表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

GSK2646264

GSK2646264(化合物44)是一种有效的选择性脾酪氨酸激酶(SYK)抑制剂,pIC50为7.1。GSK2646264还可抑制其他pIC50值分别为5.4、5.4、5.3、5、4.5、<4.6和<4.3的激酶,对抗LCK、LRRK2、GSK3β、JAK2、VEGFR2、Aurora B和Aurora A。GSK2646264可穿透皮肤的表皮和真皮【1】。

• CAS号：1398695-47-0
• 分子式：C₂₄H₂₆N₂O₂
• 分子量：374.48
• 类别：LRRK2

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：517.4±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：266.7±30.1 °C

PROTAC EZH2 Degrader-1

PROTAC EZH2降解剂-1(化合物150d)是一种有效的PROTAC AZH2分解剂,其IC50为2.7nM,对EZH2甲基转移酶活性具有抑制作用。EZH2在许多肿瘤的发生和发展过程中起着重要作用[1]。

• CAS号：2641601-67-2
• 分子式：C₅₄H₆₇N₇O₈
• 分子量：942.15
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

XAV-939

XAV-939是端锚聚合酶 (tankyrase (TNKS)) 抑制剂,也是间接的 Wnt/β-catenin signaling 抑制剂。抑制 TNKS1 和 TNKS2 的 IC50 分别为 5 和 2 nM。

• CAS号：284028-89-3
• 分子式：C₁₄H₁₁F₃N₂OS
• 分子量：312.310
• 类别：PARP

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：429.3ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：213.4ºC

色酚AS-E磷酸盐

KG-501 是 CREB 的抑制剂,其 IC50 值为 6.89 μM。

• CAS号：18228-17-6
• 分子式：C₁₇H₁₃ClNO₅P
• 分子量：377.71600
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.567g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CG347B

CG347B 是一种选择性的 HDAC6 抑制剂。

• CAS号：1598426-03-9
• 分子式：C₁₆H₁₇N₃O₂
• 分子量：283.325
• 类别：HDAC

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：457.2±47.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：230.3±29.3 °C

IQZ23

IQZ23 通过激活 AMPK 信号通路抑制脂肪细胞分化。IQZ23 降低 3T3-L1 脂肪细胞中的甘油三酸酯水平 (EC50=0.033 μM)。IQZ23 可用于肥胖症和相关代谢紊乱的研究。

• CAS号：2415643-79-5
• 分子式：C₂₆H₂₉N₅O₂
• 分子量：443.54
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MOCPAC

MOCPAC是HDAC1特异性底物[1]。

• CAS号：787549-26-2
• 分子式：C₂₇H₃₁N₃O₆
• 分子量：493.55
• 类别：HDAC

• 密度：1.246g/cm3
• 沸点：804.4ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PARP7-probe-1

PARP7-probe-1是化学发光标记的PARP7探针。PARP7-probe-1是与PARP7活性位点结合的生物素化探针。PARP7-probe-1可用于PARP7功能的研究[1]。

• CAS号：2379390-76-6
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK591

EPZ015866是有效,选择性的蛋白质甲基转移酶5 (PRMT5) 抑制剂,IC50 为22 nM。

• CAS号：1616391-87-7
• 分子式：C₂₂H₂₈N₄O₂
• 分子量：380.483
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：648.4±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：345.9±31.5 °C

MS436

MS436 是一种 bromodomain 抑制剂,有效作用于 BRD4 BrD1,Ki 为 30-50 nM,比作用于 BrD2 选择性高 10 倍。

• CAS号：1395084-25-9
• 分子式：C₁₈H₁₇N₅O₃S
• 分子量：383.424
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：673.7±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：361.3±34.3 °C

L-α-羟基戊二酸二钠盐

L-2-Hydroxyglutaric acid disodium 是一种表观遗传修饰因子,可用于肾癌治疗。L-2-Hydroxyglutaric acid disodium 可抑制组蛋白去甲基化酶 (histone demethylases),从而促进组蛋白甲基化。L-2-Hydroxyglutaric acid 抑制线粒体肌酸激酶 (Mi-CK) 活性,Km 和 Ki 分别为 2.52 mM 和11.13 mM。

• CAS号：63512-50-5
• 分子式：C₅H₆Na₂O₅
• 分子量：192.078
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：>300ºC
• 闪点：N/A

MC2590

MC2590是一种有效的含吡啶的组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂。MC2590是HDAC1-3、−6、−8和−10的抑制剂(I/IIb类选择性抑制剂),ic50分别为0.098μM、0.156μM、0.039μM、0.015μM、0.047μM和0.071μM。MC2590还抑制HDAC亚型HDAC4(IC50=2.73μM)、HDAC5(IC50=1.35μM),HDAC7(IC50=20.06μM)和HDAC9(IC50+2.79μM)以及HDAC11(IC50=3.98μM)。MC2625诱导G2/M细胞周期阻滞,并调节促凋亡和抗凋亡微RNA以诱导凋亡[1]。

• CAS号：2284460-01-9
• 分子式：C₂₀H₁₇N₃O₃
• 分子量：347.37
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二甲双胍

Metformin (1,1-Dimethylbiguanide) 抑制肝脏中的线粒体呼吸链,导致 AMPK 活化,增强胰岛素敏感性,可用于 2 型糖尿病的研究。Metformin 可以透过血脑屏障,诱导自噬 (autophagy)。

• CAS号：657-24-9
• 分子式：C₄H₁₁N₅
• 分子量：129.164
• 类别：自噬

• 密度：1.0743
• 沸点：229.23°C
• 熔点：199-200 °C
• 闪点：58.1±22.6 °C

UNC6934

UNC6934是检测NSD2-PWWP1功能的一种有效、选择性的类药物化学探针,Kd为91 nM。UNC6934干扰U2OS细胞中NSD2-PWWP1与H3K36me2核小体的相互作用,这是通过IC50为1.09±0.23微米的NanoBret分析测定的。UNC7145是一种密切相关的对照化合物,由异丙基取代环丙基,通过SPR和NanoBret分析不起作用。

• CAS号：2561494-77-5
• 分子式：C₂₄H₂₁N₅O₄
• 分子量：443.16
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

他泽司他盐酸盐

盐酸他泽米司他(EPZ-6438)是一种强效、选择性和口服活性EZH2抑制剂,EZH2肽和核小体的IC50值分别为11和16 nM。盐酸他泽米司他可用于癌症研究[1]。

• CAS号：1467052-84-1
• 分子式：C₃₄H₄₅ClN₄O₄
• 分子量：609.20
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CEP-8983

CEP-8983 是一种 PARP-1 和 PARP-2 抑制剂 (IC50: 20 和 6 nM) 。CEP-8983 是一种有效的化疗增敏剂,可以使化疗耐药细胞系和皮下异种移植物对 Temozolomide (HY-17364) 和 Camptothecin (HY-16560) 敏感。

• CAS号：374071-46-2
• 分子式：C₁₈H₁₄N₂O₃
• 分子量：306.31500
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TP-472

TP-472是一种新型BRD9/7化学探针,具有优异的效力(BRD9 KD=33nM；ITC BRD7 KD=340nM),选择性比除BRD7外的所有其他溴结构域家族成员高30倍,具有细胞活性(BRD9纳米BRET测定中EC50 320 nM)；具有良好的PK特征,适用于体内应用。

• CAS号：2079895-62-6
• 分子式：C₂₀H₁₉N₃O₂
• 分子量：333.384
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

FKBP12 PROTAC dTAG-7

FKBP12 PROTAC dTAG-7 (dTAG-7) 是一种双功能降解剂。FKBP12 PROTAC dTAG-7 (dTAG-7) 既是一种 FKBP12F36V 的降解剂,又是一种选择性的 BET BRD4 降解剂,FKBP12 PROTAC dTAG-7 (dTAG-7) 通过将 BET 溴结构域桥接至 E3 泛素连接酶 (cereblon; CRBN) 而形成降解剂。

• CAS号：2064175-32-0
• 分子式：C₆₃H₇₉N₅O₁₉
• 分子量：1210.32
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(+)-JQ1

(+)-JQ-1 是一种 BET bromodomain 抑制剂,抑制 BRD4(1/2) 的 IC50 分别为 77 nM 和 33 nM。

• CAS号：1268524-70-4
• 分子式：C₂₃H₂₅ClN₄O₂S
• 分子量：456.988
• 类别：自噬

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：610.4±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：322.9±34.3 °C

邻苯二甲酸二戊酯

Dipentyl phthalate 是一种内分泌干扰性邻苯二甲酸酯增塑剂。Dipentyl phthalate 可增加 AMPK 磷酸化并降低 AKT1 磷酸化和 SIRT1 水平。Dipentyl phthalate 可降低促肾上腺皮质激素水平。Dipentyl phthalate 是一种睾丸毒物。

• CAS号：131-18-0
• 分子式：C₁₈H₂₆O₄
• 分子量：306.40
• 类别：AMPK

• 密度：1.0±0.1 g/cm3
• 沸点：357.0±10.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：-55ºC
• 闪点：188.8±8.5 °C

NN-390

NN-390是一种有效的选择性HDAC6抑制剂,IC50为9.8 nM。NN-390穿透血脑屏障(BBB)。NN-390显示转移组3 MB(髓母细胞瘤)的研究潜力【1】。

• CAS号：2490284-25-6
• 分子式：C₁₇H₁₆F₄N₂O₄S
• 分子量：420.38
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BET-IN-15

BET-IN-15(化合物1)是一种有效的口服活性BET抑制剂,BRD4-BD1、BRD4-BD2的IC50值分别为0.64、0.25nM。BET-IN-15显示出抗增殖活性[1]。

• CAS号：2408994-22-7
• 分子式：C₂₁H₁₈F₂N₄O₃S
• 分子量：444.45
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Resveratrol analog 2

Resveratrol analog 2 是白藜芦醇 (HY-16561) 的类似物 (analog)。白藜芦醇是一种天然的多酚类植物抗毒素,具有抗氧化、抗炎、保护心脏和抗癌的特性。

• CAS号：915378-82-4
• 分子式：C₁₆H₁₃FO₃
• 分子量：272.27
• 类别：自噬

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Butanoic acid-13C1

丁酸-13C1是13C标记的丁酸。丁酸是一种组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂,在几种癌症中具有抗肿瘤作用。

• CAS号：38765-83-2
• 分子式：C₃₁₃CH₈O₂
• 分子量：89.09780
• 类别：HDAC

• 密度：0.975 g/mL at 25ºC
• 沸点：162ºC(lit.)
• 熔点：-6--3ºC(lit.)
• 闪点：170 °F

TH1834 dihydrochloride

TH1834二盐酸盐(TH-1834,TH 1834)是一种新型有效的特异性组蛋白乙酰转移酶Tip60抑制剂；诱导乳腺癌细胞系凋亡,细胞毒性高于星形孢菌素；增加癌细胞系PC-3和DU-145中的γH2AX病灶结合IR；诱导细胞凋亡并增加乳腺未修复的DNA损伤癌细胞。

• CAS号：2108830-09-5
• 分子式：C₃₃H₄₂Cl₂N₆O₃
• 分子量：641.638
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Nesuparib

奈舒巴利是PARP的有效抑制剂。Nesuparib可用于神经病理性疼痛、神经退行性疾病和心血管疾病的研究(摘自专利WO20162000101A2)[1]。

• CAS号：2055357-64-5
• 分子式：C₂₃H₂₄N₆O
• 分子量：400.48
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

β 淀粉样蛋白片段1-40

β-Amyloid (1-40)是阿尔茨海默病患者脑斑块中发现的主要蛋白质。

• CAS号：131438-79-4
• 分子式：C₁₉₄H₂₉₅N₅₃O₅₈S
• 分子量：4329.867
• 类别：多肽产品

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AZ505

AZ505 是一种有效的,具有选择性的 SMYD2 抑制剂,IC50 值为 0.12 μM。

• CAS号：1035227-43-0
• 分子式：C₂₉H₃₈Cl₂N₄O₄
• 分子量：577.54200
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Epigenetic factor-IN-1

Epigenetic factor-IN-1 (40569Z) 是一种表观遗传因子抑制剂。Epigenetic factor-IN-1 对 SIRT7 有很强的结合作用。Epigenetic factor-IN-1 可用于肝癌研究。

• CAS号：2640673-56-7
• 分子式：C₃₂H₃₄FN₅O₆S₂
• 分子量：667.77
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK-5959

GSK-5959是一种有效的, 渗透细胞的选择性BRPF1 Bromodoman抑制剂, IC50为80 nM, 作用于BRPF1比作用于其他35种Bromodoman (包括BRPF2/3和BET家族) 选择性强100多倍。

• CAS号：901245-65-6
• 分子式：C₂₂H₂₆N₄O₃
• 分子量：394.467
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：527.3±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：272.7±30.1 °C