表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

WM-8014

WM-8014 是一种 MOZ (属于 histone acetyltransferases) 的抑制剂,IC50 值为 55 nM。

• CAS号：2055397-18-5
• 分子式：C₂₀H₁₇FN₂O₃S
• 分子量：384.42
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TC-A 2317 hydrochloride

TC-A 2317盐酸盐是一种口服活性极光A激酶抑制剂(Ki=1.2 nM)。TC-A 2317盐酸盐对Aurora B激酶(Ki=101 nM)和其他60种激酶具有优异的选择性,具有良好的细胞通透性和良好的PK谱。抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：1245907-03-2
• 分子式：C₁₉H₂₉ClN₆O
• 分子量：392.92600
• 类别：极光激酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BETd-260

BETd-260 是基于 PROTAC 技术的一种有效的 BET 降解剂,在白血病细胞 RS4;11 中,降低 BRD4 蛋白活性,IC50 值为 30 pM。

• CAS号：2093388-62-4
• 分子式：C₄₃H₄₆N₁₀O₆
• 分子量：798.89
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-CBP1盐酸盐

PF-CBP1盐酸盐是一种CREB结合蛋白溴区的高度选择性抑制剂。

• CAS号：2070014-93-4
• 分子式：C₂₉H₃₆N₄O₃·HCl
• 分子量：525.08
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EB-47 dihydrochloride

EB-47 dihydrochloride 是一种有效的 PARP-1/ARTD-1 选择性抑制剂,IC50 值为 45 nM,对 ARTD5 的IC50 值为 410 nM,表现出温和的效果。EB-47 模拟底物 NAD+,从烟酰胺延伸至腺苷亚区结合。

• CAS号：1190332-25-2
• 分子式：C₂₄H₂₉Cl₂N₉O₆
• 分子量：610.450
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GNA002

GNA002 是一种有效,选择性的 EZH2 抑制剂,对 EZH2 的 IC50 为1.1 μM。GNA002 可以与 EZH2 的特定半胱氨酸残基共价结合,通过控制 E3 连接酶 (CHIP) 的蛋白质量引起 EZH2 泛素化和降解。

• CAS号：1385035-79-9
• 分子式：C₄₂H₅₅NO₈
• 分子量：701.89
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 19

E3 Ligase Ligand-Linker Conjugates 19 由降解决定子和 PROTAC 连接物组成。

• CAS号：1799711-24-2
• 分子式：C₁₉H₂₂N₄O₆
• 分子量：402.4
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

MT 63-78

MT 63-78 是一种有效的直接 AMPK 激活剂,EC50 为 25 μM。M 63-78 还诱导细胞有丝分裂阻滞和细胞凋亡 (apoptosis)。MT 63-78 通过抑制脂肪生成和 mTORC1 途径来阻止前列腺癌的生长。MT 63-78 具有抗肿瘤作用。

• CAS号：1179347-65-9
• 分子式：C₂₁H₁₄N₂O₂
• 分子量：326.35
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HDAC1-IN-4

HDAC1-IN-4(JX34)是一种有效的恶性疟原虫HDAC1抑制剂,具有抗疟活性(IC50<5 nM)和较低的细胞毒性[1]。

• CAS号：2482998-39-8
• 分子式：C₂₁H₂₄BrClN₆O₂
• 分子量：507.81
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ZIKV-IN-2

ZIKV-IN-2(化合物3a)是一种有效的ZIKV NS5甲基转移酶(MTase)抑制剂,IC50值为38.86μM。ZIKV-IN-2抑制ZIKV复制和感染。ZIKV-IN-2可用于寨卡病毒(ZIKV)的研究[1]。

• CAS号：910582-16-0
• 分子式：C₃₉H₄₂O₄
• 分子量：574.75
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

LSD1-IN-13

LSD1-IN-13(化合物7e)是一种口服活性和有效的LSD1抑制剂,IC50为24.43 nM。LSD1-IN-13可激活CD86表达,EC50为470 nM。LSD1-IN-13诱导AML(急性髓系白血病)细胞系分化[1]。

• CAS号：2170212-33-4
• 分子式：C₂₃H₂₉N₃O₂S
• 分子量：411.56
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Inauhzin

Inauhzin 是 SirT1/IMPDH2 的双重抑制剂,同时为 p53 的激活剂,可用于癌症研究。

• CAS号：309271-94-1
• 分子式：C₂₅H₁₉N₅OS₂
• 分子量：469.581
• 类别：MDM-2/p53

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：773.6±70.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：421.7±35.7 °C

FHD-609

FHD-609是BRD9(含溴结构域的蛋白9)的抑制剂和降解剂。FHD-609靶向ncBAF,可用于研究BAF复合物亚基中含有突变的广泛癌症。FHD-609与Telomelysin或INO5401联合可能在肾上腺皮质癌(ACC)治疗中发挥作用[1][2]。

• CAS号：2676211-64-4
• 分子式：C₄₇H₅₆N₈O₆
• 分子量：829.00
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SRTCX1002

SRTCX1002(SRTCX-1002)是SIRT1(STAC)的小分子激活剂,EC1.5为0.4 uM,在细胞p65乙酰化测定中增强细胞p65蛋白的脱乙酰化,IC50为0.84 uM；抑制TNFα诱导的NF-κB转录激活和以SIRT1依赖性方式减少LPS刺激的TNFα分泌。

• CAS号：1203479-63-3
• 分子式：C₂₁H₁₉N₅O₂S
• 分子量：405.473
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

米托蒽醌

Mitoxantrone是拓扑异构酶II (topoisomerase II)的抑制剂；也可抑制蛋白激酶C (PKC), IC50值为8.5 μM。

• CAS号：65271-80-9
• 分子式：C₂₂H₂₈N₄O₆
• 分子量：444.481
• 类别：拓扑异构酶

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：805.7±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：170-174ºC
• 闪点：441.1±34.3 °C

Bromodomain inhibitor-10

溴代主抑制剂-10(化合物128)是一种有效的溴代主抑制物,对BRD4-1和BRD4.2的Kds分别为15.0和2500 nM。溴代主抑制剂-10抑制IL12p40的产生[1]。

• CAS号：1870849-58-3
• 分子式：C₂₀H₂₀N₄O₃
• 分子量：364.40
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

N'-[4-[4-[2-[3-[(二甲基氨基)甲基]苯基]-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基]-1-乙基-1H-吡唑-3-基]苯基]-N,N-二甲基脲

GSK-1070916是有效,选择性,ATP竞争型的极光激酶B/C (aurora B/C) 抑制剂,Ki 值分别为0.38和1.5 nM。

• CAS号：942918-07-2
• 分子式：C₃₀H₃₃N₇O
• 分子量：507.629
• 类别：极光激酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PKCε (85-92)

PKCε(85-92)是一种生物活性肽。(该肽是e-PKC特异性激活剂,它也激活野生型细胞中的MARCKS磷酸化,对敲除小鼠细胞中的MARCKS磷酸化没有影响。)

• CAS号：207111-98-6
• 分子式：C₃₉H₅₄N₁₀O₁₄
• 分子量：886.90
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

GSK097

GSK097是一种有效且选择性的溴代烷和BET蛋白第二溴代烷(BD2)抑制剂。GSK097对BD2的选择性是BD1的2000倍(BRD4数据),在FaSSIF介质中的溶解度大于1mg/mL[1]。

• CAS号：2159137-02-5
• 分子式：C₁₉H₂₁N₃O₃
• 分子量：339.39
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

谷维素

γ-Oryzanol 有效抑制小鼠纹状体中的 DNA 甲基转移酶 (DNMTs)。 抑制 DNMT1 和 DNMT3a,IC50 分别为 3.2 μM 和 22.3 μM。

• CAS号：11042-64-1
• 分子式：C₄₀H₅₈O₄
• 分子量：602.886
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：663.2±40.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：135-137°C
• 闪点：193.8±20.8 °C

二油酸甘油酯

(±)-1,2-二元醇(1,2-二元醇-rac-甘油)是PKC激活剂[1]。

• CAS号：2442-61-7
• 分子式：C₃₉H₇₂O₅
• 分子量：620.99
• 类别：PKC

• 密度：0.9±0.1 g/cm3
• 沸点：670.8±35.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：186.3±19.4 °C

Ainsliadimer C

Ainsliadimer C是一种潜在的SIRT1激活剂,可改善脂肪组织的炎症反应。

• CAS号：1365995-73-8
• 分子式：C₃₀H₃₆O₇
• 分子量：508.60
• 类别：抗衰老酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

伊他替尼

Itacitinib 是一种有效的,选择性的 JAK1 抑制剂,对其选择性是对 JAK2 的 20 多倍,JAK3 和 TYK2 的 100 多倍。

• CAS号：1334298-90-6
• 分子式：C₂₆H₂₃F₄N₉O
• 分子量：553.51400
• 类别：JAK

• 密度：1.57±0.1 g/cm3(Predicted)
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

OSU-2S

非免疫抑制性FTY720类似物,PKCδ激活剂具有较高的抗增殖效力,Huh7,Hep3B和PLC5细胞的IC50分别为2.4,2.4和3.5 uM；相对于FTY720对HCC细胞表现出较高的体外抗增殖功效。在正常肝细胞中没有细胞毒性,虽然缺乏S1P1受体活性；但通过HCC肿瘤细胞中ROS依赖性PKCδ活化诱导胱天蛋白酶依赖性细胞凋亡。

• CAS号：1351056-65-9
• 分子式：C₂₁H₃₇NO₂
• 分子量：335.532
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Rucaparib intermediate

盐酸鲁卡帕里(AG014699)是一种口服活性、有效的PARP蛋白质抑制剂(PARP-1、PARP-2和PARP-3),PARP1的Ki为1.4 nM。盐酸鲁卡帕里是一种适度的己糖-6-磷酸脱氢酶(H6PD)抑制剂。盐酸鲁卡帕利对去势抵抗前列腺癌(CRPC)的研究具有潜力[1][2][3][4]。

• CAS号：773059-19-1
• 分子式：C₁₉H₁₉ClFN₃O
• 分子量：359.82500
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

QL-1200186

QL-1200186 是一种具有口服活性和选择性的 TYK2 抑制剂。口服 QL-1200186 剂量依赖性地抑制 interleukin-12 攻击后 interferon-γ 的产生,并显著改善银屑病小鼠的皮肤病变。

• CAS号：2848664-42-4
• 分子式：C₂₆H₂₇N₇O₃
• 分子量：485.54
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(+)-JQ1 PA

(+)-JQ1 PA 是溴结构域和额外末端结构域 (BET) 抑制剂 JQ1 的衍生物,其 IC50 值为 10.4 nM。

• CAS号：2115701-93-2
• 分子式：C₂₂H₂₀ClN₅OS
• 分子量：437.95
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NSC 65346

Sangivamycin(NSC 65346)是一种核苷类似物,是一种Ki为10μM的蛋白激酶C(PKC)的有效抑制剂。Sangivamycin对多种人类癌症具有有效的抗增殖活性[1][2]。

• CAS号：18417-89-5
• 分子式：C₁₂H₁₅N₅O₅
• 分子量：309.28
• 类别：核苷抗代谢药/类似物

• 密度：N/A
• 沸点：880.6ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：486.4ºC

Momelotinib-3,3,5,5-d6

莫梅洛替尼-3,3,5,5-d6(CYT387-3,3,1,5,4-d6)是氘标记的莫梅洛替尼(HY-10961)。莫莫替尼对JAK1/JAK2具有抑制活性[1][2]。

• CAS号：1619927-67-1
• 分子式：C₂₃H₁₆D₆N₆O₂
• 分子量：420.50
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PKC-theta inhibitor 1

PKC-theta inhibitor 1 是 PKCθ 抑制剂,Ki 值为 6 nM,在体内抑制 IL-2 产生,IC50 为 0.19 μM。PKC-theta inhibitor 1 减轻了多发性硬化小鼠模型中疾病症状。

• CAS号：1160501-81-4
• 分子式：C₁₇H₁₅F₃N₄O
• 分子量：348.32
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A