benzyl selenocyanate 是一种化学预防剂,用于动物模型中各种化学诱导肿瘤的启动和启动后阶段。Benzyl selenocyanate 是一种 Mtase 抑制剂,其 IC50 值为 8.4 µM 。

• CAS号：4671-93-6
• 分子式：C₈H₇NSe
• 分子量：196.10800
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：276.7ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：121.2ºC

Tefinostat

Tefinostat (CHR-2845) 是一种单核细胞/巨噬细胞靶向的 HDAC 广谱抑制剂,通过细胞内酯酶人羧酸酯酶-1 (hCE-1) 切割成活性酸 CHR-2847。具有抗抗单核细胞系白血病活性。

• CAS号：914382-60-8
• 分子式：C₂₈H₃₇N₃O₅
• 分子量：495.61000
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TAK-632

TAK-632 是一种有效的 pan-RAF 抑制剂,作用于 CRAF,BRAFV600E 和 BRAFWT,IC50 分别为 1.4,2.4 和 8.3 nM。

• CAS号：1228591-30-7
• 分子式：C₂₇H₁₈F₄N₄O₃S
• 分子量：554.515
• 类别：极光激酶

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bisindolylmaleimide IX (Ro 31-8220 Mesylate)

Ro 31-8220 mesylate 是一种有效的 PKC 抑制剂,抑制 PKCα,PKCβI,PKCβII,PKCγ,PKCε 和大鼠大脑 PKC 的 IC50 值为 5,24,14,27,24 和 23 nM,也可抑制 MAPKAP-K1b,MSK1,S6K1 和 GSK3β,IC50为3,8,15,38 nM。

• CAS号：138489-18-6
• 分子式：C₂₆H₂₇N₅O₅S₂
• 分子量：553.65
• 类别：PKC

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

牛奶树碱

Hispidin 是一种 PKC 抑制剂,是一种产自 Phellinus linteus 的酚类化合物,具有很强的抗氧化、抗癌、抗糖尿病和抗痴呆作用。

• CAS号：555-55-5
• 分子式：C₁₃H₁₀O₅
• 分子量：246.21500
• 类别：PKC

• 密度：1.657g/cm3
• 沸点：554.2ºC at 760 mmHg
• 熔点：312-315ºC
• 闪点：220.1ºC

SR-0813

SR-0813是一种有效的选择性ENL/AF9酵母结构域抑制剂。SR-0813对ENL叶芝结构域的IC50和EC50值分别为25 nM和205 nM。SR-0813的AF9 YEATS结构域的IC50和EC50值分别为311nm和76nm(CETSA)。SR-0813结合MAP3K19的亲和力(Kd=3.5μM)比ENL-YEATS(Kd=30nm)低100倍以上。SR-0813可用于急性白血病的研究[1]。

• CAS号：2597186-19-9
• 分子式：C₂₅H₃₂N₆O₃S
• 分子量：496.62
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC-IN-39

HDAC-IN-39(化合物16c)是一种有效的HDAC抑制剂,IC50值分别为1.07μM(HDAC1)、1.47μM(HDAC2)和2.27μM(HDAC3)。HDAC-IN-39也显著抑制微管聚合。HDAC-IN-39诱导细胞周期阻滞在G2/M期。HDAC-IN-39对耐药癌细胞显示出良好的抗癌活性[1]。

• CAS号：2414046-33-4
• 分子式：C₂₇H₂₆N₄O₄S
• 分子量：502.58
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK8814

GSK8814 是一种高效、选择性的 ATAD2/2B 溴代苯胺化学探针和抑制剂,结合常数pKd=8.1,在 BROMOscan 中的 pKi=8.9。GSK8814 分别以 7.3 和 4.6 的 pIC50 与 ATAD2 和 BRD4 BD1 结合。GSK8814 对 ATAD2 的选择性是 BRD4 BD1 的 500 倍。

• CAS号：1997369-78-4
• 分子式：C₂₈H₃₅F₂N₅O₃
• 分子量：527.61
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK-J4 hydrochloride

GSK-J4 hydrochloride 是一种有效的 H3K27me3/me2 去甲基化酶 JMJD3/KDM6B 和 UTX/KDM6A 双抑制剂,IC50 分别为 8.6 μM 和 6.6 μM。GSK-J4 hydrochloride 抑制 LPS 诱导的人原代巨噬细胞产生 TNF-α,IC50 值为 9 μM。GSK-J4 hydrochloride 是 GSK-J1 的细胞通透性前药。

• CAS号：1797983-09-5
• 分子式：C₂₄H₂₈ClN₅O₂
• 分子量：453.964
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ABBV-712

ABBV-712 是一种选择性酪氨酸激酶 2 (TYK2) 抑制剂,IC50 为 0.195 μM,在自身免疫性疾病中发挥重要作用。

• CAS号：2368945-27-9
• 分子式：C₂₄H₂₈N₄O₅
• 分子量：452.50
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Basroparib

Basroparib是一种有效的聚(ADP核糖)聚合酶(PARP)抑制剂,具有抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：1858179-75-5
• 分子式：C₁₈H₂₁F₂N₇O₃
• 分子量：421.40
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

5-氨基-2H-异喹啉-1-酮

5-AIQ(5-氨基异喹啉-1-酮)是一种水溶性PARP-1抑制剂。5-AIQ是各种药物中的重要功能基团。5-AIQ可减少肝脏缺血再灌注相关的组织损伤,可用于研究肝脏缺血再灌流相关的治疗条件[1][2]。

• CAS号：93117-08-9
• 分子式：C₉H₈N₂O
• 分子量：160.173
• 类别：PARP

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：477.3±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：242.4±28.7 °C

PRMT5-IN-12

PRMT5-IN-12对PRMT5具有显著的抑制活性。

• CAS号：2568927-94-4
• 分子式：C₃₂H₄₀N₄O₄
• 分子量：544.68
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK9311 hydrochloride

GSK9311 hydrochloride 是一种活性较低的 GSK6853 类似物,可用作阴性对照。GSK9311 hydrochloride 抑制 BRPF 溴结构域,对 BRPF1 和 BRPF2 的 pIC50 值分别为 6.0 和 4.3。

• CAS号：2253733-09-2
• 分子式：C₂₄H₃₂ClN₅O₃
• 分子量：474.00
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(4-氯苯基)[4-(8-硝基-5-喹啉基)-1-哌嗪基]甲酮

SIRT2-IN-8是一种有效的SIRT2抑制剂。SIRT2-IN-8可用于亨廷顿病和帕金森病研究[1]。

• CAS号：115687-05-3
• 分子式：C₂₀H₁₇ClN₄O₃
• 分子量：396.83
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.4±0.1g/cm3
• 沸点：645.5±55.0°C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：344.2±31.5°C

OARV-771

OARV-771是一种基于VHL的BET降解剂(PROTAC),具有改善的细胞通透性。OARV-771显示Brd4、Brd2和Brd3的DC50分别为6、1和4nm[1]。

• CAS号：2683008-37-7
• 分子式：C₄₉H₅₉ClN₈O₈S₂
• 分子量：987.62
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

I-BET151 dihydrochloride

I-BET151二盐酸盐(GSK1210151A二盐酸盐)是一种BET溴代烷抑制剂,其抑制BRD4、BRD2和BRD3的pIC50分别为6.1、6.3和6.6[1][2]。

• CAS号：1883545-47-8
• 分子式：C₂₃H₂₃Cl₂N₅O₃
• 分子量：488.366
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JGB1741

JGB1741(ILS-JGB-1741)是一种有效的特异性SIRT1活性抑制剂,IC50为∼15μM。JGB1741是一种弱的SIRT2和SIRT3抑制剂,所有IC50>100μM。JGB1741通过调节Bax/Bcl2比率、细胞色素c释放和PARP切割增加乙酰化p53水平,导致p53介导的凋亡。JGB1741具有乳腺癌研究的潜力[1]。

• CAS号：1256375-38-8
• 分子式：C₂₇H₂₄N₂O₂S
• 分子量：440.56
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：700.2±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：377.3±32.9 °C

SIRT1/2/3-IN-1

SIRT1/2/3-IN-1(化合物10)是SIRT1、SIRT2和SIRT3的高效、选择性和细胞渗透性抑制剂,IC50分别为0.54、0.253和0.72μM。SIRT1/2/3-IN-1(化合物10)可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2413212-06-1
• 分子式：C₄₆H₆₃N₉O₈S₂
• 分子量：934.18
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

VinSpinIn

VinSpinIn 是一种 Spindlin1 抑制剂 (KD: 对 SPIN149-262 为 9.9 nM)。VinSpinIn 是 Spindlin1 tudor 结构域的化学探针。VinSpinIn 可用于研究染色质功能。

• CAS号：2380021-98-5
• 分子式：C₄₂H₅₈N₈O₄
• 分子量：738.96
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(6S)-4-(4-氯苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-F][1,2,4]噻唑并[4,3-A][1,4]二氮杂卓-6-乙酸

JQ-1 carboxylic acid是高效,选择性和细胞渗透性的 BRD4 抑制剂,抑制 BRD4(1) 和 BRD4(2) 的 IC50 分别为77 nM 和 33 nM。

• CAS号：202592-23-2
• 分子式：C₁₉H₁₇ClN₄O₂S
• 分子量：400.882
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：661.6±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：353.9±34.3 °C