表观遗传学

表观遗传学包括改变基因活性而不改变DNA序列的任何过程，并导致可以传递给子细胞的修饰。已经鉴定了许多类型的表观遗传过程 - 它们包括DNA甲基化，组蛋白结构的改变和小的非编码微小RNA的基因调节。

已经鉴定出许多不同的DNA和组蛋白修饰以确定表观遗传景观。 DNA甲基化主要由DNA甲基转移酶（DNMT）介导，有两种已知类型的DNMT，即DNMT1，其保留细胞复制后预先存在的甲基化模式，和DNMT3A / B，即所谓的“从头”DNMT，其中甲基化以前未甲基化的DNA。组蛋白修饰主要包括乙酰化，甲基化，磷酸化和泛素化。组蛋白的乙酰化可以通过组蛋白乙酰转移酶（HAT）和组蛋白去乙酰转移酶（HDAC）介导，而组蛋白去甲基化通过两类组蛋白去甲基化酶进行：赖氨酸特异性脱甲基酶（LSD）家族蛋白（LSD1和LSD2）和含有组蛋白的JmjC结构域。脱甲基酶（JHDM）。此外，参与表观遗传修饰的酶也可以由miRNA控制。例如，miR-34a可以直接抑制SIRT1的活性以调节胆固醇体内平衡。

累积的证据表明，许多基因，疾病和环境物质是表观遗传学图片的一部分。在FDA，科学家正在研究许多通过表观遗传机制起作用的药物。已经研究了抑制DNA甲基化或组蛋白脱乙酰化的药物用于肿瘤抑制基因的再激活和癌细胞生长的抑制。表观遗传抑制剂也可单独使用或与其他治疗剂组合使用。

参考文献：
[1] Bob Weinhold. Environ Health Perspect. 2006 Mar; 114(3): A160–A167.
[2] Xu W, et al. Genet Epigenet. 2016 Sep 25;8:43-51.
[3] Biswas S, et al. Pharmacol Ther. 2017. doi: 10.1016/j.pharmthera.2017.02.011.
[4] Perri F, et al. Crit Rev Oncol Hematol. 2017 Mar;111:166-172.

RO495

RO495是非受体酪氨酸蛋白激酶2(TYK2激酶)的有效抑制剂【1】。

• CAS号：1258296-60-4
• 分子式：C₁₇H₁₄Cl₂N₆O
• 分子量：389.24
• 类别：JAK

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

鞘丝藻毒素 a

Teleocidin A1(Lyngbytoxin A)是一种剧毒皮肤刺激物,是蛋白激酶C(PKC)的有效激活剂。Teleocidin A1对HeLa癌细胞具有抗增殖活性(IC50=9.2nm)[1][2]。

• CAS号：70497-14-2
• 分子式：C₂₇H₃₉N₃O₂
• 分子量：437.61700
• 类别：PKC

• 密度：1.06 g/cm3
• 沸点：665.1ºC at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：356ºC

罗米地辛

Romidepsin 是一种有效的 HDAC1 和 HDAC2 抑制剂,IC50 值分别为 36 nM 和 47 nM。

• CAS号：128517-07-7
• 分子式：C₂₄H₃₆N₄O₆S₂
• 分子量：540.696
• 类别：HDAC

• 密度：1.2±0.1 g/cm3
• 沸点：942.8±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：219-224°C
• 闪点：524.0±34.3 °C

E1231

E1231(E-1231)是一种小分子SIRT1激活剂,EC50为0.83 uM,与重组人SIRT1蛋白和去乙酰化肝X受体α(LXRα)相互作用；增加RAW 264.7 细胞中ATP结合盒转运蛋白A1(ABCA1)的表达。依赖于SIRT1和LXRα,促进胆固醇外流并抑制脂质积累RAW 264.7 细胞通过SIRT1和ABCA1；降低金仓鼠高脂血症模型中血清和肝脏中的总胆固醇和甘油三酯水平。

• CAS号：1031195-19-3
• 分子式：C₂₁H₂₁N₃O₃
• 分子量：363.410
• 类别：抗衰老酶

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：605.8±55.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：320.2±31.5 °C

PRMT5-IN-32

PRMT5-IN-32 是 PRMT5 的抑制剂。PRMT5-IN-32 抑制 HCT116 细胞增殖,其 IC 50 为 0.13 μM。

• CAS号：2918815-34-4
• 分子式：C₂₇H₂₁F₄N₅O₂
• 分子量：523.48
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Lademirsen

Lademirsen(SAR339375；RG-012)是一种靶向miR-21的高度特异性反义寡核苷酸(ASO)。Lademirsen具有进行阿尔波特肾病研究的潜力[1][2]。

• CAS号：1404019-95-9
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：微RNA

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

OM-153

OM-153是一种有效的tankyrase抑制剂,其对tankyrase 1和tankyrase 2的IC50分别为13和2nm。OM-153显示对COLO 320DM中WNT/β-连环蛋白信号和增殖的抑制[1]。

• CAS号：2406278-81-5
• 分子式：C₂₈H₂₄FN₇O₂
• 分子量：509.53
• 类别：PARP

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

HBDDE

HBDDE,Ellagic acid 的衍生物,是一种同种型选择性 PKCα 和 PKCγ 抑制剂,IC50 值分别为 43 μM 和 50 μM。HBDDE 对 PKCα/PKCγ 的选择性高于同工酶 PKCδ,PKCβI 和 PKCβII 。HBDDE 可诱导神经元凋亡 (apoptosis)。

• CAS号：154675-18-0
• 分子式：C₁₆H₁₈O₈
• 分子量：338.31
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：165-168℃
• 闪点：N/A

SPV 106

SPV106是组蛋白乙酰化酶(HAT)和GCN5相关的N-乙酰转移酶(GNAT)激活剂。SPV106可用于2型糖尿病(T2D)的研究[1]。

• CAS号：1036939-38-4
• 分子式：C₂₂H₄₀O₄
• 分子量：368.55100
• 类别：组蛋白乙酰转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

氯苯氨啶

Metoprine (BW 197U) 是一种有效的组胺 N-甲基转移酶 (HMT) 抑制剂。Metoprine 是一种二氨基嘧啶衍生物,可以透过血脑屏障,并通过抑制 HMT 增加脑组胺水平。Metoprine 是一种抗叶酸 (antifolate) 和抗肿瘤药。

• CAS号：7761-45-7
• 分子式：C₁₁H₁₀Cl₂N₄
• 分子量：269.13000
• 类别：叶酸

• 密度：1.447g/cm3
• 沸点：483.7ºC at 760 mmHg
• 熔点：275-276ºC
• 闪点：246.3ºC

PARP/PI3K-IN-1

PARP/PI3K-IN-1 (化合物 15) 是一种有效的 PARP/PI3K 抑制剂,对 PARP-1,PARP-2,PI3Kα,PI3Kβ,PI3Kδ 和 PI3Kγ 的 pIC50 值分别为 8.22、8.44、8.25、6.54、8.13、6.08。PARP/PI3K-IN-1 是针对多种肿瘤疾病的高效抗癌化合物。

• CAS号：2337386-47-5
• 分子式：C₃₃H₂₈F₄N₈O₃
• 分子量：660.62
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

DC-BPi-11

DC-BPi-11是溴结构域PHD指转录因子(BPTF)的抑制剂,IC50值为698nM。DC-BPi-11显示出对白血病细胞增殖的显著抑制[1]。

• CAS号：2758411-61-7
• 分子式：C₂₀H₂₃N₅O₂S
• 分子量：397.49
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

LB-205

一种Zn2+依赖的I类和II类HDAC泛抑制剂,体内半衰期长(12h)；显着增强星形胶质细胞的迁移,比SAHA和VPA更有效地加速伤口修复；上调NGF的表达,磷酸化TrkA,p-AKT,NF-κB和Bcl-2,同时下调p75 NTR的表达,磷酸化JNK和Bax。

• CAS号：1113025-86-7
• 分子式：C₁₈H₂₁N₃O₂S
• 分子量：343.445
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PF-06726304

PF-06726304是有效,选择性的 EZH2 抑制剂,Ki 值为0.7 nM。

• CAS号：1616287-82-1
• 分子式：C₂₂H₂₁Cl₂N₃O₃
• 分子量：446.33
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4 Degrader-21

PROTAC BRD4降解器-21(Comp 74)是BRD4的PROTAC降解器。PROTAC BRD4降解器-21在小鼠荷瘤异种移植物模型中显示出显著的肿瘤生长抑制作用,可用于抗癌研究[1]。

• CAS号：2503036-46-0
• 分子式：C₄₇H₅₄Cl₂N₁₀O₄S
• 分子量：925.97
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

KR-39038

KR-39038是一种口服有效的GRK5(G蛋白偶联受体激酶5)抑制剂,IC50为0.02μM。KR-39038通过抑制新生儿心肌细胞中的HDAC5途径显著抑制血管紧张素II诱导的细胞肥大。KR-39038显示出深刻的抗肥大作用和改善心功能。KR-39038可用于心力衰竭研究[1]。

• CAS号：2770300-35-9
• 分子式：C₂₄H₃₂ClFN₆O
• 分子量：475.00
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Aviculin

Aviculin是一种木脂素糖苷,是一种有效的抗癌剂。Aviculin将MCF-7细胞的代谢活性降低到50%以下,IC50为75.47μM。Aviculin通过内在凋亡途径诱导乳腺癌细胞凋亡。Aviculin增加启动子caspase-9、执行子caspase-7和聚(ADP核糖)聚合酶(PARP)的表达。Aviculin显示Bax/Bcl-2比率增加[1]。

• CAS号：156765-33-2
• 分子式：C₂₆H₃₄O₁₀
• 分子量：506.54
• 类别：细胞凋亡

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CeMMEC2

CeMMEC2是一种新型有效的BRD4抑制剂,IC50为0.9 uM,与BRD4的两个溴结构域结合,与(S)-JQ1相当。

• CAS号：902955-25-3
• 分子式：C₁₄H₁₉N₅
• 分子量：257.334
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.3±0.1 g/cm3
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

BRM/BRG1 ATP Inhibitor-3

BRM/BRG1 ATP抑制剂-3是一种BRG1/BRM抑制剂。BRM/BRG1 ATP抑制剂-3分别以10.4nM和19.3nM的IC50值抑制BRM和BRG1。BRM/BRG1 ATP抑制剂-3可用于癌症和BAF复合物相关疾病的研究[1]。

• CAS号：2368901-31-7
• 分子式：C₂₆H₂₅N₅O₂S₂
• 分子量：503.64
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BET Degrader-1

PROTAC BET Degrader-1 是基于 PROTAC 技术的 BET 降解剂,能够在低浓度下降低 BRD2,BRD3 和 BRD4 的蛋白水平。

• CAS号：2093386-22-0
• 分子式：C₄₄H₄₅N₁₁O₉
• 分子量：871.9
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

TCJL37

TCJL37 是一种有效的,具有口服活性的选择性 TYK2 抑制剂,Ki 为 1.6 nM。TCJL37 可用于炎症性肠病 (IBD) 的研究。

• CAS号：1258294-34-6
• 分子式：C₁₇H₁₁ClF₂N₄O₂
• 分子量：376.74
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

PROTAC BRD4-binding moiety 1

PROTAC BRD4-binding moiety 1 是 BRD4 的配体。PROTAC BRD4-binding moiety 1 通过 linker 结合到 cereblon 配体上形成 PROTAC 以降解 BRD4 (HY-133136)。

• CAS号：2101200-10-4
• 分子式：C₂₃H₂₁N₃O₂
• 分子量：371.43
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EX229

EX229 是一个苯并咪唑的衍生物,是 AMP 活化蛋白激酶 (AMPK) 的有效变构激动剂,其对 α1β1γ1、α2β1γ1 和 α1β2γ1 的 Kd 值分别为 0.06 μM、0.06 μM 和 0.51 μM。

• CAS号：1219739-36-2
• 分子式：C₂₄H₁₈ClN₃O₃
• 分子量：431.87
• 类别：AMPK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

EcoRI 甲基转移酶

EcoRI Methyltransferase 是一种细菌序列特异性 S-腺苷-L-甲硫氨酸依赖性 DNA 甲基转移酶。EcoRI Methyltransferase 依靠复杂的构象机制来实现其卓越的特异性,包括 DNA 弯曲、碱基翻转和插入 DNA。

• CAS号：81458-00-6
• 分子式：
• 分子量：
• 类别：DNA甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

RTS-V5

RTS-V5是HDAC/蛋白酶体的抑制剂,对HDAC1,HDAC2,HDAC3,HDAC6,HDAC8的IC50分别为6.9,18,15,0.27,0.53 μM。

• CAS号：2285346-31-6
• 分子式：C₂₇H₃₅N₅O₆
• 分子量：525.60
• 类别：HDAC

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

SMYD2-IN-1

SMYD2-IN-1 是一种有效的 SMYD2 抑制剂,IC50 为 4.45 nM,详细信息请参考专利文献 WO2016166186A1 中的化合物 Example 1.1。

• CAS号：2023788-96-5
• 分子式：C₂₅H₂₅Cl₂F₂N₇O₂
• 分子量：564.41
• 类别：组蛋白甲基转移酶

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

ZL0580

ZL0580 是ZL0590 的结构类似物,通过选择性的结合到 BD1 的 BRD4 结构域来诱导 HIV 的表观抑制。ZL0580通过抑制 Tat 转录激活和转录延长以及在 HIV 启动子上诱导抑制染色质结构来诱导 HIV 的抑制。

• CAS号：2377151-10-3
• 分子式：C₂₅H₂₃F₃N₄O₄S
• 分子量：532.53
• 类别：HIV

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

Momelotinib-3,3,5,5-d4

莫梅洛替尼-3,3,5,5-d4(CYT387-3,3,1,5,4-d4)是氘标记的莫梅洛替尼(HY-10961)。莫莫替尼对JAK1/JAK2具有抑制活性[1][2]。

• CAS号：1619927-66-0
• 分子式：C₂₃H₁₈D₄N₆O₂
• 分子量：418.48
• 类别：JAK

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A

CPI-203

CPI-203 是一种有效的,选择性的,细胞通透的 BET bromodomain 抑制剂,抑制 BRD4,IC50 值约为 37 nM。

• CAS号：1446144-04-2
• 分子式：C₁₉H₁₈ClN₅OS
• 分子量：399.897
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：1.5±0.1 g/cm3
• 沸点：690.5±65.0 °C at 760 mmHg
• 熔点：N/A
• 闪点：371.4±34.3 °C

PI3K/Akt/CREB activator 1

PI3K/Akt/CREB激活剂1(化合物AE-18)是一种有效的口服活性PI3K/Akt/CREB激活物。PI3K/Akt/CREB激活剂1促进神经元增殖,诱导神经-2a细胞分化为神经元样形态,并通过PI3K/Akt/CREB途径上调脑源性神经营养因子,加速原代海马神经元轴突树突极化的建立。PI3K/Akt/CREB激活剂1可用于血管性痴呆(VaD)的研究[1]。

• CAS号：2708177-73-3
• 分子式：C₁₉H₁₅F₄NO₃
• 分子量：381.32
• 类别：表观遗传读者域

• 密度：N/A
• 沸点：N/A
• 熔点：N/A
• 闪点：N/A