蛋白裂解靶向嵌合体

针对嵌合分子的PROTAC或蛋白水解是异双功能纳米分子，理论上针对任何蛋白质进行泛素化和降解。就结构而言，PROTAC由一个被E3连接酶识别的部分组成。然后将该部分化学和共价连接到识别靶蛋白的小分子或蛋白质上。三聚体复合物形成导致遍在蛋白转移至靶蛋白。

通过直接去除靶蛋白而不仅仅是阻断它们，PROTAC可以提供优于小分子抑制剂的多种优势，小分子抑制剂可能需要高全身暴露以实现充分的抑制，通常导致毒副作用和最终的耐药性。 PROTAC分子具有良好的组织分布和靶向细胞内蛋白质的能力，因此可以直接应用于细胞或注射到动物中而不使用载体。

使用PROTAC技术的靶向蛋白质降解作为一种新的治疗方法正在出现，以解决由致病蛋白异常表达驱动的疾病，例如癌症。除了使用PROTAC治疗人类疾病外，这些分子还提供了一种化学遗传方法来“敲低”蛋白质来研究它们的功能。目前，已经发现几种小分子抑制剂通过特异性靶向BET，雌激素受体（ER），雄激素受体等而显示出良好的生物活性。

参考文献：
[1] Sakamoto KM. Pediatr Res. 2010 May;67(5):505-8.
[2] Neklesa TK, et al. Pharmacol Ther. 2017 Jun;174:138-144.

endo-BCN-PEG8-acid

endo-BCN-PEG8-acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2126805-02-3
• 分子式：C₃₀H₅₁NO₁₂
• 分子量：617.73
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

S-acetyl-PEG5-alcohol

S-乙酰-PEG5-醇是一种基于PEG的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1]。

• CAS号：1000415-61-1
• 分子式：C₁₂H₂₄O₆S
• 分子量：296.38
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NH2-C2-NH-Boc-d4

NH2-C2-NH-Boc-d4是氘标记的NH2-C2-NH-Boc[1]。NH2-C2-NH-Boc(PROTAC连接体22)是一种基于烷基链的PROTAC接头,可用于合成PROTAC[2]。

• CAS号：509148-73-6
• 分子式：C₇H₁₂D₄N₂O₂
• 分子量：164.239
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：252.8±23.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：106.7±22.6 °C

N-Methyl-N'-(hydroxy-PEG2)-Cy5

N-Methyl-N'-(hydroxy-PEG2)-Cy5 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2107273-22-1
• 分子式：C₃₂H₄₁ClN₂O₃
• 分子量：537.13
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azide-PEG12-Tos

Azide-PEG12-Tos 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1821464-56-5
• 分子式：C₃₁H₅₅N₃O₁₄S
• 分子量：725.85
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮-三聚乙二醇

Azido-PEG3-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC。

• CAS号：86520-52-7
• 分子式：C₆H₁₃N₃O₃
• 分子量：175.18600
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：-33℃

Thalidomide-NH-C4-NH2 TFA

Thalidomide-NH-C4-NH2 TFA (compound 29c) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker 偶联物,包含基于 Thalidomide 的 cereblon 配体和 linker,用于合成PROTAC BRD2/BRD4 degrader-1 (HY-130612)。PROTAC-BRD2/BRD4 降解剂-1是一种高效、选择性的 BET 蛋白 BRD4 和 BRD2 降解剂。

• CAS号：2093387-50-7
• 分子式：C₁₉H₂₁F₃N₄O₆
• 分子量：458.39
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AU-15330

AU-15330是SWI/SNF ATP酶亚单位SMARCA2和SMARCA4的蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)降解物。AU-15330在前列腺癌异种移植模型中诱导对肿瘤生长的有效抑制,并与AR拮抗剂恩扎鲁胺协同作用。AU-15330在无毒性的去势耐受性前列腺癌(CRPC)模型中诱导疾病缓解[1]。

• CAS号：2380274-50-8
• 分子式：C₃₉H₄₉N₉O₅S
• 分子量：755.93
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Lenalidomide-d5

来那度胺-d5是氘标记的来那度胺。来那度胺(CC-5013)是沙利度胺的衍生物,用作分子粘合剂。来那度胺是一种口服活性免疫调节剂。来那度胺(CC-5013)是泛素E3连接酶cereblon(CRBN)的配体,可通过CRBN-CRL4泛素连接酶选择性泛素化和降解两种淋巴转录因子IKZF1和IKZF3。来那度胺(CC-5013)特异性抑制成熟B细胞淋巴瘤(包括多发性骨髓瘤)的生长,并诱导T细胞释放IL-2[1][2]。

• CAS号：1227162-34-6
• 分子式：C₁₃H₈D₅N₃O₃
• 分子量：264.29
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：614.0±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：325.1±31.5 °C

NH-bis(PEG2-C2-Boc)

NH-bis(PEG2-C2-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1964503-36-3
• 分子式：C₂₂H₄₃NO₈
• 分子量：449.58
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCO4-PEG2-Maleimide

TCO4-PEG2-Maleimide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。TCO4-PEG2-Maleimide 含有 TCO 和 Maleimide 基团,可分别与 tetrazine 基或硫氧基 (thiol group) 发生特异性“click”反应,或“巯基-丙烯酰胺”反应。

• CAS号：2141981-85-1
• 分子式：C₂₂H₃₃N₃O₇
• 分子量：451.51
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azido-PEG2-C6-Cl

Azido-PEG2-C6-Cl 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2568146-55-2
• 分子式：C₁₀H₂₀ClN₃O₂
• 分子量：249.74
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BSJ-03-204

BSJ-03-204 是一种有效的,选择性的基于 Palbociclib (HY-50767) 的 CDK4/6 双重降解剂 (PROTAC),对 CDK4/D1 和 CDK6/D1 的 IC50 分别为 26.9 nM 和 10.4 nM。BSJ-03-204 不诱导 IKZF1/3 降解,具有抗癌活性。

• CAS号：2349356-09-6
• 分子式：C₄₃H₄₈N₁₀O₈
• 分子量：832.90
• 类别：CDK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromo-PEG5-azide

Bromo-PEG6-azide 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1402411-90-8
• 分子式：C₁₂H₂₄BrN₃O₅
• 分子量：370.24
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Amino-PEG9-alcohol

Amino-PEG9-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类,可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：15332-95-3
• 分子式：C₁₈H₃₉NO₉
• 分子量：413.50
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-Mal-N-bis(PEG4-NH-Boc)

N-Mal-N-bis(PEG4-NH-Boc) 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2128735-27-1
• 分子式：C₃₇H₆₆N₄O₁₅
• 分子量：806.94
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

四甘醇单苄醚

BnO-PEG4-OH 是一种基于PEG 的 PROTAC linker,可用于 PROTAC 的合成。

• CAS号：86259-87-2
• 分子式：C₁₅H₂₄O₅
• 分子量：284.348
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：398.7±32.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：194.9±25.1 °C

t-Boc-Aminooxy-PEG3-alcohol

t-Boc-Aminooxy-PEG3-alcohol 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：252378-66-8
• 分子式：C₁₁H₂₃NO₆
• 分子量：265.303
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Tetrazine-Ph-PEG5-NHS ester

Tetrazine-Ph-PEG5-NHS ester 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1682653-80-0
• 分子式：C₂₇H₃₆N₆O₁₀
• 分子量：604.609
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Thalidomide-NH-PEG2-C2-NH-Boc

Thalidomide-NH-PEG2-C2-NH-Boc 是一种合成的 E3 连接酶配体-连接体偶联物,结合了基于 Thalidomide 的 Cereblon 配体和一个PEG Linker,可用于 dBRD9 (化合物 6) 合成。dBRD9 是一种选择性 BRD9 PROTAC 探针。

• CAS号：2097509-40-3
• 分子式：C₂₄H₃₂N₄O₈
• 分子量：504.53
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二十二烷二酸

二十二碳二烯酸是一种不可切割的ADC连接物,用于合成抗体药物结合物(ADC)。二十二碳二烯酸也是一种基于烷基链的PROTAC连接剂,可用于合成PROTAC[1][2]。

• CAS号：505-56-6
• 分子式：C₂₂H₄₂O₄
• 分子量：370.566
• 类别：ADC连接器

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：527.0±23.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：72-80 °C(lit.)
• 闪点：286.6±19.1 °C

PROTAC FLT-3降解剂1

PROTAC FLT-3 degrader 1 是 FLT-3内部串联重复 (ITD) 降解剂,IC50为0.6 nM。抗增殖,诱导凋亡活性。

• CAS号：2230826-81-8
• 分子式：C₅₂H₆₁N₉O₉S₂
• 分子量：1020.23
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

叠氮-五聚乙二醇-丙酸叔丁酯

Azide-PEG5-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1415800-41-7
• 分子式：C₁₇H₃₃N₃O₇
• 分子量：391.460
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bromo-PEG3-C2-phosphonic acid

Bromo-PEG3-C2-phosphonic acid 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：1148026-99-6
• 分子式：C₈H₁₈BrO₆P
• 分子量：321.103
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：458.1±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：230.9±31.5 °C

Thalidomide-5-O-C2-NH2 hydrochloride

Thalidomide-5-O-C2-NH2 hydrochloride 是一种基于 Thalidomide (HY-14658) 的,可募集 CRBN 蛋白的 cereblon 配体。Thalidomide-5-O-C2-NH2 hydrochloride 可通过 linker 与靶蛋白配体连接,形成 PROTAC 分子。例如 THAL-SNS-032 (HY-123937)。

• CAS号：2694727-89-2
• 分子式：C₁₅H₁₆ClN₃O₅
• 分子量：353.76
• 类别：E3 Ligase的配体

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

生物素化-epsilon-氨基己酸-N-羟基丁二酰亚胺活化酯

Biotin-C5-NHS Ester 是一种 PROTAC linker,属于 alkyl/ether 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：72040-63-2
• 分子式：C₂₀H₃₀N₄O₆S
• 分子量：454.540
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：169-171 °C
• 闪点：N/A

PROTAC Linker 9

PROTAC Linker 9 是一种 PROTAC 连接桥,属于 alkyl/ether 类。PROTAC Linker 9 可用于合成一系列 PROTAC 分子。PROTAC 分子含有两个通过连接桥连接的不同配体; 一种是 E3 泛素连接酶配体,另一种是靶蛋白配体。PROTAC 利用细胞内泛素-蛋白酶体系统选择性降解靶蛋白。

• CAS号：206265-94-3
• 分子式：C₁₈H₂₉NO₇S
• 分子量：403.49000
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ERD-3111

ERD-3111 (Compound 44) 是一种具有口服活性的 PROTAC ERα 降解剂 (DC50: 0.5 nM)。ERD-3111 可抑制具有野生型 ER 的亲本 MCF-7 异种移植模型和两种临床相关的 ESR1 突变小鼠模型中的肿瘤生长。ERD-3111 可用于 ER+乳腺癌的研究。

• CAS号：2832865-25-3
• 分子式：C₄₅H₄₆F₄N₈O₅
• 分子量：854.89
• 类别：PROTAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S,R,S)-AHPC-C7-amine

(S,R,S)-AHPC-C7-amine (VH032-C7-amine) 是一种合成的 E3 连接酶配体-linker (E3 ligase ligand-linker conjugate) 偶联物,包含基于 VH032 的 VHL 配体和 1 个 linker。(S,R,S)-AHPC-C7-amine 可用于合成靶向 ERRα 的 PROTAC 降解剂。

• CAS号：2306389-04-6
• 分子式：C₃₀H₄₅N₅O₄S
• 分子量：571.77
• 类别：E3 Ligase Ligand-Linker Conjugate

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Azidoethyl-SS-PEG2-Boc

Azidoethyl-SS-PEG2-Boc 是一种 PROTAC linker,属于 PEG 类。可用于合成 PROTAC 分子。

• CAS号：2144777-83-1
• 分子式：C₁₃H₂₅N₃O₄S₂
• 分子量：351.49
• 类别：PROTAC Linker

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A