表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

GSK3326595

GSK3326595是一种有效的,选择性的,可逆的蛋白精氨酸甲基转移酶5 ((PRMT5)) 抑制剂,具有广泛的抗增殖活性。

• CAS号：1616392-22-3
• 分子式：C₂₄H₃₂N₆O₃
• 分子量：452.549
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：760.3±60.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：413.6±32.9 °C

5,7-二羟基色原酮

5,7-Dihydroxychromone 是一种 Cudrania tricuspidata 的提取物,可以激活 Nrf2/ARE 信号并对 6-OHDA 诱导的氧化应激和细胞凋亡发挥神经保护作用。5,7-Dihydroxychromone 抑制 6-OHDA 诱导的 SH-SY5Y 细胞中活化的 caspase-3,caspase-9 以及切割的 PARP 的表达。

• CAS号：31721-94-5
• 分子式：C₉H₆O₄
• 分子量：178.141
• 类别：沙粒

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：399.4±42.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：232-273℃
• 闪点：170.8±21.4 °C

TCS HDAC6 20b

TCS HDAC6 20b是一种HDAC6选择性抑制剂。TCS HDAC6 20b阻断雌激素受体α阳性乳腺癌MCF-7细胞的生长【1】。

• CAS号：956154-63-5
• 分子式：C₂₆H₄₄N₂O₄S
• 分子量：480.704
• 类别：HDAC

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：631.3±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：335.6±31.5 °C

紫花前胡醇当归酸酯

Decursinol angelate 是从 Angelica gigas 根部分离得到的一种细胞毒性物质,是 PKC 激酶的激活剂,拥有抗肿瘤和抗炎活性。

• CAS号：130848-06-5
• 分子式：C₁₉H₂₀O₅
• 分子量：328.359
• 类别：PKC

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：469.4±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：93-94 ºC
• 闪点：206.6±28.8 °C

Pep2m, myristoylated

Pep2m, myristoylated (Myr-Pep2m) 是一种细胞通透性肽。Pep2m, myristoylated (Myr-Pep2m) 能破坏蛋白激酶 ζ (PKMζ) 下游靶点 NSF/GluR2 相互作用。PKMζ 具有自主活性的 PKC 同工酶。

• CAS号：1423381-07-0
• 分子式：C₆₃H₁₁₈N₁₈O₁₄S
• 分子量：1383.788
• 类别：PKC

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NSC 698600

NSC 698600是一种有效的PCAF抑制剂,IC50为6.51µM(PCAF/H31-21)。NSC 698600显示出良好的抑制癌细胞增殖的活性[1]。

• CAS号：908069-17-0
• 分子式：C₁₄H₁₂N₂O₂S
• 分子量：272.32
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ac-Lys-AMC

Ac-Lys-AMC,也称为 MAL,是组蛋白脱乙酰酶 (HDACs) 的荧光底物。

• CAS号：156661-42-6
• 分子式：C₁₈H₂₃N₃O₄
• 分子量：345.39300
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BI-9321 trihydrochloride

BI-9321 trihydrochloride 是一种有效的,选择性的,具有细胞活性的 NSD3-PWWP1 拮抗剂,Kd 值为 166 nM。BI-9321 对 NSD2-PWWP1 和 NSD3-PWWP2 无效。BI-9321 trihydrochloride 在 U2OS 细胞中特异性破坏 NSD3-PWWP1 与组蛋白相互作用,IC50 为 1.2 μM。

• CAS号：2387510-87-2
• 分子式：C₂₂H₂₄Cl₃FN₄
• 分子量：469.81
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK kinase-IN-1

JAK激酶-IN-1(实施例1)是一种JAK抑制剂。JAK激酶-IN-1抑制TYK2、JAK1、JAK2和JAK3,IC50值分别为4.2 nM、32 nM、27 nM和3473 nM[1]。

• CAS号：2698389-43-2
• 分子式：C₁₇H₁₉F₂N₇OS
• 分子量：407.44
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丙戊酸

Valproic acid 是一种 HDAC 抑制剂,IC50 值为 0.5-2 mM,抑制 HDAC1 的活性,(IC50,400 μM),同时可诱导 HDAC2 的降解；Valproic acid sodium salt 可用于癫痫、双相情感障碍和偏头痛等的研究。

• CAS号：99-66-1
• 分子式：C₈H₁₆O₂
• 分子量：144.211
• 类别：细胞凋亡

• 密度：0.9±0.1 g/cm3
• 沸点：220.0±0.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：120 - 130ºC
• 闪点：111.1±0.0 °C

EPZ019997

GSK3368715 dihydrochloride (EPZ019997 dihydrochloride) 是具有口服活性的,可逆的,SAM 非竞争性 I 型蛋白精氨酸甲基转移酶 (PRMTs) 抑制剂 (IC50=3.1 nM (PRMT1), 48 nM (PRMT3), 1148 nM (PRMT4), 5.7 nM (PRMT6), 1.7 nM (PRMT8))。GSK3368715 dihydrochloride (EPZ019997 dihydrochloride) 导致精氨酸甲基化状态的转变,改变了外显子的使用,具有很强的抗癌活性。

• CAS号：1628925-77-8
• 分子式：C₂₀H₄₀Cl₂N₄O₂
• 分子量：439.46
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

(S)-TNG260

(S)-TNG260 是 TNG260 (HY-153358) 的异构体。TNG260 是一种 CoREST 选择性脱乙酰酶 (CoreDAC) 抑制剂。 TNG260 抑制 HDAC1 的选择性是 HDAC3 的 10 倍。 TNG260 导致 HDAC1 抑制,逆转由 STK11 缺失驱动的抗 PD1 耐药性。 TNG260 减少嗜中性粒细胞的瘤内浸润。 TNG260 表现出免疫介导的细胞杀伤。

• CAS号：2935964-93-3
• 分子式：C₂₀H₁₈FN₃O₂S
• 分子量：383.44
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

UNC0224

UNC0224是G9a抑制剂,IC50为15 nM。

• CAS号：1197196-48-7
• 分子式：C₂₆H₄₃N₇O₂
• 分子量：485.665
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：641.0±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：341.5±34.3 °C

达鲁舍替

Danusertib 是一种极光激酶 (aurora kinase) 抑制剂,能够抑制 Aurora A,Aurora B 和 Aurora C 的活性,IC50 值分别为 13,79 和 61 nM。

• CAS号：827318-97-8
• 分子式：C₂₆H₃₀N₆O₃
• 分子量：474.555
• 类别：自噬

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：664.1±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：355.5±31.5 °C

EHMT2-IN-1

EHMT2-IN-1 是一种有效的 EHMT 抑制剂,对 EHMT1 多肽, EHMT2 多肽和细胞内 EHMT2 的 IC50 均小于 100 nM。用于血液疾病或癌症的研究。

• CAS号：2230849-55-3
• 分子式：C₁₈H₂₃N₇O
• 分子量：353.42
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK3/BTK-IN-3

JAK3/BTK-IN-3是一种有效的JAK3/BTK抑制剂。BTK和JAK3是自身免疫性疾病的两个重要靶点。同时抑制BTK/JAK3信号通路显示出协同效应。JAK3/BTK-IN-3具有研究JAK3激酶和/或BTK相关疾病的潜力(摘自专利WO2021147952A1,化合物009)[1]

• CAS号：2674036-98-5
• 分子式：C₂₂H₂₈N₈O
• 分子量：420.51
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

蛋白激酶C(19-36)

Protein Kinase C (19-36) 是蛋白激酶 C (PKC) 的伪底物肽抑制剂,其IC50 值为 0.18 μM。Protein Kinase C (19-36) 有效减缓血管增生和肥大,抑制葡萄糖诱导的利钠肽受体反应。

• CAS号：113731-96-7
• 分子式：C₉₃H₁₅₉N₃₅O₂₄
• 分子量：2151.48
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

密执毒素

Mezerein是一种PKC激活剂,具有抗白血病特性。Mezerein抑制表达PKCα(IC50=1190 nM)、PKCβ1(IC50=908 nM)和PKCδ(IC50=141 nM)的酵母的生长,但不抑制表达PKC的酵母的生长[1][2]。

• CAS号：34807-41-5
• 分子式：C₃₈H₃₈O₁₀
• 分子量：654.70200
• 类别：PKC

• 密度：1.43 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：258-262ºC
• 闪点：N/A

LRRK2-IN-8

LRRK2-IN-8是LRRK2抑制剂。LRRK2-IN-8以低于10nM的IC50抑制LRRK2(wt)和LRRK2)(G2019),并以10-100nM的IC 50抑制TYK2和NUAK1[1]。

• CAS号：2770269-44-6
• 分子式：C₁₆H₁₂F₂N₆
• 分子量：326.30
• 类别：LRRK2

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NSD1 inhibitor BT5

NSD1抑制剂BT5是NSD1组蛋白甲基转移酶的共价小分子抑制剂,IC50为1.4μm,与NSD2无共价结合。

• CAS号：2351225-46-0
• 分子式：C₁₀H₁₁N₃Os
• 分子量：221.278
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

二吲哚马来酰亚胺IV

Bisindolylmaleimide IV (Arcyriarubin A) 是一种有效的蛋白激酶 C (PKC) 抑制剂,其 IC50 范围为 0.1-0.55 μM。Bisindolylmaleimide IV 也抑制 PKA (IC50=3.1-11.8 μM)。Bisindolylmaleimide IV 在细胞培养中,是有效的人巨细胞病毒 (HCMV) 复制的抑制剂,IC50为 0.2 μM。

• CAS号：119139-23-0
• 分子式：C₂₀H₁₃N₃O₂
• 分子量：327.336
• 类别：CMV

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：690.1±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：371.2±31.5 °C

DC-CPin711

DC-CPin711是一种高效、选择性的CREB结合蛋白(CBP)溴代多巴胺抑制剂,其IC50为0.0626μM。DC-CPin711将细胞周期阻滞在G1期并诱导凋亡[1]。

• CAS号：2447559-21-7
• 分子式：C₂₃H₂₂N₄O₂
• 分子量：386.45
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

OUL245

OUL245是7-羟基衍生物和选择性PARP2抑制剂(IC50＝44nM)。OUL245还抑制其他PARP和TNKS酶,IC50为2.9-8.8μM[1]。

• CAS号：1023814-45-0
• 分子式：C₈H₅N₃OS
• 分子量：191.21
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

化合物3i(666-15)

666-15是有效选择性的CREB抑制剂,IC50值为81 nM。

• CAS号：1433286-70-4
• 分子式：C₃₃H₃₁Cl₂N₃O₅
• 分子量：620.522
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRD4770

BRD4770是新型组蛋白甲基转移酶G9a(EHMT2)抑制剂,在PANC-1细胞中EC50值为5uM(三甲基化H3K9)。

• CAS号：1374601-40-7
• 分子式：C₂₅H₂₃N₃O₃
• 分子量：413.468
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Ep300/CREBBP-IN-3

Ep300/CREBP-IN-3(实施例61)是有效的Ep300和CREBBP抑制剂,IC50分别为0.056和0.095μM。Ep300/CREBBP-IN-3可用于癌症研究[1]。

• CAS号：2259641-47-7
• 分子式：C₂₆H₂₅F₄N₅O₃
• 分子量：531.50
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

丁酰肼

Daminozide(DMASA; DIMG; B 995)为植物生长调节剂,能选择性抑制KDM2/7 JmjC亚家族。

• CAS号：1596-84-5
• 分子式：C₆H₁₂N₂O₃
• 分子量：160.171
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：329.5±44.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：162-164 °C(lit.)
• 闪点：153.1±28.4 °C

棕霉素

Streptonigrin (Bruneomycin) 是由链霉菌 (Streptomyces flocculus) 产生的一种天然产物,具有抗肿瘤和抗菌活性。Streptonigrin 可作为 pan-PAD 抑制剂,抑制 PAD1,PAD2,PAD3 和 PAD4 的 IC50 分别为 48.3±34.2 μM,26.1±0.3 μM,0.43±0.03 μM 和 2.5±0.4 μM。

• CAS号：3930-19-6
• 分子式：C₂₅H₂₂N₄O₈
• 分子量：506.46400
• 类别：癌症

• 密度：1.54g/cm3
• 沸点：719ºC at 760mmHg
• 熔点：301-303℃
• 闪点：388.7ºC

UMB-136

一种新的溴结构域BRD4抑制剂,可显着诱导HIV-1再激活；通过促进Tat依赖性转录,在HIV-1潜伏期的多种细胞模型中,在低(2.5 uM)和高(5 uM)剂量下显着逆转HIV-1潜伏期。伸长和Tat-P-TEFb关联；增强PKC激动剂(前列腺素,苔藓抑素-1)在含有潜伏病毒库的CD8耗尽的PBMC中的潜伏期逆转作用。

• CAS号：2109805-83-4
• 分子式：C₂₄H₂₇N₅O₂
• 分子量：417.504
• 类别：HIV

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Psychosine-d7

精神碱-d7是氘标记的精神碱。精神碱是半乳糖苷酶(GALC)的底物,是克拉贝病的潜在生物标志物。精神药物是一种高度细胞毒性的脂质,能够在多种细胞中诱导细胞死亡

• CAS号：2315262-31-6
• 分子式：C₂₄H₄₀D₇NO₇
• 分子量：468.68
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A