表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

(3β,5α,6β)-Androstane-3,5,6-triol

5α-雄甾烷-3β,5,6β-三醇是一种神经保护剂。5α-雄甾烷-3β,5,6β-三醇可通过抑制AMPK信号传导显著逆转细胞内酸化,减轻神经元损伤。5α-雄甾烷-3β,5,6β-三醇在体内大脑中动脉闭塞急性缺血性卒中模型中显著减少梗死体积并减轻神经损伤[1]。

• CAS号：4725-51-3
• 分子式：C₁₉H₃₂O₃
• 分子量：308.456
• 类别：AMPK

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：430.1±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：193.1±20.5 °C

Aurora kinase inhibitor-9

Aurora激酶抑制剂-9(化合物9d)是一种有效的Aurora/B双Aurora激酶抑制剂,对Aurora a和Aurora B的IC50s分别为0.093和0.09µM。极光激酶抑制剂-9具有广谱抗增殖活性[1]。

• CAS号：2419107-09-6
• 分子式：C₁₉H₁₇Cl₂N₃O₄S
• 分子量：454.33
• 类别：极光激酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD9-binding moiety 5

PROTAC BRD9结合部分5是一种选择性BRD9粘合剂,IC50值为4.20μM,可用于合成PROTAC。PROTAC BRD9结合部分5对癌细胞具有抗增殖活性[1]。

• CAS号：893633-37-9
• 分子式：C₁₉H₁₈N₆O
• 分子量：346.39
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PBRM1-BD2-IN-4

PBRM1-BD2-IN-4(化合物15)是一种有效的PBRM1-溴代甲烷抑制剂,PBRM1-BD 2和PBRM1-BD5的Kd值分别为5.5μM和11.1μM,PBRM2-BD2的IC50值为0.2μM。

• CAS号：2819989-60-9
• 分子式：C₁₅H₁₃ClN₂O
• 分子量：272.73
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK-IN-31

JAK-IN-31 (实施例 75) 是一种 JAK 抑制剂,其对 JAK1、JAK2、JAK3 以及 Tyk2 的 IC50 范围分别为 ≤0.01µM、≤0.01µM、0.01-0.1 µM、≤0.01µM。JAK-IN-31 可用于癌症的研究。

• CAS号：2597016-88-9
• 分子式：C₂₁H₁₉N₇O₂S₂
• 分子量：465.55
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-甲氧基-N-(3-甲基-2-氧代-1,2,3,4-四氢喹唑啉-6-基)苯磺酰胺

PFI-1 是一种有效的 BET 抑制剂,能够有效抑制 BRD4,IC50 值为 0.22 μM。

• CAS号：1403764-72-6
• 分子式：C₁₆H₁₇N₃O₄S
• 分子量：347.389
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BChE/HDAC6-IN-1

BChE/HDAC6-IN-1 是一种有效的选择性双 BChE/HDAC6 抑制剂,其 IC50 值分别为 4 nM 和 8.9 nM。BChE/HDAC6-IN-1 可改善 aβ1-42 诱导的小鼠模型的认知功能障碍,并具有用于 AD 研究的潜力。

• CAS号：2925457-27-6
• 分子式：C₃₄H₄₃N₅O₅
• 分子量：601.74
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Deuruxolitinib

Deruxolitinib(CTP-543)是一种氘化的Ruxolitinib,调节JAK1/JAK2的活性。Deruxolitinib可用于研究脱发疾病(来自专利WO2017192905A1,化合物I)[1]。

• CAS号：1513883-39-0
• 分子式：C₁₇H₁₀D₈N₆
• 分子量：314.41
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC/HSP90-IN-3

HDAC/HSP90-IN-3(化合物J5)是一种高效、选择性真菌HSP90和HDAC双重抑制剂,IC50值分别为0.83和0.91μM。HDAC/HSP90-IN-3对耐唑白色念珠菌具有抗真菌活性。HDAC/HSP90-IN-3可以抑制重要的毒力因子,下调耐药基因ERG11和CDR1【1】。

• CAS号：2700035-54-5
• 分子式：C₂₆H₃₃N₅O₆
• 分子量：511.57
• 类别：真菌

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-[1-(4,4-二氟环己基)-4-哌啶基]-6-氟-2,3-二氢-3-氧代-1H-异吲哚-4-甲酰胺

NMS-P118是一种有效的,口服可用的,高选择性的PARP-1抑制剂,在HeLa细胞中的IC50值为0.04 μM。

• CAS号：1262417-51-5
• 分子式：C₂₀H₂₄F₃N₃O₂
• 分子量：395.42
• 类别：PARP

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：508.3±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：261.2±30.1 °C

BI 2536

BI 2536是 PLK1 和 BRD4 的双抑制剂,IC50 分别为0.83 和 25 nM。

• CAS号：755038-02-9
• 分子式：C₂₈H₃₉N₇O₃
• 分子量：521.654
• 类别：Polo样激酶(PLK)

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Simmiparib

Simmiparib是一种新型有效的口服活性PARP1/2抑制剂,IC50为1.75/0.22 nM,抑制PARP1的效力比其他PARP(PARP3,TNKS1,TNKS2)高90倍；选择性诱导DNA双链断裂的积累,同源重组修复(HR)缺陷细胞中G2/M阻滞和凋亡；增强增殖抑制几种常规抗癌药物,减少HR缺陷癌细胞和异种移植物中聚(ADP-核糖)的形成；表现出比奥拉帕尼对裸鼠中HR缺陷的人癌细胞或组织衍生的异种移植物的生长抑制高10倍。实体瘤1期临床

• CAS号：1551355-46-4
• 分子式：C₂₃H₁₈F₄N₆O₂
• 分子量：486.431
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK-IN-34

JAK-IN-34 可有效对抗 JAKs,IC50 值为 0.40、0.83、2.10、1.95 nM 分别靶标 JAK1 、JAK2、JAK3、TYK2。 JAK-IN-34 可减少关节肿胀,且安全性良好。

• CAS号：2068766-90-3
• 分子式：C₂₇H₂₆N₆O
• 分子量：450.53
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SB-218078

SB-218078 是一种有效的,选择性的且细胞可渗透的检查点激酶 1 (Chk1) 抑制剂,可抑制 cdc25C 的 Chk1 磷酸化,IC50 为 15 nM。SB-218078 对 Cdc2 (IC50 为 250 nM) 和 PKC (IC50 为 1000 nM) 的抑制作用较弱。SB-218078 通过 DNA 损伤和细胞周期停滞诱导细胞凋亡。

• CAS号：135897-06-2
• 分子式：C₂₄H₁₅N₃O₃
• 分子量：393.39400
• 类别：CDK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK3共价抑制剂-1

JAK3 covalent inhibitor-1 是一种 janus 激酶 3 (JAK3) 共价抑制剂,IC50 值为 11 nM,比其他的 JAK 激酶的选择性高 246 倍。

• CAS号：2300106-50-5
• 分子式：C₂₂H₁₇FN₆O₂S
• 分子量：448.47
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromodomain IN-2

BD-IN-1是一种泛溴结构域(BD)抑制剂,BRD4(1)、CBP、BRPF1B、BRD7、BRD9、BRDT(1)和CECR2的KD值分别为25042013043067240970nM。BD-IN-1显示出抗增殖活性[1]。

• CAS号：2445335-77-1
• 分子式：C₁₆H₁₇ClN₂O
• 分子量：288.77
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD4-BD1-IN-2

BRD4-BD1-IN-2是一种选择性BRD4-DD1抑制剂,其IC50为2.51µM(比BD2大20倍)。BRD4-BD1-IN-2可用于癌症和心血管疾病的研究[1]。

• CAS号：2761321-26-8
• 分子式：C₂₀H₁₅Br₃N₄O₂
• 分子量：583.07
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Olaparib D5

Olaparib D5 (AZD2281 D5) 是一种氘代物化合物。Olaparib 是一种有效的 PARP 抑制剂。

• CAS号：2143107-56-4
• 分子式：C₂₄H₁₈D₅FN₄O₃
• 分子量：439.49
• 类别：自噬

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BMS-986158

BMS-986158 是一种溴结构域和额外末端结构域 (BET) 蛋白抑制剂。

• CAS号：1800340-40-2
• 分子式：C₃₀H₃₃N₅O₂
• 分子量：495.62
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD-6929

BRD-6929 (Cpd-60) 是 HDAC1 和 HDAC2 的脑渗透性选择性抑制剂 (IC50= 1 和 8 nM),源于专利文献 US2018360927。BRD-6929 (Cpd-60) 对 HDAC1 和 HDAC2 有高亲和力 (Ki = 0.2 和 1.5 nM)。BRD-6929 (TPB) 增强了 gnidimacrin (PKC 激动剂) 对潜伏 HIV 的功效。

• CAS号：849234-64-6
• 分子式：C₁₉H₁₇N₃O₂S
• 分子量：351.42200
• 类别：HIV

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-羟基-2-[4-(2-萘基磺酰基)-1-哌嗪基]-5-嘧啶甲酰胺

JNJ-16241199 是一种具有口服活性的选择性 hydroxamate-based histone deacetylase (HDAC) 抑制剂,对 HDAC 1 和 HDAC8 的IC50 分别为 3.3 nM 和 23 nM。JNJ-16241199 诱导组蛋白 3 乙酰化,并显著上调 A2780 卵巢癌细胞中 p21waf1, cip1 的表达。JNJ-16241199 诱导细胞凋亡 (cell apoptosis),并在多种人类恶性肿瘤中显示抗癌活性。JNJ-16241199 可用于癌症研究。

• CAS号：604769-01-9
• 分子式：C₁₉H₁₉N₅O₄S
• 分子量：413.45
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK106

GSK106是选择性PAD4抑制剂GSK484和GSK199的非活性对照物【1】。

• CAS号：1652591-82-6
• 分子式：C₂₄H₂₈ClN₅O
• 分子量：437.97
• 类别：癌症

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

反式-2-(苯基-d5)-环丙胺盐酸盐

(rel)-Tranylcypromine D5 hydrochloride (2-Phenylcyclopropylamine D5 hydrochloride) 是 (rel)-Tranylcypromine hydrochloride 的氘代物。(rel)-Tranylcypromine hydrochloride 是一种不可逆的非选择性单胺氧化酶 (MAO) 抑制剂,用于治疗抑郁症。(rel)-Tranylcypromine hydrochloride 还是一种赖氨酸特异性脱甲基酶 1 (LSD1) 抑制剂,可抑制病变的生长并改善患有子宫内膜异位症的小鼠的全身痛觉过敏。

• CAS号：107077-98-5
• 分子式：C₉H₇D₅ClN
• 分子量：174.68200
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：162-169ºC
• 闪点：N/A

MDL-800

MDL-800 是 SIRT6 去乙酰化的活化剂,EC50 值为10.3 μM。

• CAS号：2275619-53-7
• 分子式：C₂₁H₁₆BrCl₂FN₂O₆S₂
• 分子量：626.30
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MTL-CEBPA

MTL-CEPBA 是一种靶向 C/EBPα 上调的小活化 RNA。MTL-CEPBA 具有抗炎和抗癌活性。

• CAS号：2862057-05-2
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：微RNA

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AJH-836

AJH-836 是 Munc13-1 和 PKC ε/α 的激活剂 (Kd: 4.5 nM PKCα)。AJH-836 触发 Munc13-1 从细胞质易位到质膜。AJH-836 可用于神经退行性疾病研究。

• CAS号：388621-67-8
• 分子式：C₂₂H₃₈O₅
• 分子量：382.53
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK621

GSK621 是特异性的 AMPK 激动剂,其对 AML 细胞系的IC50 值为13-30 μM。GSK621 可诱导自噬和凋亡。GSK621 可诱导eiF2α 磷酸化 (UPR 激活的一个标志)。

• CAS号：1346607-05-3
• 分子式：C₂₆H₂₀ClN₃O₅
• 分子量：489.907
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PR5-LL-CM01

PR5-LL-CM01是PRMT5甲基转移酶的新型选择性小分子抑制剂,IC50为7.5 uM；显示出比PRMT3高10倍的选择性,对PRMT1/4/6/8没有抑制活性；表现出细胞活力抑制PDAC细胞IC50为2-4 uM,CRC细胞IC50为10-11 uM,比EPZ015666更有效；显着抑制PDAC和CRC细胞中的NF-κB活化,并在体内显示出显着的抗肿瘤功效。

• CAS号：1005307-86-7
• 分子式：C₂₃H₂₇N₇
• 分子量：401.518
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ML192

ML192是GPR55的选择性配体拮抗剂。ML192抑制β-arrestin转运、ERK1/2磷酸化和PKCβII易位[1]。

• CAS号：460331-61-7
• 分子式：C₂₀H₂₂N₄O₂S
• 分子量：382.479
• 类别：PKC

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MS1943

MS1943 是一种一流的,具有口服生物活性的 EZH2 选择性降解剂,其IC50 为 120 nM。MS1943 显著降低了许多三阴性乳腺癌和其他癌及非癌细胞系中的EZH2蛋白水平。MS1943 有效地阻止了多个三阴性乳腺癌和其他癌细胞系的增殖。

• CAS号：2225938-17-8
• 分子式：C₄₂H₅₄N₈O₃
• 分子量：718.93
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A