表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

Nezulcitinib

奈珠西替尼(TD-0903)是一种吸入和肺选择性泛酸激酶(JAK)抑制剂。奈唑西替尼可用于COVID-19相关的急性肺损伤和氧合受损的研究[1 ]〔2〕。

• CAS号：2412496-23-0
• 分子式：C₃₀H₃₇N₇O₂
• 分子量：527.66
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SD 1008

SD-1008是一种有效的JAK抑制剂。SD-1008抑制STAT3、JAK2和Src的酪氨酸磷酸化。SD-1008还可降低STAT3依赖性荧光素酶活性。SD-1008通过直接阻断JAK-STAT3信号通路增强紫杉醇诱导的卵巢癌细胞凋亡【1】。

• CAS号：960201-81-4
• 分子式：C₁₈H₁₉NO₅
• 分子量：329.35
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Protein Kinase C (530-558)

蛋白激酶C(530-558)是蛋白激酶C的肽片段,是一种有效的PKC激活剂。蛋白激酶C(530-558)显著抑制破骨细胞骨吸收[1]。

• CAS号：122613-29-0
• 分子式：C₁₄₈H₂₂₁N₃₅O₅₀S₂
• 分子量：3354.67000
• 类别：PKC

• 密度：1.4±0.1g/cm3
• 沸点：3001.7±65.0°C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：1769.2±34.3°C

3′-O-Demethyl-4′-N-demethyl-4′-N-acetyl-4′-epi-staurosporine

3′-O-Demethyl-4′-N-demethyl-4′-N-acetyl-4′-epi-staurosporine (Compound 7) 是一种蛋白激酶抑制剂,对 PKC-α、ROCK、ASK1 的 IC50 为 0.092, 0.26, 0.77 μM。3′-O-Demethyl-4′-N-demethyl-4′-N-acetyl-4′-epi-staurosporine 对 PC-3 癌细胞具有有效的细胞毒性,IC50 值为 0.16 μM。

• CAS号：2226941-29-1
• 分子式：C₂₈H₂₄N₄O₄
• 分子量：480.51
• 类别：岩石

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

JAK-IN-15

JAK-IN-15是一种JAK抑制剂。WO2016119700A1(化合物15)[1]。

• CAS号：1973485-05-0
• 分子式：C₂₂H₂₃FN₄O₃S
• 分子量：442.51
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CPTH2 hydrochloride

盐酸CPTH2是一种有效的组蛋白乙酰转移酶(HAT)抑制剂。盐酸CPTH2选择性抑制Gcn5对组蛋白H3的乙酰化。盐酸CPTH2通过抑制乙酰转移酶p300(KAT3B)[1][2]诱导透明细胞肾癌(ccRCC)细胞凋亡并降低其侵袭性。

• CAS号：2108899-91-6
• 分子式：C₁₄H₁₅Cl₂N₃S
• 分子量：328.260
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

巴瑞克替尼

Baricitinib是选择性,可口服的 JAK1 和 JAK2 抑制剂,IC50 分别为5.9 nM 和 5.7 nM。

• CAS号：1187594-09-7
• 分子式：C₁₆H₁₇N₇O₂S
• 分子量：371.417
• 类别：JAK

• 密度：1.6±0.1 g/cm3
• 沸点：707.2±70.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：381.5±35.7 °C

UNC 669

UNC 669是L3MBTL1和L3MBTL3的抑制剂,IC50分别为4.2 uM和3.1 uM。

• CAS号：1314241-44-5
• 分子式：C₁₅H₂₀BrN₃O
• 分子量：338.243
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：1.4±0.1 g/cm3
• 沸点：458.0±45.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：230.8±28.7 °C

HDACs/mTOR抑制剂1

HDACs/mTOR Inhibitor 1 是组蛋白去乙酰酶抑制剂 (HDAC) 和哺乳动物雷帕霉素 (mTOR) 的双重抑制剂,有望用于治疗恶性血液病,其对 HDAC1、HDAC6、mTOR 和 PI3Kα 的IC50 值分别为 0.19 nM、1.8 nM、1.2 nM 和 >500 nM。HDACs/mTOR Inhibitor 1 能够引起G0/G1 期的细胞阻滞,诱导肿瘤细胞凋亡,在体内毒性较低。

• CAS号：2271413-06-8
• 分子式：C₂₈H₃₈N₈O₅
• 分子量：566.65
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

牛心果鹼

Reticuline 分离自 Litsea cubeba,通过 JAK2/STAT3 和 NF-κB 信号通路显示抗炎作用。Reticuline 还可抑制 TNF-α 和 IL-6 的 mRNA 表达,并降低 JAK2 和 STAT3 的磷酸化水平。

• CAS号：485-19-8
• 分子式：C₁₉H₂₃NO₄
• 分子量：329.390
• 类别：JAK

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：504.9±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：125-126ºC
• 闪点：259.2±30.1 °C

11α-丁烯酰基-12β-乙酰基通关藤苷元B

11α-O-Tigloyl-12β-O-acetyltenacigenin B 是 Tenacigenin B (HY-N1168) 的酯衍生物,可从藤黄藤 (MTC) 中分离得到。Tenacigenin B 可调节 Aurora-A 对淋巴瘤具有抗肿瘤作用。

• CAS号：154022-51-2
• 分子式：C₂₈H₄₀O₇
• 分子量：488.61
• 类别：极光激酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Sirt1/2-IN-1

Sirt1/2-IN-1(化合物7)是一种Sirt1和SIRT2抑制剂,对Sirt1、SIRT2和SIRT3的IC50值分别为1.81、2.10和20.5µg/mL。Sirt1/2-IN-1显示出α-微管蛋白的高乙酰化活性,IC50为32.05µg/mL。Sirt1/2-IN-1显示出显著的抗癌活性[1]。

• CAS号：2402779-21-7
• 分子式：C₂₂H₁₃ClN₂OS₂
• 分子量：420.93
• 类别：微管/微管蛋白

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Momelotinib-d8

Momelotinib-d8(CYT387-d8)是氘标记的Momelotnib(HY-10961)。莫美洛替尼(CYT387)是JAK1/JAK2的口服活性和ATP竞争性抑制剂,IC50a分别为11nM和18nM,对JAK3的活性要低得多[1][2]。

• CAS号：1619927-68-2
• 分子式：C₂₃H₁₄D₈N₆O₂
• 分子量：422.51
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Bomedemstat ditosylate

Bomedemstat(IMG-7289)二糖基化物是骨髓增生性肿瘤(MPN)小鼠模型中表观遗传活性赖氨酸特异性去甲基化酶1(LSD1)的口服和不可逆抑制剂。Bomedemstat可用于急性髓细胞白血病(AML)和骨髓纤维化(MF)的研究。抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：1990504-72-7
• 分子式：C₄₂H₅₀FN₇O₈S₂
• 分子量：864.02
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

拟原人参三醇

3β,6α,12β-Dammar-E-20(22)-烯-3,6,12,25-四醇,一种SIRT1激活剂,对SIRT1活性有显著的刺激作用。抗肿瘤活性[1]。

• CAS号：97744-95-1
• 分子式：C₃₀H₅₂O₄
• 分子量：476.732
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.1±0.1 g/cm3
• 沸点：589.8±50.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：240.1±24.7 °C

JAK2-IN-4

JAK2-IN-4 (compound 16h) 是选择性的JAK2/JAK3 的抑制剂,其对JAK2 和JAK3 的IC50 值分别为 0.7 nM 和 23.2 nM。

• CAS号：1438284-00-4
• 分子式：C₂₃H₂₇N₅O₄S
• 分子量：469.56
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

6-[4-(2-哌啶-1-基乙氧基)苯基]-3-吡啶-4-基吡唑并[1,5-A]嘧啶

Dorsomorphin 是一种有效的 ATP 竞争性的选择性 AMPK 抑制剂,Ki 为 109±16 nM。

• CAS号：866405-64-3
• 分子式：C₂₄H₂₅N₅O
• 分子量：399.488
• 类别：自噬

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CL-脒

Cl-amidine 是 PAD 的抑制剂,其对 PAD4 的 IC50 值为 5.9 μM。

• CAS号：913723-61-2
• 分子式：C₁₄H₁₉ClN₄O₂
• 分子量：310.78
• 类别：炎症/免疫

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

pTH-Related Protein (1-40) (human, mouse, rat) trifluoroacetate salt

pTH相关蛋白(1-40)(人、小鼠、大鼠)通过PTHR1受体和PKCα/β信号通路刺激大鼠肠细胞的钙摄取。pTH相关蛋白(1-40)上调甲状旁腺激素1受体(PTHR1)蛋白、四种跨细胞钙转运蛋白、潜在香兰素成员6(TRPV6)、钙结合蛋白D9K(CaBP-D9K)、钠钙交换蛋白1(NCX1)和质膜钙ATP酶1(PMCA1)[1]。

• CAS号：120298-73-9
• 分子式：C₂₀₇H₃₃₄N₆₆O₅₈
• 分子量：
• 类别：PKC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

AT-9283 L-lactate

AT9283 lactic acid 是一种多靶点激酶抑制剂,有效抑制 Aurora A/B,JAK2/3,Abl (T315I),和 Flt3 (IC50 值范围为 1-30 nM)。AT9283 lactic acid 抑制多种实体瘤在体内外的生长和存活。

• CAS号：896466-76-5
• 分子式：C₂₂H₂₉N₇O₅
• 分子量：471.51
• 类别：细胞凋亡

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

NSC 694621

NSC 694621是一种有效的PCAF抑制剂,IC50为5.71µM(PCAF/H31-21)。NSC 694621显示出良好的抑制癌细胞增殖的活性[1]。

• CAS号：104857-29-6
• 分子式：C₁₃H₁₀N₂O₂S
• 分子量：258.30
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

FTX-6058

FTX-6058是一种口服有效的胚胎外胚层发育抑制剂(EED)。FTX-6058可在细胞和小鼠模型中诱导HbF蛋白表达。FTX-6058可用于某些血红蛋白病的研究,包括镰状细胞病和β-地中海贫血[1][2]。

• CAS号：2490676-18-9
• 分子式：C₂₂H₁₈FN₅O₂
• 分子量：403.41
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ARTD10/PARP10-IN-2

ARTD10/PARTP10-IN-2(化合物19)是一种有效的非选择性PARP抑制剂,靶向单ADP核糖转移酶ARTD10/PARP10和聚(ADP核糖)聚合酶-1 ARTD1/PARP1,IC50分别为2.0μM和9.7μM[1]。

• CAS号：1708103-69-8
• 分子式：C₁₂H₁₃N₃O₃
• 分子量：247.25
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CHR-3996

Nanatinostat (CHR-3996) 是一种有效的,有口服活性、I 类选择性的组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 抑制剂,IC50 值为 8 nM。

• CAS号：1256448-47-1
• 分子式：C₂₀H₁₉FN₆O₂
• 分子量：394.40
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BETd-260

BETd-260 是基于 PROTAC 技术的一种有效的 BET 降解剂,在白血病细胞 RS4;11 中,降低 BRD4 蛋白活性,IC50 值为 30 pM。

• CAS号：2093388-62-4
• 分子式：C₄₃H₄₆N₁₀O₆
• 分子量：798.89
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-CBP1盐酸盐

PF-CBP1盐酸盐是一种CREB结合蛋白溴区的高度选择性抑制剂。

• CAS号：2070014-93-4
• 分子式：C₂₉H₃₆N₄O₃·HCl
• 分子量：525.08
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EB-47 dihydrochloride

EB-47 dihydrochloride 是一种有效的 PARP-1/ARTD-1 选择性抑制剂,IC50 值为 45 nM,对 ARTD5 的IC50 值为 410 nM,表现出温和的效果。EB-47 模拟底物 NAD+,从烟酰胺延伸至腺苷亚区结合。

• CAS号：1190332-25-2
• 分子式：C₂₄H₂₉Cl₂N₉O₆
• 分子量：610.450
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ZIKV-IN-2

ZIKV-IN-2(化合物3a)是一种有效的ZIKV NS5甲基转移酶(MTase)抑制剂,IC50值为38.86μM。ZIKV-IN-2抑制ZIKV复制和感染。ZIKV-IN-2可用于寨卡病毒(ZIKV)的研究[1]。

• CAS号：910582-16-0
• 分子式：C₃₉H₄₂O₄
• 分子量：574.75
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

LSD1-IN-13

LSD1-IN-13(化合物7e)是一种口服活性和有效的LSD1抑制剂,IC50为24.43 nM。LSD1-IN-13可激活CD86表达,EC50为470 nM。LSD1-IN-13诱导AML(急性髓系白血病)细胞系分化[1]。

• CAS号：2170212-33-4
• 分子式：C₂₃H₂₉N₃O₂S
• 分子量：411.56
• 类别：组蛋白去甲基化酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Inauhzin

Inauhzin 是 SirT1/IMPDH2 的双重抑制剂,同时为 p53 的激活剂,可用于癌症研究。

• CAS号：309271-94-1
• 分子式：C₂₅H₁₉N₅OS₂
• 分子量：469.581
• 类别：MDM-2/p53

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：773.6±70.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：421.7±35.7 °C