表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

JAK3-IN-11

JAK3-IN-11(化合物12)是一种有效的、非细胞毒性的、不可逆的、口服活性的JAK3抑制剂,IC50值为1.7 nM,具有极好的选择性(>588倍于其他JAK亚型),与JAK3中的ATP结合囊共价结合。JAK3-IN-11强烈抑制JAK3依赖性信号传导和T细胞增殖,是研究自身免疫性疾病的一个有希望的工具[1]。

• CAS号：2412734-00-8
• 分子式：C₂₃H₂₃N₅O₂
• 分子量：401.46
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MDL-801

MDL-801 是 SIRT6 去乙酰化的活化剂,EC50 值为 5.7 μM。

• CAS号：2275619-55-9
• 分子式：C₂₀H₁₄BrCl₂FN₂O₆S₂
• 分子量：612.27
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD4 Inhibitor-19

BRD4抑制剂-19是一种BET抑制剂,BRD4-BD1的IC50为55 nM。BRD4抑制剂-19可用于多发性骨髓瘤研究[1]。

• CAS号：2757865-63-5
• 分子式：C₂₉H₂₅N₅O₃
• 分子量：491.54
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK121 (trifluoroacetate salt)

GSK-121三氟乙酸酯是一种选择性PAD4抑制剂[1]。

• CAS号：1652591-80-4
• 分子式：C₂₅H₂₆F₃N₅O₃
• 分子量：501.501
• 类别：癌症

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CCT241736

CCT241736 是一种有效的,可口服的 FLT3 和 Aurora kinase 双重抑制剂,能够有效抑制 Aurora-A (Kd,7.5 nM；IC50,38 nM),Aurora-B (Kd,48 nM),FLT3 (Kd,6.2 nM),以及 FLT3 突变体 FLT3-ITD (Kd,38 nM) 和 FLT3(D835Y) (Kd,14 nM) 的活性。

• CAS号：1402709-93-6
• 分子式：C₂₂H₂₃Cl₂N₇
• 分子量：456.371
• 类别：极光激酶

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Derrone

Derrone是一种异黄酮异丙酚,是一种极光激酶抑制剂,对极光B和极光a的IC50值分别为6和22.3μM。德龙具有抗肿瘤活性[1][2]。

• CAS号：76166-59-1
• 分子式：C₂₀H₁₆O₅
• 分子量：336.34
• 类别：极光激酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：584.1±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：214.6±23.6 °C

Benzyl selenocyanate

Benzyl selenocyanate 是一种化学预防剂,用于动物模型中各种化学诱导肿瘤的启动和启动后阶段。Benzyl selenocyanate 是一种 Mtase 抑制剂,其 IC50 值为 8.4 µM 。

• CAS号：4671-93-6
• 分子式：C₈H₇NSe
• 分子量：196.10800
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：276.7ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：121.2ºC

TAK-632

TAK-632 是一种有效的 pan-RAF 抑制剂,作用于 CRAF,BRAFV600E 和 BRAFWT,IC50 分别为 1.4,2.4 和 8.3 nM。

• CAS号：1228591-30-7
• 分子式：C₂₇H₁₈F₄N₄O₃S
• 分子量：554.515
• 类别：极光激酶

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

牛奶树碱

Hispidin 是一种 PKC 抑制剂,是一种产自 Phellinus linteus 的酚类化合物,具有很强的抗氧化、抗癌、抗糖尿病和抗痴呆作用。

• CAS号：555-55-5
• 分子式：C₁₃H₁₀O₅
• 分子量：246.21500
• 类别：PKC

• 密度：1.657g/cm3
• 沸点：554.2ºC at 760 mmHg
• 熔点：312-315ºC
• 闪点：220.1ºC

SR-0813

SR-0813是一种有效的选择性ENL/AF9酵母结构域抑制剂。SR-0813对ENL叶芝结构域的IC50和EC50值分别为25 nM和205 nM。SR-0813的AF9 YEATS结构域的IC50和EC50值分别为311nm和76nm(CETSA)。SR-0813结合MAP3K19的亲和力(Kd=3.5μM)比ENL-YEATS(Kd=30nm)低100倍以上。SR-0813可用于急性白血病的研究[1]。

• CAS号：2597186-19-9
• 分子式：C₂₅H₃₂N₆O₃S
• 分子量：496.62
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK-J4 hydrochloride

GSK-J4 hydrochloride 是一种有效的 H3K27me3/me2 去甲基化酶 JMJD3/KDM6B 和 UTX/KDM6A 双抑制剂,IC50 分别为 8.6 μM 和 6.6 μM。GSK-J4 hydrochloride 抑制 LPS 诱导的人原代巨噬细胞产生 TNF-α,IC50 值为 9 μM。GSK-J4 hydrochloride 是 GSK-J1 的细胞通透性前药。

• CAS号：1797983-09-5
• 分子式：C₂₄H₂₈ClN₅O₂
• 分子量：453.964
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ABBV-712

ABBV-712 是一种选择性酪氨酸激酶 2 (TYK2) 抑制剂,IC50 为 0.195 μM,在自身免疫性疾病中发挥重要作用。

• CAS号：2368945-27-9
• 分子式：C₂₄H₂₈N₄O₅
• 分子量：452.50
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

5-氨基-2H-异喹啉-1-酮

5-AIQ(5-氨基异喹啉-1-酮)是一种水溶性PARP-1抑制剂。5-AIQ是各种药物中的重要功能基团。5-AIQ可减少肝脏缺血再灌注相关的组织损伤,可用于研究肝脏缺血再灌流相关的治疗条件[1][2]。

• CAS号：93117-08-9
• 分子式：C₉H₈N₂O
• 分子量：160.173
• 类别：PARP

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：477.3±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：242.4±28.7 °C

GSK9311 hydrochloride

GSK9311 hydrochloride 是一种活性较低的 GSK6853 类似物,可用作阴性对照。GSK9311 hydrochloride 抑制 BRPF 溴结构域,对 BRPF1 和 BRPF2 的 pIC50 值分别为 6.0 和 4.3。

• CAS号：2253733-09-2
• 分子式：C₂₄H₃₂ClN₅O₃
• 分子量：474.00
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

I-BET151 dihydrochloride

I-BET151二盐酸盐(GSK1210151A二盐酸盐)是一种BET溴代烷抑制剂,其抑制BRD4、BRD2和BRD3的pIC50分别为6.1、6.3和6.6[1][2]。

• CAS号：1883545-47-8
• 分子式：C₂₃H₂₃Cl₂N₅O₃
• 分子量：488.366
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JGB1741

JGB1741(ILS-JGB-1741)是一种有效的特异性SIRT1活性抑制剂,IC50为∼15μM。JGB1741是一种弱的SIRT2和SIRT3抑制剂,所有IC50>100μM。JGB1741通过调节Bax/Bcl2比率、细胞色素c释放和PARP切割增加乙酰化p53水平,导致p53介导的凋亡。JGB1741具有乳腺癌研究的潜力[1]。

• CAS号：1256375-38-8
• 分子式：C₂₇H₂₄N₂O₂S
• 分子量：440.56
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：700.2±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：377.3±32.9 °C

GSK3326595

GSK3326595是一种有效的,选择性的,可逆的蛋白精氨酸甲基转移酶5 ((PRMT5)) 抑制剂,具有广泛的抗增殖活性。

• CAS号：1616392-22-3
• 分子式：C₂₄H₃₂N₆O₃
• 分子量：452.549
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：760.3±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：413.6±32.9 °C

TCS HDAC6 20b

TCS HDAC6 20b是一种HDAC6选择性抑制剂。TCS HDAC6 20b阻断雌激素受体α阳性乳腺癌MCF-7细胞的生长【1】。

• CAS号：956154-63-5
• 分子式：C₂₆H₄₄N₂O₄S
• 分子量：480.704
• 类别：HDAC

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：631.3±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：335.6±31.5 °C

Pep2m, myristoylated

Pep2m, myristoylated (Myr-Pep2m) 是一种细胞通透性肽。Pep2m, myristoylated (Myr-Pep2m) 能破坏蛋白激酶 ζ (PKMζ) 下游靶点 NSF/GluR2 相互作用。PKMζ 具有自主活性的 PKC 同工酶。

• CAS号：1423381-07-0
• 分子式：C₆₃H₁₁₈N₁₈O₁₄S
• 分子量：1383.788
• 类别：PKC

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NSC 698600

NSC 698600是一种有效的PCAF抑制剂,IC50为6.51µM(PCAF/H31-21)。NSC 698600显示出良好的抑制癌细胞增殖的活性[1]。

• CAS号：908069-17-0
• 分子式：C₁₄H₁₂N₂O₂S
• 分子量：272.32
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ac-Lys-AMC

Ac-Lys-AMC,也称为 MAL,是组蛋白脱乙酰酶 (HDACs) 的荧光底物。

• CAS号：156661-42-6
• 分子式：C₁₈H₂₃N₃O₄
• 分子量：345.39300
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙戊酸

Valproic acid 是一种 HDAC 抑制剂,IC50 值为 0.5-2 mM,抑制 HDAC1 的活性,(IC50,400 μM),同时可诱导 HDAC2 的降解；Valproic acid sodium salt 可用于癫痫、双相情感障碍和偏头痛等的研究。

• CAS号：99-66-1
• 分子式：C₈H₁₆O₂
• 分子量：144.211
• 类别：细胞凋亡

• 密度：0.9±0.1 g/cm3
• 沸点：220.0±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：120 - 130ºC
• 闪点：111.1±0.0 °C

EPZ019997

GSK3368715 dihydrochloride (EPZ019997 dihydrochloride) 是具有口服活性的,可逆的,SAM 非竞争性 I 型蛋白精氨酸甲基转移酶 (PRMTs) 抑制剂 (IC50=3.1 nM (PRMT1), 48 nM (PRMT3), 1148 nM (PRMT4), 5.7 nM (PRMT6), 1.7 nM (PRMT8))。GSK3368715 dihydrochloride (EPZ019997 dihydrochloride) 导致精氨酸甲基化状态的转变,改变了外显子的使用,具有很强的抗癌活性。

• CAS号：1628925-77-8
• 分子式：C₂₀H₄₀Cl₂N₄O₂
• 分子量：439.46
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

UNC0224

UNC0224是G9a抑制剂,IC50为15 nM。

• CAS号：1197196-48-7
• 分子式：C₂₆H₄₃N₇O₂
• 分子量：485.665
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：641.0±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：341.5±34.3 °C

达鲁舍替

Danusertib 是一种极光激酶 (aurora kinase) 抑制剂,能够抑制 Aurora A,Aurora B 和 Aurora C 的活性,IC50 值分别为 13,79 和 61 nM。

• CAS号：827318-97-8
• 分子式：C₂₆H₃₀N₆O₃
• 分子量：474.555
• 类别：自噬

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：664.1±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：355.5±31.5 °C

密执毒素

Mezerein是一种PKC激活剂,具有抗白血病特性。Mezerein抑制表达PKCα(IC50=1190 nM)、PKCβ1(IC50=908 nM)和PKCδ(IC50=141 nM)的酵母的生长,但不抑制表达PKC的酵母的生长[1][2]。

• CAS号：34807-41-5
• 分子式：C₃₈H₃₈O₁₀
• 分子量：654.70200
• 类别：PKC

• 密度：1.43 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：258-262ºC
• 闪点：N/A

二吲哚马来酰亚胺IV

Bisindolylmaleimide IV (Arcyriarubin A) 是一种有效的蛋白激酶 C (PKC) 抑制剂,其 IC50 范围为 0.1-0.55 μM。Bisindolylmaleimide IV 也抑制 PKA (IC50=3.1-11.8 μM)。Bisindolylmaleimide IV 在细胞培养中,是有效的人巨细胞病毒 (HCMV) 复制的抑制剂,IC50为 0.2 μM。

• CAS号：119139-23-0
• 分子式：C₂₀H₁₃N₃O₂
• 分子量：327.336
• 类别：CMV

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：690.1±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：371.2±31.5 °C

DC-CPin711

DC-CPin711是一种高效、选择性的CREB结合蛋白(CBP)溴代多巴胺抑制剂,其IC50为0.0626μM。DC-CPin711将细胞周期阻滞在G1期并诱导凋亡[1]。

• CAS号：2447559-21-7
• 分子式：C₂₃H₂₂N₄O₂
• 分子量：386.45
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

OUL245

OUL245是7-羟基衍生物和选择性PARP2抑制剂(IC50＝44nM)。OUL245还抑制其他PARP和TNKS酶,IC50为2.9-8.8μM[1]。

• CAS号：1023814-45-0
• 分子式：C₈H₅N₃OS
• 分子量：191.21
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

化合物3i(666-15)

666-15是有效选择性的CREB抑制剂,IC50值为81 nM。

• CAS号：1433286-70-4
• 分子式：C₃₃H₃₁Cl₂N₃O₅
• 分子量：620.522
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A