表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

贝派度酸

ETC-1002 是 AMPK 的激活剂。

• CAS号：738606-46-7
• 分子式：C₁₉H₃₆O₅
• 分子量：344.48600
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-[(1,2-二氢-6-甲基-2-氧代-4-丙基-3-吡啶基)甲基]-1-(1-甲基乙基)-6-[6-[4-(1-甲基乙基)-1-哌嗪基]-3-吡啶基]-1H-吲唑-4-甲酰胺

UNC1999 是一种有效,选择性和SAM-竞争性的 EZH2 和 EZH1 抑制剂,IC50 分别为 10 nM 和 45 nM。

• CAS号：1431612-23-5
• 分子式：C₃₃H₄₃N₇O₂
• 分子量：569.740
• 类别：自噬

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：804.7±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：440.4±34.3 °C

Tyk2-IN-9

Tyk2-IN-9(化合物26)是一种选择性Tyk-2抑制剂,对于Tyk2-JH2和JAK1-JH2,IC50s分别为0.076和1.8 nM。Tyk2-IN-9可用于炎症或自身免疫性疾病的研究[1]。

• CAS号：2694816-85-6
• 分子式：C₂₁H₂₅N₉O₃
• 分子量：451.48
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Psychosine-d5

精神碱-d5是氘标记的精神碱。精神碱是半乳糖苷酶(GALC)的底物,是克拉贝病的潜在生物标志物。精神药物是一种高度细胞毒性的脂质,能够在多种细胞中诱导细胞死亡。

• CAS号：2260670-12-8
• 分子式：C₂₄H₄₂D₅NO₇
• 分子量：466.66
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

WAY-323062

SIRT2-IN-9(化合物12)是SRIT2的选择性抑制剂,IC50值为1.3μM。SIRT2-IN-9抑制MCF-7乳腺癌细胞的增殖活性。SIRT2-IN-9可用于癌症研究[1]。

• CAS号：522650-91-5
• 分子式：C₂₁H₂₂N₆OS₂
• 分子量：438.57
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-15

PROTAC BRD4降解剂-15是一种有效的BRD4降解剂,BRD4 BD1和BD2的IC50分别为7.2 nM和8.1 nM。PROTAC BRD4降解剂-15能够有效降解PC3前列腺癌细胞中的BRD4蛋白[1]。

• CAS号：2417370-67-1
• 分子式：C₅₇H₆₂F₂N₁₀O₁₀S₂
• 分子量：1149.29
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

2-[[(2-羟基-1-萘基)亚甲基]氨基]-N-(1-苯基乙基)苯甲酰胺

Sirtinol 是 sirtuin 的抑制剂,对 ySir2,hSIRT2 和 hSIRT2 的 IC50 值分别为 48 μM,57.7 μM 和 131 μM。

• CAS号：410536-97-9
• 分子式：C₂₆H₂₂N₂O₂
• 分子量：394.465
• 类别：自噬

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：659.2±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：119-120℃
• 闪点：352.5±30.1 °C

1,2-Didecanoylglycerol

1,2-二癸酰甘油是一种合成的二酰甘油,由血小板代谢为1,2-二癸酰磷脂酸(PA10)并激活蛋白激酶C(PKC)[1][2]。

• CAS号：17863-69-3
• 分子式：C₂₃H₄₄O₅
• 分子量：400.59
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

4-苯基丁酸-d5

4-苯基丁酸-d5是氘标记的4-苯基丁酸[1]。4-苯基丁酸(4-PBA)是HDAC和内质网(ER)应激的抑制剂,用于癌症和感染研究[2][3][4]。

• CAS号：64138-52-9
• 分子式：C₁₀H₇D₅O₂
• 分子量：169.23
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

H-PHE-LYS-LYS-SER-PHE-LYS-LEU-NH2

FKKSFKL-NH2是一种蛋白激酶C选择性肽。FKKSFKL-NH2可用于各种生化的研究[1]。

• CAS号：137168-33-3
• 分子式：C₄₅H₇₃N₁₁O₈
• 分子量：896.130
• 类别：PKC

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：1275.7±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：725.3±34.3 °C

GSK232

GSK232是一种高选择性的纤维素渗透剂CECR2抑制剂,具有优异的物理化学性能。

• CAS号：2702984-69-6
• 分子式：C₂₁H₂₇ClN₆O₃S
• 分子量：479.00
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-硬脂酰基-2-花生四烯酰基-sn-甘油

1-硬脂酰-2-花生四烯醇-sn-甘油是一种含有多不饱和脂肪酸的二酰甘油(DAG)。1-硬脂酰-2-花生四烯醇-sn-甘油可激活PKC。1-硬脂酰-2-花生四烯醇-sn-甘油也能增强非选择性阳离子通道(NSCC)活性[1][2]。

• CAS号：65914-84-3
• 分子式：C₄₁H₇₂O₅
• 分子量：645.007
• 类别：PKC

• 密度：0.9±0.1 g/cm3
• 沸点：689.2±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：190.3±25.0 °C

Protein Kinase C (661-671)

蛋白激酶C(661-671)是蛋白激酶Cβ。PKC在细胞生长控制和肿瘤促进中发挥作用[1][2]。

• CAS号：149839-93-0
• 分子式：C₅₉H₈₇N₁₃O₁₉
• 分子量：1282.40
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-03622905

PF-03622905是一种有效的ATP竞争性PKC抑制剂,PKCα、PKCβI、PKCβII、PKCγ和PKCθ的IC50分别为5.6 nM、14.5 nM、13 nM、37.7 nM和74.1 nM。PF-03622905对PKC的特异性高于其他蛋白激酶[1]。

• CAS号：1072100-15-2
• 分子式：C₂₄H₃₅N₇O₃
• 分子量：469.58
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC6-IN-10

HDAC6-IN-10是一种高选择性HDAC6抑制剂,IC50为0.73 nM。HDAC6-IN-10的选择性是其他HDAC亚型的144～10941倍。HDAC6-IN-10对多发性骨髓瘤细胞具有抗增殖活性[1]。

• CAS号：2408286-73-5
• 分子式：C₂₁H₂₀N₄O₄
• 分子量：392.41
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD4-BD1/2-IN-2

BRD4-BD1/2-IN-2是一种有效的BRD4-BD2抑制剂,BRD4-BD2和BRD4-BD1的IC50分别小于0.5 nM和<300 nM(WO2021233371A1,化合物2)[1]。

• CAS号：2743464-27-7
• 分子式：C₃₀H₃₃N₅O₄
• 分子量：527.61
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-油酰基-2-乙酰基-sn-丙三醇

1-油酰-2-乙酰-sn甘油是一种合成的、细胞可渗透的二酰甘油类似物。1-油酰-2-乙酰-sn甘油激活钙依赖性蛋白激酶C(PKC)并诱导超氧化物的产生。

• CAS号：86390-77-4
• 分子式：C₂₃H₄₂O₅
• 分子量：398.577
• 类别：PKC

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：490.0±15.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：152.3±13.9 °C

MDL-811

MDL-811 是 SIRT6 的异构激活剂,可显著激活SIRT6 组蛋白 H3 的去乙酰化(H3K9Ac, H3K18Ac, 和 H3K56Ac)。MDL-811 可用以结肠癌的研究。

• CAS号：2275619-98-0
• 分子式：C₂₅H₂₅BrCl₂FN₃O₅S₂
• 分子量：681.42
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Antitumor agent-69

抗肿瘤剂69(化合物12)是DOT1L和MLL-AF9/MLL-ENL之间蛋白质-蛋白质相互作用的有效抑制剂,AF9和ENL的Kis分别为9 nM和109 nM。抗肿瘤剂-69具有抗癌细胞活性[1]。

• CAS号：2417651-42-2
• 分子式：C₄₃H₆₂N₈O₅
• 分子量：771.00
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PRMT5-IN-17

PRMT5-IN-17(化合物6)是一种具有抗肿瘤活性的PRMT5抑制剂。PRMT5是一种蛋白质精氨酸甲基转移酶,是一种与表观遗传修饰相关的新的抗肿瘤靶点[1]。

• CAS号：2755304-03-9
• 分子式：C₂₆H₃₃N₇O₂
• 分子量：475.59
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N-羟基-4-[(1,2,3,4-四氢-2-甲基-5H-吡啶并[4,3-b]吲哚-5-基)甲基]苯甲酰胺 2,2,2-三氟乙酸酯

Tubastatin A (TSA) TFA 是一种有效的,选择性的 HDAC6 抑制剂,IC50 值为 15 nM,对其选择性是 HDAC8 外的其他亚型的 1000 多倍。Tubastatin A TFA 还抑制 HDAC10 和 MBLAC2。

• CAS号：1239262-52-2
• 分子式：C₂₂H₂₂F₃N₃O₄
• 分子量：449.42
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NCGC00247743

NCGC00247743 是一种组蛋白赖氨酸脱甲基酶 KDM4 抑制剂。

• CAS号：1435192-04-3
• 分子式：C₂₄H₂₉N₃O₂
• 分子量：391.51
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

UCN-02

UCN-02 (7-epi-Hydroxystaurosporine) 是一种由链霉菌属 N-126 菌株产生的,选择性的蛋白激酶 C (PKC) 抑制剂,对 PKC 和 PKA 作用的 IC50 值分别为 62 nM 和 250 nM。 UCN-02 对 HeLa S3 细胞具有细胞毒性,能抑制其生长。

• CAS号：121569-61-7
• 分子式：C₂₈H₂₆N₄O₄
• 分子量：482.537
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BET bromodomain inhibitor 2

BET溴代烷抑制剂2是一种有效的BET溴代烷抑制剂,IC50为14.1µM【1】。

• CAS号：2414195-69-8
• 分子式：C₂₃H₃₀N₂O₅S
• 分子量：446.56
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SK-575

SK-575是一种针对PARP1嵌合体(PROTAC)的高效特异性蛋白水解降解剂。SK-575可有效抑制BRCA1/2突变癌细胞的生长。SK-575抑制MDA-MB-436和Capan-1细胞的生长,IC50值分别为19±6 nM和56±12 nM【1】。

• CAS号：2523016-96-6
• 分子式：C₄₇H₅₃FN₈O₈
• 分子量：876.97
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK-3β inhibitor 13

GSK-3β抑制剂13(化合物47)是一种具有血脑通透性的口服活性和强效GSK-3α抑制剂。GSK-3β抑制剂13以分别为0.73 nM和0.35 nM的IC50抑制GSK-3？和GSK-3α。GSK-3β抑制剂13显著降低tau的磷酸化(IC50=58nM),从而导致与阿尔茨海默病相关的神经原纤维缠结的形成[1]。

• CAS号：2227316-74-5
• 分子式：C₂₃H₂₂N₆O₂
• 分子量：414.46
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

桧木醇

Hinokitiol 是从日本扁柏中分离到的挥发油成分,能够降低 Nrf2 的表达,减少 DNMT1 和 UHRF1 的 mRNA 和蛋白的表达,具有抗感染、抗氧化及抗肿瘤等活性。

• CAS号：499-44-5
• 分子式：C₁₀H₁₂O₂
• 分子量：164.201
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：303.4±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：50-52 °C(lit.)
• 闪点：128.1±18.5 °C

CTPB

CTPB 是 p300 组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 的良好活化剂。

• CAS号：586976-24-1
• 分子式：C₃₁H₄₃ClF₃NO₂
• 分子量：554.12700
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

G244-LM

G244-LM是抑制Wnt信号传导的tankyrase 1/2的有效和特异性抑制剂[1]。

• CAS号：1563007-08-8
• 分子式：C₁₈H₂₂N₄O₃S₂
• 分子量：406.522
• 类别：PARP

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

UNC926 hydrochloride

UNC926 hydrochloride 是一种 methyl-lysine (Kme) reader domain 抑制剂,可特异性抑制 L3MBTL1,其 IC50 为 3.9 μM。

• CAS号：1782573-49-2
• 分子式：C₁₆H₂₂BrClN₂O
• 分子量：373.72
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A