表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

米托蒽醌

Mitoxantrone是拓扑异构酶II (topoisomerase II)的抑制剂；也可抑制蛋白激酶C (PKC), IC50值为8.5 μM。

• CAS号：65271-80-9
• 分子式：C₂₂H₂₈N₄O₆
• 分子量：444.481
• 类别：拓扑异构酶

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：805.7±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：170-174ºC
• 闪点：441.1±34.3 °C

Bromodomain inhibitor-10

溴代主抑制剂-10(化合物128)是一种有效的溴代主抑制物,对BRD4-1和BRD4.2的Kds分别为15.0和2500 nM。溴代主抑制剂-10抑制IL12p40的产生[1]。

• CAS号：1870849-58-3
• 分子式：C₂₀H₂₀N₄O₃
• 分子量：364.40
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PKCε (85-92)

PKCε(85-92)是一种生物活性肽。(该肽是e-PKC特异性激活剂,它也激活野生型细胞中的MARCKS磷酸化,对敲除小鼠细胞中的MARCKS磷酸化没有影响。)

• CAS号：207111-98-6
• 分子式：C₃₉H₅₄N₁₀O₁₄
• 分子量：886.90
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK097

GSK097是一种有效且选择性的溴代烷和BET蛋白第二溴代烷(BD2)抑制剂。GSK097对BD2的选择性是BD1的2000倍(BRD4数据),在FaSSIF介质中的溶解度大于1mg/mL[1]。

• CAS号：2159137-02-5
• 分子式：C₁₉H₂₁N₃O₃
• 分子量：339.39
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

伊他替尼

Itacitinib 是一种有效的,选择性的 JAK1 抑制剂,对其选择性是对 JAK2 的 20 多倍,JAK3 和 TYK2 的 100 多倍。

• CAS号：1334298-90-6
• 分子式：C₂₆H₂₃F₄N₉O
• 分子量：553.51400
• 类别：JAK

• 密度：1.57±0.1 g/cm3(Predicted)
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

OSU-2S

非免疫抑制性FTY720类似物,PKCδ激活剂具有较高的抗增殖效力,Huh7,Hep3B和PLC5细胞的IC50分别为2.4,2.4和3.5 uM；相对于FTY720对HCC细胞表现出较高的体外抗增殖功效。在正常肝细胞中没有细胞毒性,虽然缺乏S1P1受体活性；但通过HCC肿瘤细胞中ROS依赖性PKCδ活化诱导胱天蛋白酶依赖性细胞凋亡。

• CAS号：1351056-65-9
• 分子式：C₂₁H₃₇NO₂
• 分子量：335.532
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Rucaparib intermediate

盐酸鲁卡帕里(AG014699)是一种口服活性、有效的PARP蛋白质抑制剂(PARP-1、PARP-2和PARP-3),PARP1的Ki为1.4 nM。盐酸鲁卡帕里是一种适度的己糖-6-磷酸脱氢酶(H6PD)抑制剂。盐酸鲁卡帕利对去势抵抗前列腺癌(CRPC)的研究具有潜力[1][2][3][4]。

• CAS号：773059-19-1
• 分子式：C₁₉H₁₉ClFN₃O
• 分子量：359.82500
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(+)-JQ1 PA

(+)-JQ1 PA 是溴结构域和额外末端结构域 (BET) 抑制剂 JQ1 的衍生物,其 IC50 值为 10.4 nM。

• CAS号：2115701-93-2
• 分子式：C₂₂H₂₀ClN₅OS
• 分子量：437.95
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Momelotinib-3,3,5,5-d6

莫梅洛替尼-3,3,5,5-d6(CYT387-3,3,1,5,4-d6)是氘标记的莫梅洛替尼(HY-10961)。莫莫替尼对JAK1/JAK2具有抑制活性[1][2]。

• CAS号：1619927-67-1
• 分子式：C₂₃H₁₆D₆N₆O₂
• 分子量：420.50
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aurora Kinases-IN-3

Aurora Kinases-IN-3(化合物15a)是一种口服活性AURKB抑制剂,其通过破坏AURKB的有丝分裂定位而不是抑制其在Ser10[1]处的H3磷酸化而引发AURKB抑制活性。

• CAS号：2840558-83-8
• 分子式：C₂₀H₁₆F₃N₃O₄
• 分子量：419.35
• 类别：极光激酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

托法替尼

Tofacitinib是 JAK1/2/3 抑制剂,IC50 分别为1,20 和 112 nM。

• CAS号：477600-75-2
• 分子式：C₁₆H₂₀N₆O
• 分子量：312.370
• 类别：JAK

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：585.8±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：308.1±30.1 °C

GNE-781

GNE-781 是一种高效的选择性 CBP 抑制剂,在 TR-FRET 实验中 IC50 为 0.94 nM。GNE-781 还抑制 BRET 和 BRD4 (1),IC50 分别为 6.2 nM 和 5100 nM。

• CAS号：1936422-33-1
• 分子式：C₂₇H₃₃F₂N₇O₂
• 分子量：525.59
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GNE-272

GNE-272是有效和选择性的 CBP/EP300 溴结构域体内探针,对CBP,EP300 和 BRD4的IC50 值分别为0.02,0.03 和 13 μM。

• CAS号：1936428-93-1
• 分子式：C₂₂H₂₅FN₆O₂
• 分子量：424.47
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-4950834

PF-4950834是一种有效的、选择性的、口服生物利用的ATP竞争性rho激酶抑制剂,对ROCK2和ROCK1的IC50值分别为8.35 nM和33.12 nM。PF-4950834抑制中性粒细胞迁移[1]。

• CAS号：1256264-62-6
• 分子式：C₂₁H₁₉N₃O₂
• 分子量：345.39
• 类别：岩石

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丁福明

Buformin (1-Butylbiguanide) 是一种有效的,具有口服活性的降血糖试剂 (antidiabetic agent),是一种 AMPK 活化剂。Buformin 降低肝糖异生并降低血糖生成。Buformin 也具有抗癌活性,可以应用于癌症研究,如宫颈癌、乳腺癌等。

• CAS号：692-13-7
• 分子式：C₆H₁₅N₅
• 分子量：157.21700
• 类别：AMPK

• 密度：1.22g/cm3
• 沸点：322.7ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：148.9ºC

TX-1123

TX-1123是Src、eEF2-K、PKA和EGFR-K/PKC的有效蛋白酪氨酸激酶(PTK)抑制剂。TX-1123是一种环氧化酶(COX)抑制剂,COX2和COX1的IC50值分别为1.16μM和15.7μM。TX-1123具有低线粒体毒性。TX-1123可用于癌症研究[1][2]。

• CAS号：157397-06-3
• 分子式：C₂₀H₂₄O₃
• 分子量：312.40300
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EPZ031686

EPZ031686是可口服的 SMYD3 抑制剂,IC50 为3 nM。

• CAS号：1808011-22-4
• 分子式：C₂₆H₃₄ClF₃N₄O₄S
• 分子量：591.086
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

J22352

J22352 是一种具有类似靶向嵌合体蛋白水解 (PROTAC) 特性、高度选择性 HDAC6 抑制剂,其 IC50 值为 4.7 nM,J22352 通过抑制胶质母细胞瘤自噬、诱发抗肿瘤免疫反应来促进 HDAC6 降解和诱导抗癌效果,并通过降低 PD-L1 的免疫抑制活性,使宿主抗肿瘤活性恢复。

• CAS号：2252395-44-9
• 分子式：C₂₄H₂₁N₃O₄
• 分子量：415.44
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

恩扎妥林

Enzastaurin 是一种有效的 PKCβ 抑制剂,IC50 值为 6 nM；对其选择性是对 PKCα,PKCγ 和 PKCε 的 6-20 倍。

• CAS号：170364-57-5
• 分子式：C₃₂H₂₉N₅O₂
• 分子量：515.605
• 类别：自噬

• 密度：1.34
• 沸点：767.2±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：249-261℃
• 闪点：417.8±32.9 °C

P300/CBP-IN-3

P300/CBP-IN-3, a p300/CBP 组蛋白乙酰转移酶 (histone acetyltransferase) 抑制剂,化合物 6,来源于专利 WO 2019049061 A1。

• CAS号：2299226-01-8
• 分子式：C₂₄H₂₉N₇O
• 分子量：431.53
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：1.23±0.1 g/cm3(Predicted)
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

1-脱氧鞘氨醇(m18：0)

Spisulosine(ES-285)是一种来源于海洋的抗增殖(抗肿瘤)化合物。Spisulosine通过细胞内神经酰胺积累和PKCζ激活抑制前列腺PC-3和LNCaP细胞的生长【1】。

• CAS号：196497-48-0
• 分子式：C₁₈H₃₉NO
• 分子量：285.50800
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SNIPER(BRD)-1

SNIPER(BRD)-1 由 IAP 拮抗剂 LCL-161 衍生物和 BET 抑制剂 (+)-JQ-1,通过 linker 连接组成。SNIPER(BRD)-1 通过泛素-蛋白酶体系统诱导 BRD4 降解。SNIPER(BRD)-1 也降解 cIAP1,cIAP2 和 XIAP,IC50 分别为 6.8 nM,17 nM 和 49 nM。

• CAS号：2095244-54-3
• 分子式：C₅₃H₆₆ClN₉O₈S₂
• 分子量：1056.73
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

3-(3H-咪唑并[4,5-c]吡啶-2-基)-6-甲基-2H-苯并吡喃-2-酮

JMJD6-IN-1(化合物1-3)是一种JMJD6抑制剂,在10μM时抑制率为82%。JMJD6-IN-1以19.2μM和25.2μM的IC50抑制MCF-7和HCC4006细胞增殖。JMJD6-IN-1可用于癌症研究[1]。

• CAS号：899548-78-8
• 分子式：C₁₆H₁₁N₃O₂
• 分子量：277.28
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Amredobresib

Amredobresib是一种有效的BET抑制剂。Amredobresib可抑制溴代谢物与组蛋白H3和H4上乙酰化赖氨酸的结合,因此是基因转录的重要调节因子。Amredobresib可用于急性髓系白血病(AML)和癌症的研究(摘自专利WO2019145410A1和WO2021175824A1)[1]。

• CAS号：1610044-98-8
• 分子式：C₂₆H₂₉N₉
• 分子量：467.57
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

罗米地辛

Romidepsin 是一种有效的 HDAC1 和 HDAC2 抑制剂,IC50 值分别为 36 nM 和 47 nM。

• CAS号：128517-07-7
• 分子式：C₂₄H₃₆N₄O₆S₂
• 分子量：540.696
• 类别：HDAC

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：942.8±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：219-224°C
• 闪点：524.0±34.3 °C

PRMT5-IN-32

PRMT5-IN-32 是 PRMT5 的抑制剂。PRMT5-IN-32 抑制 HCT116 细胞增殖,其 IC 50 为 0.13 μM。

• CAS号：2918815-34-4
• 分子式：C₂₇H₂₁F₄N₅O₂
• 分子量：523.48
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Lademirsen

Lademirsen(SAR339375；RG-012)是一种靶向miR-21的高度特异性反义寡核苷酸(ASO)。Lademirsen具有进行阿尔波特肾病研究的潜力[1][2]。

• CAS号：1404019-95-9
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：微RNA

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SPV 106

SPV106是组蛋白乙酰化酶(HAT)和GCN5相关的N-乙酰转移酶(GNAT)激活剂。SPV106可用于2型糖尿病(T2D)的研究[1]。

• CAS号：1036939-38-4
• 分子式：C₂₂H₄₀O₄
• 分子量：368.55100
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PARP/PI3K-IN-1

PARP/PI3K-IN-1 (化合物 15) 是一种有效的 PARP/PI3K 抑制剂,对 PARP-1,PARP-2,PI3Kα,PI3Kβ,PI3Kδ 和 PI3Kγ 的 pIC50 值分别为 8.22、8.44、8.25、6.54、8.13、6.08。PARP/PI3K-IN-1 是针对多种肿瘤疾病的高效抗癌化合物。

• CAS号：2337386-47-5
• 分子式：C₃₃H₂₈F₄N₈O₃
• 分子量：660.62
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-06726304

PF-06726304是有效,选择性的 EZH2 抑制剂,Ki 值为0.7 nM。

• CAS号：1616287-82-1
• 分子式：C₂₂H₂₁Cl₂N₃O₃
• 分子量：446.33
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A